Казахский ДНК-проект

[кылышбай]

В 01.08.2024 в 21:27, Zerek сказал:

Где нет, в Китае? А хазарейцы есть?

В 01.08.2024 в 19:41, boranbai_bi сказал:

просто там нет каракалпаков, ногайцев и видимо по какой то причине не учли кыргызов

Если в выборку добавить казахов из др. регионов то точка с усредненными казахами переместится ближе к ногайцам, кыргызам и др. народам. По аутосомам ближе всего к казахам кыргызы и каракалпаки, а также алтайцы, уйгуры и хазарейцы

[boranbai_bi]

В 04.08.2024 в 13:50, olley сказал:

Читал статью Юсунбаева по народам Кавказа, в которой авторы сделали анализ по всему геному. В анализе были представлены ногайцы в количестве 15 человек, а также узбеки, туркмены и таджики. Ногайцы в общем кластером тяготели к народам Северного и Северо-Восточного Кавказа. Возможно выборка была сделана таким образом. Статья Юсунбаева и соавторов 2012 года. Может, появились новые статьи, в которых представлены народы Центральной Азии? У меня есть предположение, что кыргызы, казахи, каракалпаки и южные алтайцы — генетически схожие народы. Многие узбеки и уйгуры могут оказаться генетически похожими на своих соседей. Такой большой народ, как узбеки, до сих пор плохо протестированные. Это также касается туркменов и уйгуров.

Статья: https://academic.oup.com/mbe/article/29/1/359/1750206

 

Если новая статье по народам центральной Азии, то прошу поделиться ссылкой/

работу по аутосомам про ногайцев и казахов я не нашел

у Сабитова есть работа по Y гаплогруппам ногайцев

https://www.academia.edu/17004570/Сабитов_Ж_М_Баймуханов_Н_Б_Y_STR_гаплотипы_узбеков_уйгуров_таджиков_пуштунов_хазарейцев_моголов_из_базы_данных_Family_Tree_DNA_The_Russian_Journal_of_Genetic_Genealogy_Volume_7_No_2_2015_C_20_26

[boranbai_bi]

В 04.08.2024 в 11:29, кылышбай сказал:

Если в выборку добавить казахов из др. регионов то точка с усредненными казахами переместится ближе к ногайцам, кыргызам и др. народам. По аутосомам ближе всего к казахам кыргызы и каракалпаки, а также алтайцы, уйгуры и хазарейцы

есть ли работы сравнивающие аутосомы казахов и ногайцев?

внешне на нас похожи дагестанские и астраханские но хотелось бы посмотреть цифры

[asan-kaygy]

Была статья по Ботаю, где аутосомно две группы ногайцев показывались

[Jagalbay]

В 04.08.2024 в 23:50, olley сказал:

Читал статью Юсунбаева по народам Кавказа, в которой авторы сделали анализ по всему геному. В анализе были представлены ногайцы в количестве 15 человек, а также узбеки, туркмены и таджики. Ногайцы в общем кластером тяготели к народам Северного и Северо-Восточного Кавказа. Возможно выборка была сделана таким образом. Статья Юсунбаева и соавторов 2012 года. Может, появились новые статьи, в которых представлены народы Центральной Азии? У меня есть предположение, что кыргызы, казахи, каракалпаки и южные алтайцы — генетически схожие народы. Многие узбеки и уйгуры могут оказаться генетически похожими на своих соседей. Такой большой народ, как узбеки, до сих пор плохо протестированные. Это также касается туркменов и уйгуров.

Статья: https://academic.oup.com/mbe/article/29/1/359/1750206

 

Если новая статье по народам центральной Азии, то прошу поделиться ссылкой/

ногайцы отличаются, одни ногайцы ближе к казахам, чем к другим ногайцам

[Zerek]

В 31.07.2024 в 06:49, asan-kaygy сказал:

Я  думаю эффект основателя и смешение мужчин и женщин немного разное видимо

Может ли быть так, что "монгольские" гаплогруппы присутствовали в Казахстане еще до времен ЧХ?

[asan-kaygy]

6 часов назад, Zerek сказал:

Может ли быть так, что "монгольские" гаплогруппы присутствовали в Казахстане еще до времен ЧХ?

термин "монгольские гаплогруппы" это бред

[Zerek]

2 часа назад, asan-kaygy сказал:

термин "монгольские гаплогруппы" это бред

Поэтому я и заключил слово монгольские в кавычки

[asan-kaygy]

Лучше вообще этот термин не использовать

[Kazakh]

В 06.08.2024 в 03:30, boranbai_bi сказал:

есть ли работы сравнивающие аутосомы казахов и ногайцев?

