Насколько я знаю, современные уйгуры вплоть до 20-х г.г. 20-го столетия не имели общего названия. Чаще всего они идентифицировали себя по месту жительства - кашгарлык, хотанлык, турпанлык, или по роду занятия - таранчи, например.
Объединяющее же самоназвание "уйгур" было принято на съезде в Ташкенте в 1921 году.
Поправьте, если я не прав.