Samtat

Жаль, что нет дополнительных материалов. У них в качестве ссылочных материалов стоит:Hierarchical Y-SNP assay to study the hidden diversity and phylogenetic relationship of native populations in South America Может оттуда взяли данные?

Это гаплогруппа O3a2, видимо найманы.

Аsan-kaygy, Вы делали публикацию по : Y-STR гаплотипам 67 представителей Восточно-Казахстанской области В результате анализа распределения аллелей 17 локусов нерекомбинирующей части Y-хромосомы у 67 индивидов, представляющих этнических казахов из Восточно-Казахстанской области, Тарбагатайский район (с.Карасу, с.Кабанбай, с.Акжар) был определен цифровой код для каждого образца. Среди исследованных образцов было выявлено 27 (40%) различных генотипов. Нужно отметить, что у 41 человека был обнаружен одинаковый генотип. http://repository.enu.kz/bitstream/handle/123456789/3214/analiz-Y-STR.pdf

Аsan-kaygy, не подскажите у казахских кыпчаков J2a тоже DYS391=11? Вроде их публиковал. Два гаплотипа которые отличаются между собой немногоЕщё один казах из Китая J2a с DYS391=11 H29 1 YL 12 24 14 11 13, 16 0 0 11 13 11 29 20 J2a2-PF5008

Y-chromosome lineage in five regional Mongolian populations Toshimichi Yamamoto *, Tomoki Senda, Daiki Horiba, Masayoshi Sakuma, Yuuka Kawaguchi, Yuuichi Kano http://www.fsigeneticssup.com/article/S1875-1768(13)00134-0/pdf

HAP n Location DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385 DYS426 DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458 H1 1 ALT 13 25 16 10 9, 13 0 0 10 13 11 29 18 R1a H11 1 ALT 13 25 16 10 11, 14 0 0 11 13 11 29 16 R1a H26 1 ALT 13 24 16 10 12, 14 0 0 10 14 11 32 15 R1a H50 1 ALT 13 25 16 11 15 0 0 14 13 11 31 17 I2a1b3 H22 1 ALT 14 24 15 10 12, 14 0 0 12 13 11 29 16 I2c2 H25 1 ALT 13 23 15 10 12, 14 0 0 11 14 12 32 12 G1-M342 H17 1 ALT 13 24 16, 17 9 12 0 0 11 14 11 31 17 C2-M217 H21 1 ALT 13 26 16 10 12, 13 0 0 10 13 11 29 19 C2-M217 H23 1 ALT 13 25 16 10 12, 14 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H44 1 WC 12 24 14 11 13, 19 0 0 11 13 11 29 20 J2a2-PF5008 H2 1 WC 14 23 14 12 10, 13 0 0 10 14 16 31 16 N1c H37 1 WC 12 23 15 10 13, 18 0 0 13 12 13 29 17 O3a2 H42 1 WC 12 24 14 10 13, 18 0 0 12 12 13 29 17 O3a2 H18 1 WC 13 24 16 10 12, 13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H20 2 WC 13 25 16 10 12, 13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H9 1 BL 13 24 16 11 11, 14 0 0 10 15 11 32 15 R1a H10 1 BL 13 26 15 11 11, 14 0 0 9 13 11 32 15 R1a H24 1 BL 13 25 16 11, 12 12, 14 0 0 10 13 11 31 16 R1a H12 1 BL 12 24 14 11 11, 17 0 0 12 13 13 29 18 R1b H28 1 BL 14 21 15 10 13, 15 0 0 11 12 11 28 15 G2a2b1 - M40 H46 1 BL 13 23 13 10 14, 17 0 0 13 14 12 29 15 G1-M342 H33 1 BL 12 23 15 10 13, 18 0 0 11 12 13 29 18 J2a1 xHB H45 1 BL 12 22 15 10 14, 17 0 0 11 13 11 29 14 J2a1h2 H41 1 BL 12 23 15 10 13, 18 0 0 12 13 13 30 17 L1b H4 1 BL 15 22 14 11 11, 13 0 0 10 14 16 30 17 N1c H5 1 BL 15 23 14 11 11, 13 0 0 10 14 14 30 17 N1c H6 1 BL 14 23 14 10 11, 13 0 0 10 14 14 30 17 N1c H7 1 BL 14 23 14 10 11, 13 0 0 10 14 14 30 18 N1c H8 1 BL 14 23 14 10 11, 13 0 0 10 14 14 30 18 N1c H30 1 BL 12 23 15 10 13, 17 0 0 12 12 13 29 17 O3a2 H31 2 BL 12 23 15 10 13, 18 0 0 12 12 13 28 17 O3a2 H32 1 BL 12 23 15 10 13, 18 0 0 13 12 13 29 16 O3a2 H34 1 BL 12 23 15 10 13, 18 0 0 11 12 13 29 17 O3a2 H35 1 BL 12 23 15 10 13, 18 0 0 12 12 13 29 17 O3a2 H36 13 BL 12 23 15 10 13, 18 0 0 12 12 13 29 17 O3a2 H38 2 BL 12 23 15 10 13, 18 0 0 13 12 13 29 17 O3a2 H39 2 BL 12 23 15 10 13, 18 0 0 12 12 13 29 18 O3a2 H40 2 BL 12 23 15 10 13, 18 0 0 12 12 13 30 17 O3a2 H43 1 BL 12 23 15 11 13, 19 0 0 11 12 13 29 17 O3a2 H47 2 BL 12 23 15 10 14, 18 0 0 12 12 13 28 17 O3a2 H48 3 BL 12 23 15 10 14, 18 0 0 12 12 13 29 17 O3a2 H49 1 BL 12 23 15 10 14, 18 0 0 12 12 13 30 17 O3a2 H13 1 BL 13 26 16 10 12 0 0 10 13 11 29 17 C2-M217 H14 1 BL 13 24 9 12 0 0 11 14 11 31 18 C2-M217 H15 2 BL 13 24 16, 17 9 12 0 0 11 14 11 31 18 C2-M217 H16 1 BL 13 24 15, 17 9 12 0 0 11 14 11 31 18 C2-M217 H19 2 BL 13 25 16 10 12, 13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H23 1 BL 13 25 16 10 12, 14 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H3 1 BL 13 26 15 10 11 0 0 12 13 7 29 16 D1a H29 1 YL 12 24 14 11 13, 16 0 0 11 13 11 29 20 J2a2-PF5008 H30 1 YL 12 23 15 10 13, 17 0 0 12 12 13 29 17 O3a2 H40 2 YL 12 23 15 10 13, 18 0 0 12 12 13 30 17 O3a2 H27 1 YL 13 25 16 10 13 0 0 10 13 11 29 17 C2-M217