внешне на нас похожи дагестанские и астраханские но хотелось бы посмотреть цифры

Юнусбаевские образцы есть у Диенекиса. https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Me2vweYJN2mNtnDaypabv31sy2-kSWVhNJvanIsWtJU/edit?gid=0#gid=0

Калькулятор по 7 компонентам. Монголоидные компоненты 25% всего.

Population

Source

N

South_Asian

West_Asian

Siberian

African

Southern

Atlantic_Baltic

East_Asian

Nogais_Y

Yunusbayev

14

0.7

36.7

14.8

0

13.1

25.3

9.3

 

Калькулятор по 12 компонентам. https://docs.google.com/spreadsheets/d/1GWhNZcfTQ2hMSK9Ni1IqG7aXHB00SRE5L6ED2osPs9M/edit?gid=0#gid=0

Population

Source

N

Gedrosia

Siberian

Northwest_African

Southeast_Asian

Atlantic_Med

North_European

South_Asian

East_African

Southwest_Asian

East_Asian

Caucasus

Sub_Saharan

Nogais_Y

Yunusbayev

14

12.9

11.4

0

0.5

4.5

21.3

0.7

0

0.1

11.5

37.3

0

 

Мой результат в этих калькуляторах. Восточных генов в районе 59%.

ID

South_Asian

West_Asian

Siberian

African

Southern

Atlantic_Baltic

East_Asian

DOD865

5.9

13.3

36.9

0

2.8

18.6

22.4

 

ID

Gedrosia

Siberian

Northwest_African

Southeast_Asian

Atlantic_Med

North_European

South_Asian

East_African

Southwest_Asian

East_Asian

Caucasus

Sub_Saharan

DOD865

7.9

26.4

0

1.1

2

17.3

4.4

0

2.7

32.1

6.2

0

[Kazakh]

 

В 06.08.2024 в 03:30, boranbai_bi сказал:

есть ли работы сравнивающие аутосомы казахов и ногайцев?

внешне на нас похожи дагестанские и астраханские но хотелось бы посмотреть цифры

На ресурсе Genoplot нашел астраханских и других ногаев. И в правду на PCA плотах астраханские вместе со ставропольскими близко расположились с казахами Казахстана и чуть дальше от китайских казахов.

Зеленые в районе 15 образцев, кажется это Юнусбаевские образцы. Они с карачаево-черкессами в одном кластере.

https://genoplot.com/shared/pca/?share=Sakenkz118/191313aac96#1

[Zerek]

6 часов назад, asan-kaygy сказал:

Лучше вообще этот термин не использовать

Субклады гаплогрупы С, обычно ассоциируемые с движением монгольских племен в Среднюю Азию при Чингис-хане могли ли на самом деле быть местными, появившимися в Средней Азии в том же 8-9 веке?

[Kazakh]

В калькуляторе Dodecad K12b эти группы ногайцев ниже.

Sample	Gedrosia	Siberian	Northwest African	Southeast Asian	Atlantic Med	North European	South Asian	East African	Southwest Asian	East Asian	Caucasus	Sub Saharan
Nogai	12.87	10.67	0.28	0.72	4.55	22.07	0.59	0	0.66	11.9	35.68	0
Nogai Astrakhan	7.16	23.65	0.43	2.79	8.1	17.77	1.17	0.01	1.95	27.43	9.5	0.04
Nogai Karachay Cherkessia	13.08	10.9	0.23	1.14	3.84	20.54	0.51	0.16	0.71	12.88	35.94	0.07
Nogai Stavropol	10.77	20.07	0.17	2.25	7.03	17.51	2.11	0.03	1.67	24.76	13.64	0

[Kazakh]

Казахи

Sample	Gedrosia	Siberian	Northwest African	Southeast Asian	Atlantic Med	North European	South Asian	East African	Southwest Asian	East Asian	Caucasus	Sub Saharan
Kazakh	8.09	25.69	0.19	3.17	4.9	15.31	1.78	0.01	0.82	31.81	8.23	0
Kazakh China	7.44	27.14	0.1	5.9	2.31	11.06	1.99	0.1	0.49	38.05	5.25	0.18

[Kazakh]

Каракалпаки

Sample	Gedrosia	Siberian	Northwest African	Southeast Asian	Atlantic Med	North European	South Asian	East African	Southwest Asian	East Asian	Caucasus	Sub Saharan
Karakalpak	10.16	22.15	0.07	3.26	5.3	16.4	2.86	0.1	1.63	27.2	10.87	0

[Kazakh]

37 минут назад, olley сказал:

По другим популяциям есть? Уйгуры, кыргызы, туркмены, узбеки, алтайцы, башкиры. Я PCA график построю.

