то, что казахи, каракалпаки, кыргызы в целом как популяции относятся к туранидной расе не значит что двое произошли от третьего. это говорит лишь о генетическом родстве. конечно, внутри уже сами казахи, каракалпаки, кыргызы немного отличаются и образуют суб-группу внутри туранидов: казахскую, кыргызскую и каракалпакскую. если копать глубже то можно дойти до групп в отдельных поселках, половина жителей которой являются потомками мужчины, жившего сто пятьдесят лет назад. тем более вы сами подтверждаете, что смешанные браки с казахами распространены. тогда уж тем более. лично я не удивлюсь если южные групппы каракалпаков будут более европеоидные (из-за контактов с туркменами, хорезмскими узбеками), а северные более монголоидными (из-за контактов с казахами, калмыками)