Лучше поздно, чем никогда : http://medgenetics.ru/UserFile/File/Doc/Evolution%20Doc/Kharkov-Genetika-2013-49%2812%29-1416-1425-Y-Tuva.pdf http://medgenetics.ru/UserFile/File/Doc/Evolution%20Doc/Kharkov-RJG-2013-49%2812%29-1236-1244-Y-Tuva.pdf

У автора есть отдельная работа по казахам: Maternal and Paternal Diversity in Xinjiang Kazakh Population from China http://link.springer.com/article/10.1134/S1022795414110143 В работе имеются гаплотипы казахов Китая.

В работе были гаплотипы, из наиболее близких: _____________________________________________________________________________________________ DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385a DYS385b DYS426 DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389b DYS458 Найманский гаплотип__________________________ 12 23 15 10 13 18 11 12 12 12 13 29 18 29 F46+,F48-,F209-,F2887- Han China Northwest____ 12 23 15 10 12 18 0 0 12 12 12 16 18 19 F2887+ Han China Southwest__________________ 12 23 15 10 13 18 0 0 11 12 13 17 18 126 F2887+ Han China East ______________________12 23 15 10 13 17 0 0 12 12 12 17 N/A 6 F279+,F152+,F2112+ Han China North ____________12 23 15 10 12 18 0 0 12 12 12 17 17 11 F279+,F152+ Han China North _________________12 23 15 10 13 19 0 0 12 12 12 16 18 117 F279+,F152+ Han China East_________________ 12 23 15 10 12 18 0 0 12 12 12 16 N/A 127 F279+,F152+ Han China North________________ 12 23 15 10 12 18 0 0 12 12 12 17 N/A 141 F279+,F152+ Mongol China __________________12 23 15 10 12 18 0 0 12 12 12 17 18 ________________________________________________________________________________________ Ветка F46+: O2a2b1a2a1 F46/Y15, CTS2643, CTS11192, CTS11459, F174, F323/Y17, F353, F388, F442, F502, F507/Y18, F532, F2039 Ветка F279+,F152+: O2a2b1a2a1a1a F152, CTS1098, CTS8380, CTS9172, CTS9217, F279, F595, F700 Ветка F2887+: O2a2b1a2a1a3 F2887, CTS3776, CTS9862 http://www.isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpO.html Самые близкие из всех : Найманский гаплотип__________________________ 12 23 15 10 13 18 11 12 12 12 13 29 18 19 F2887+ Han China Southwest____________________ 12 23 15 10 13 18 0 0 11 12 13 17 18 126 F2887+ Han China East ________________________12 23 15 10 13 17 0 0 12 12 12 17 N/A 127 F279+,F152+ Han China North___________________ 12 23 15 10 12 18 0 0 12 12 12 17 N/A 141 F279+,F152+ Mongol China _____________________12 23 15 10 12 18 0 0 12 12 12 17 18

По поводу гаплогруппы О3(О2): Refined phylogenetic structure of an abundant East Asian Y-chromosomal haplogroup O*-M134 у китайцев куча линий с непонятными снипами. На isogg.org смог найти только линию O2a2b1a2a1a3 F444+,F46+,F2887+. С казахами китайцев объединяет субклад F444+,F46+,но более глубокие снипы казахов мне не известны. Поэтому на сколько казахи и китайцы далеки или близки друг от друга не ясно. Кроме всего прочего у китайцев есть линия O2a2b1a1 M117+, которой как я понимаю нет у казахов.