Да, есть по этой ссылке https://genoplot.com/calculators

Sample	Gedrosia	Siberian	Northwest African	Southeast Asian	Atlantic Med	North European	South Asian	East African	Southwest Asian	East Asian	Caucasus	Sub Saharan
Uygur	16.5	15.1	0.05	4.59	2.23	13.12	5	0.01	1.81	30.48	11.09	0

Sample	Gedrosia	Siberian	Northwest African	Southeast Asian	Atlantic Med	North European	South Asian	East African	Southwest Asian	East Asian	Caucasus	Sub Saharan
Kirghiz	8.37	27.17	0.12	3.84	2.77	11.38	2.39	0.02	0.79	35.9	7.25	0.03
Tajik Kirghiz	8.98	24.36	0.1	4.55	3.39	12.46	2.35	0.05	0.18	35.37	8.22	0

Sample	Gedrosia	Siberian	Northwest African	Southeast Asian	Atlantic Med	North European	South Asian	East African	Southwest Asian	East Asian	Caucasus	Sub Saharan
Afghan Uzbek	28.38	6.95	0.08	1	4.29	12.04	11.66	0.09	5.37	11.74	18.39	0
Jewish Uzbekistan	11.19	0.46	0.01	0.63	3.95	3.56	0.78	0	10.6	0	68.68	0.19
Uzbek	17.7	15.62	0.18	1.34	3.86	15.88	5.42	0.11	2.53	20.41	16.93	0.02
Uzbek Turkmen	19.58	13.1	0.18	2.02	6.6	12.91	5.14	0.07	6.46	14.09	19.77	0.09

Sample	Gedrosia	Siberian	Northwest African	Southeast Asian	Atlantic Med	North European	South Asian	East African	Southwest Asian	East Asian	Caucasus	Sub Saharan
Afghan Turkmen	19.4	15.28	0.28	0.96	5.79	14.44	5.34	0.28	3.39	15.67	19.17	0
Turkmen	26.62	7.21	0.63	2.07	4.8	10.85	5.67	0.13	6.9	7.82	27.21	0.1
Uzbek Turkmen	19.58	13.1	0.18	2.02	6.6	12.91	5.14	0.07	6.46	14.09	19.77	0.09

Sample	Gedrosia	Siberian	Northwest African	Southeast Asian	Atlantic Med	North European	South Asian	East African	Southwest Asian	East Asian	Caucasus	Sub Saharan
Altaian	9.49	30.12	0.14	1.48	4.77	22.31	1.97	0.03	0.04	26.14	3.5	0.02
Altaian Chelkan	12.59	30.35	0.21	1.62	3.97	24.99	1.48	0.07	0	22.35	2	0.36

Sample	Gedrosia	Siberian	Northwest African	Southeast Asian	Atlantic Med	North European	South Asian	East African	Southwest Asian	East Asian	Caucasus	Sub Saharan
Bashkir	10.32	23.64	0.1	1.25	8.41	30.78	1.67	0.1	0.36	15.43	7.95	0.01

[Kazakh]

2 часа назад, olley сказал:

Если хотите , то я ваши данные помещу на график из Dodecad K12b.

давайте:) спасибо

[Kamal]

40 минут назад, olley сказал:

Согласно данным из Dodecad K12b

 

Ногайцы Астрахани, ногайцы Ставрополья и каракалпаки генетически близки .

 

 

У Иванова П.П. есть сведения от своих астраханских коллег о том, что в начале 20 века Астраханские ногайцы называли себя каракалпаками и, думаю, они же попали в книгу Реклю в 19 веке в составе 300 тысяч российских каракалпаков, проживавших на тот момент в составе РИ от Сибири до Кавказа, в общем, тут всё понятно. Но, ничего не слышал о Ставропольских ногайцах-каракалпаках, тем не менее есть информация по поводу моего рода Колдаулы: - как у Ставропольских туркменов, так и у Ставропольских ногайцев не только мой род зафиксирован, а ещё есть Казаяклы, Мамат и другие распространенные у современных каракалпаков рода, поэтому, думаю, генетическая близость никак не оспаривается. Только непонятно, в данном наборе присутствуют данные тех 50 каракалпаков или с других работ тоже есть представители?!

[Kazakh]

9 минут назад, olley сказал:

Так данные ваши нужны из калькулятора Dodecad K12b или откуда их берут загружая сырые данные.

D

Gedrosia

Siberian

Northwest_African

Southeast_Asian

Atlantic_Med

North_European

South_Asian

East_African

Southwest_Asian

East_Asian

Caucasus

Sub_Saharan

DOD865

7.9

26.4

0

1.1

2

17.3

4.4

0

2.7

32.1

6.2

0

[Kamal]

1 час назад, olley сказал:

Я не могу знать, откуда взята выборка каракалпаков из Астрахани и Ставрополья, которые генетически схожи с каракалпаками. Кто-то опубликовал исследование и поделился данными генома через базу данных. Если мне не изменяет память, проект Dodecad ведет грек (?)по имени Диенекес Понтикос. Я взял обработанные данные в программном обеспечении ADMIXTURE у Диенекеса. 

