Перепост Кошоя
https://www.nature.com/articles/nature26151Reconstructing the genetic history of late NeanderthalsMateja Hajdinjak, Qiaomei Fu, Alexander Hübner, Martin Petr, Fabrizio Mafessoni, Steffi Grote, Pontus Skoglund, Vagheesh Narasimham, Hélène Rougier, Isabelle Crevecoeur, Patrick Semal, Marie Soressi, Sahra Talamo, Jean-Jacques Hublin, Ivan Gušić, Željko Kućan, Pavao Rudan, Liubov V. Golovanova, Vladimir B. Doronichev, Cosimo Posth, Johannes Krause, Petra Korlević, Sarah Nagel, Birgit Nickel, Montgomery Slatkin, Nick Patterson, David Reich, Kay Prüfer, Matthias Meyer, Svante Pääbo & Janet Kelso- Show fewer authorsNaturedoi:10.1038/nature26151Received: 22 July 2017Accepted: 24 January 2018Published: 21 March 2018AbstractAlthough it has previously been shown that Neanderthals contributed DNA to modern humans1,2, not much is known about the genetic diversity of Neanderthals or the relationship between late Neanderthal populations at the time at which their last interactions with early modern humans occurred and before they eventually disappeared. Our ability to retrieve DNA from a larger number of Neanderthal individuals has been limited by poor preservation of endogenous DNA3 and contamination of Neanderthal skeletal remains by large amounts of microbial and present-day human DNA3,4,5. Here we use hypochlorite treatment6 of as little as 9 mg of bone or tooth powder to generate between 1- and 2.7-fold genomic coverage of five Neanderthals who lived around 39,000 to 47,000 years ago (that is, late Neanderthals), thereby doubling the number of Neanderthals for which genome sequences are available. Genetic similarity among late Neanderthals is well predicted by their geographical location, and comparison to the genome of an older Neanderthal from the Caucasus2,7 indicates that a population turnover is likely to have occurred, either in the Caucasus or throughout Europe, towards the end of Neanderthal history. We find that the bulk of Neanderthal gene flow into early modern humans originated from one or more source populations that diverged from the Neanderthals that were studied here at least 70,000 years ago, but after they split from a previously sequenced Neanderthal from Siberia2 around 150,000 years ago. Although four of the Neanderthals studied here post-date the putative arrival of early modern humans into Europe, we do not detect any recent gene flow from early modern humans in their ancestry. Хотя ранее было показано, что неандертальцы внесли свой вклад в ДНК современных людей, мало что известно о генетическом разнообразии неандертальцев или взаимосвязи между поздними популяциями неандертальцев в то время, когда происходили их последние взаимодействия с ранними современными людьми и до того, как они в конечном итоге исчезли. Наша способность извлекать ДНК из большего числа неандертальцев была ограничена плохой сохранностью эндогенной ДНК и загрязнением неандертальских скелетных останков большим количеством микробной и современной ДНК. Здесь мы используем гипохлоритную обработку всего лишь 9 мг костного или зубного порошка для генерации генома покрытием в 1-2,7 раза для пяти неандертальцев, которые жили около 39 000-47 000 лет назад (то есть поздние неандертальцы), тем самым удваивая число неандертальцев, для которых доступны геномные последовательности. Генетическое сходство среди поздних неандертальцев хорошо предсказывается по их географическому положению, а сравнение с геномом более старого неандертальца с Кавказа указывает на то, что, по всей видимости, к концу неандертальской истории или на Кавказе или по всей Европе произошло замещение одних неандертальцев другими. Мы находим, что основная часть потока генов неандертальцев в ранних современных людях возникла из одной или нескольких исходных популяций, которые отделились от неандертальцев, которые были изучены в данной статье, по крайней мере 70 000 лет назад, но после того, как они отделились от ранее секвенированного неандертальца из Сибири около 150 000 лет назад. Хотя четыре из неандертальцев, изученных здесь жили после предполагаемого прибытия ранних современных людей в Европу, мы не обнаруживаем никакого недавнего потока генов от ранних современных людей в их геномах.