Посмотрите другие локусы, там тоже есть расхождения. Например DYS390 и DYS391. Три шага на 12-ти маркерах уже показатель определённой закономерности, не 100%-ой , но всё же. Тут видна некая тенденция, показывающая степень родства, что не мешает этим гаплотипам входить в старкластер или алшынский кластер.

Аsan-kaygy, не подскажите у казахских кыпчаков J2a тоже DYS391=11?

Не в курсе. Здесь я привёл гаплотипы казахов Китая.В этой выборке С2-М217 нет DYS385=12-12.

И ещё: Ht45 1 13 25 16 10 12,14 0 0 10 13 11 29 19 C2-M217(монгол) H60_ 2 13 25 16 10 12,14 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217(казахи) Но не стоит забывать, что есть вероятность того, что увеличивая кол-во маркеров(локусов) может увеличится и расхождение между гаплотипами.

А вот о сходстве: Монголы: Ht59 1 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 19 C2-M217 Ht93 1 13 25 16 10 12,13 0 0 11 13 11 29 18 C2-M217 Казахи: H50 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 28 18 C2-M217 H53 2_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H55 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H56 11 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H57 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 11 13 11 29 18 C2-M217 Эти два гаплотипа монголов определённо близки гаплотипам казахов.

Напоминаю я не специалист. . Возможно отдельные гаплотипы или их ряд имеет близость, и есть общие линии, определяющие родство монголов и казахов. Ситуация с С3 мне кажется аналогичной с О3, вероятно я не прав, но чтобы знать однозначно нужно иметь более длинные гаплотипы. К примеру, вот ряд гаплотипов монголов и казахов: Haplotype Count DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385 DYS426 DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458 Монголы: Ht6 1_ 13 24 16 10 12,12 0 0 10 13 11 29 19 C2-M217 Ht9 1_ 13 24 16 9 12,12 0 0 11 13 11 29 17 C2-M217 Ht28 1 13 24 16 9 12,12 0 0 11 13 11 29 17 C2-M217 Ht32 1 13 24 16 9 12,12 0 0 12 13 11 29 17 C2-M217 Ht34 1 13 24 16 9 12,12 0 0 11 13 11 29 16 C2-M217 Ht95 1 13 24 16 9 12,12 0 0 11 14 11 30 18 C2-M217 Казахи: H50 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 28 18 C2-M217 H51 1_ 13 24 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H52 1_ 13 24 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H53 2_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H54 4_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 17 C2-M217 H55 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H56 11 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217 H57 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 11 13 11 29 18 C2-M217 H58 1_ 13 26 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 19 C2-M217 H59 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 14 11 30 18 C2-M217 Я взял по группе гаплотипов каждого этноса однородных более-менее внутри каждой группы и между группами. Гаплотипы на первый взгляд имеют сходство, но по значению ряда локусов отличаются. Например по локусу DYS385: у монголов он равен 12-12, а у казахов 12-13.

Предиктор по-моему ошибочно определил монгольский гаплотип как R1b Z2103 13 19 14 11 13,13 0 0 13 14 13 30 13 19 14 11 13-13 12 12 13 14 13 31 Нижний гаплотип из татарского проекта R1b-М73

Сейчас посмотрел гаплотипы О3а2 казахов и монголов, схожести почти нет.ИМХО Если у казахов гаплотипы идут в один один строем, то у монголов гаплотипы однородны гораздо меньше.

Алтайские казахи, из старой работы: DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385 DYS426 DYS388 DYS439 DYS389a DYS392 DYS389B DYS458 J2a 12 24 14 11 13-16 0 0 11 13 11 16 20 Монгол: J2a 12 24 14 10 13,16 0 0 11 13 11 29 21 Похоже потомки некого J2a не слабо так размножились на Алтае и ЦА.

По этой выборке получились такие результаты:

Analysis of 17 Y-STR loci haplotype and Y-chromosome haplogroup distribution in five Chinese ethnic groups http://onlinelibrary.wiley.com/wol1/doi/10.1002/elps.201500089/abstract В работе есть 100 17-ти маркерных гаплотипов монгол. Файл эксел: http://onlinelibrary.wiley.com/wol1/doi/10.1002/elps.201500089/suppinfo

Ещё одна работа старенькая, но есть 107 гаплотипов: 12 маркеров без 426 и 388 локусов: Y-chromosomal STR haplotypes in Chinese Uigur ethnic group http://link.springer.com/article/10.1007/s00414-005-0549-5

Вполне возможно, так оно и есть, и подтверждается тем, что гаплогруппы С2 и О3 охватывают 3/4 генофонда казахов Китая.