1. Вы сравнивали аутосомы 12-13 веков и современных? Если аутосомная разница есть между казахами, ногайцами, каракалпаками и кыргызами, то между разными группами монголов то же она будет. Калмыки будут отличаться так же от Бурятов, Халха и Чахаров, а также каждая из этих трех групп будет отличаться (насколько не понятно) и от предковой популяции 12-13 века
Так что 100 % идентичность это из разряда идеологических мифов а не научных фактов.