Есть и другие образцы ногайцев из Кабардино-Балкарии или Карачаево-Черкессии. Юнусбаев опубликовал данные 16 ногайцев, и эти ногайцы очень генетически схожи с народами Северного Кавказа, в частности с балкарцами. 

Вообще-то, сейчас в Астрахани и Ставрополе нет каракалпаков, они перевелись под местное название. А про Кавказ тоже понятно, в Ногайскую орду (в Центр) были включены не только степные кочевники, но и коренные кавказцы. Как говорится, благоденствие или благополучный Центр - втягивает всех в округе, а при его разрушении - все сами по себе. Если конкретно, то кавказские ногайцы изначально были кавказцами, поэтому не надо на них напирать, мол, кочевники восприняли кавказскую культуру, танцуют лезгинку и т.д. Всё это было у них изначальной кавказской культурой и, только название закрепилось как за бывшими подданными Ногайской орды, то есть, "ногайцы".

[asan-kaygy]

18 часов назад, Zerek сказал:

Субклады гаплогрупы С, обычно ассоциируемые с движением монгольских племен в Среднюю Азию при Чингис-хане могли ли на самом деле быть местными, появившимися в Средней Азии в том же 8-9 веке?

Могли. Плюс С2 это не монгольские племена. Апачи и навахо тоже С2, но явно не монголы

[Kazakh]

@asan-kaygy  прочитал новостную статью про мальчика усыновленного бельгийцами. Хотел спросить, у найманов находили R1b? 

Просто сомнение есть по предиктору TreeGene по 27 маркерам. Аркалык место рождения парня, это Торгай и вотчина кыпшаков. 

Вот ссылка: https://qazalem.kz/ru/news/491

"Мы определили гаплогруппу Жанибека R1b-M478.  Через гаплотип определили гаплогруппу. Таким образом, его род будет известен по численности населения. В гаплогруппе Джанибека наблюдались признаки двух родов. Один — Найман, другой — Кыпшак. После исследования Найман стала видна разница после 2-х мутаций. А до Кипчака разница наблюдалась из 7 мутаций. После того как Y-хромосома совпала с Найманами, мы записали его в книгу как представителя Среднего жуза, рода Найман, из семейства Баганалы."

[Бозбет Шыны]

3 часа назад, Kazakh сказал:

@asan-kaygy  прочитал новостную статью про мальчика усыновленного бельгийцами. Хотел спросить, у найманов находили R1b? 

Просто сомнение есть по предиктору TreeGene по 27 маркерам. Аркалык место рождения парня, это Торгай и вотчина кыпшаков. 

Вот ссылка: https://qazalem.kz/ru/news/491

"Мы определили гаплогруппу Жанибека R1b-M478.  Через гаплотип определили гаплогруппу. Таким образом, его род будет известен по численности населения. В гаплогруппе Джанибека наблюдались признаки двух родов. Один — Найман, другой — Кыпшак. После исследования Найман стала видна разница после 2-х мутаций. А до Кипчака разница наблюдалась из 7 мутаций. После того как Y-хромосома совпала с Найманами, мы записали его в книгу как представителя Среднего жуза, рода Найман, из семейства Баганалы."

У найманов баганалы, торткара и талканшы я находил R1b https://eurasica.ru/forums/topic/4830-жагалбайлы/?do=findComment&comment=464928

[asan-kaygy]

В 09.08.2024 в 15:16, Kazakh сказал:

@asan-kaygy  прочитал новостную статью про мальчика усыновленного бельгийцами. Хотел спросить, у найманов находили R1b? 

Просто сомнение есть по предиктору TreeGene по 27 маркерам. Аркалык место рождения парня, это Торгай и вотчина кыпшаков. 

Вот ссылка: https://qazalem.kz/ru/news/491

"Мы определили гаплогруппу Жанибека R1b-M478.  Через гаплотип определили гаплогруппу. Таким образом, его род будет известен по численности населения. В гаплогруппе Джанибека наблюдались признаки двух родов. Один — Найман, другой — Кыпшак. После исследования Найман стала видна разница после 2-х мутаций. А до Кипчака разница наблюдалась из 7 мутаций. После того как Y-хромосома совпала с Найманами, мы записали его в книгу как представителя Среднего жуза, рода Найман, из семейства Баганалы."

Компания Триген она такая

[Kayrat]

У найман R1b-z2103 снип R-ZQ618, с общим предком в 12-13 веке.