Памирские кыргызы, те, которые живут в РТ, конечно же испытывают процессы ассимиляции. Китайские, насколько я понял и знаю, очень хорошо сохраняют свою идентичность, традиции. Ассимиляция идет в контакте с другими тюркскими народами - уйгурами, казахами. Примечательно, что дети от смешанных браков с уйгурами "получают" национальность матери. Предположу, что китайские кыргызы сохранят свою идентичность. С южными алтайцами есть одна проблема — этноним. Есть вроде сеок "кыргыз", однако южные алтайцы не именуют себя "кыргызами". О чем это говорит? Была некая этническая общность, в которой шло смешение разных этнических компонентов, главные из которых это ен. кыргызский и кимако-кыпчакский. Из этой общности вышли кыргызы и южн. алтайцы, причем первые сохранили этноним, вторые не сохранили, или вообще не принимали его, просто находясь в едином культурно-историческом пространстве.