Казахский ДНК-проект

[кылышбай]

5 минут назад asan-kaygy написал:

Не разные, О как раз таки одинаковые

насколько я понял найманские, кытайские и халхасский О2 относятся к трем разным субкладам. там родство не ранее 2 тыс. лет емнип

[asan-kaygy]

21 минуту назад Джагалбайлы написал:

Мне показалось К1993 отличается от остальных

По памяти вроде они все одинаковые

[asan-kaygy]

19 минут назад кылышбай написал:

насколько я понял найманские, кытайские и халхасский О2 относятся к трем разным субкладам. там родство не ранее 2 тыс. лет емнип

Может и больше.

[asan-kaygy]

26 минут назад Джагалбайлы написал:

Наверное по Приложению 2 можно сориентироваться?

Если потратить на это время

[Джагалбайлы]

14 минут назад asan-kaygy написал:

По памяти вроде они все одинаковые

K1993:           12  26  15  11  12-13  11  12  10  12  13  28

Другие три:  12  23  15  11  12-17  11  12  12  12  12  28

Может же опечатка здесь быть?

[asan-kaygy]

Только что Джагалбайлы написал:

K1993:           12  26  15  11  12-13  11  12  10  12  13  28

Другие три:  12  23  15  11  12-17  11  12  12  12  12  28

Может же опечатка здесь быть?

Надо посмотреть

[Almaty]

В 05.03.2018 в 09:10 asan-kaygy написал:

И к чему это было?

Просто хотел узнать, возможно ли такое? 

[asan-kaygy]

7 часов назад Almaty написал:

Просто хотел узнать, возможно ли такое? 

Сейчас в современных условиях вряд ли, а в кочевом обществе средневековья вполне

[Boris Suvorov]

Уважаемые  форумчане с Праздником  весны и Нового года всех вас!    Доброго здоровья  и творческих  успехов!

Вероятно  то что я  выложу  сейчас  не будет  интересным   для многих  из  вас,  но мы говорим  о генетике,  а следовательно  должны  быть  знакомы с ее  базой - алфавитом.

Полиморфи́зм в биологии (от др.-греч. πολύμορφος — многообразный) — способность некоторых организмов существовать в состояниях с различной внутренней структурой или в разных внешних формах.

Внешний (а также внутренний, например, биохимический) полиморфизм может быть обусловлен внутривидовыми генетическими различиями. С другой стороны, возможен полиморфизм, при котором организмы с практически идентичным геномом в зависимости от внешних условий приобретают различные фенотипические формы.

 Однонуклеотидный полиморфизм

Однонуклеотидный полиморфизм (ОНП, англ. Single nucleotide polymorphism, SNP, произносится как снип) — отличия последовательности ДНК размером в один нуклеотид (A, T, G или C) в геноме (или в другой сравниваемой последовательности) представителей одного вида или между гомологичными участками гомологичных хромосом.

 

 Нуклеотиды - природные соединения, из которых, как из кирпичей, построенные цепочки нуклеиновых кислот. Также нуклеотиды входят  в состав важнейших коферментов (органические соединения небелковой природы - компоненты некоторых ферментов) и других биологически активных веществ, служат в клетках переносчиками энергии. 

 

     Молекула каждого нуклеотида (мононуклеотид) состоит из трех химически различных частей.

1. Это пятиуглеродный сахар (пентоза):

-  рибоза (в этом случае нуклеотиды называются рибонуклеотиды и входят в состав рибонуклеиновых кислот, или РНК)

 - или дезоксирибоза (нуклеотиды называются дезоксирибонуклеотиды и входят в состав дезоксирибонуклеиновой кислоты, или ДНК). 

 

Один, два или три остатки фосфорной кислоты, присоединенные эфирными связями к углероду сахара, образуют молекулу нуклеотида (в молекулах ДНК или РНК один остаток фосфорной кислоты). 

 

Азотистые основания нуклеотидов ДНК - это пурины (аденин и гуанин) и пиримидиновые (цитозин и тимин). Нуклеотиды РНК содержат те же основы, что и ДНК, но тимин в них заменен близким по химическому строению урацилом. 
  
      Азотистые основания, и, соответственно, нуклеотиды, которые их включают, в биологической литературе принято обозначать начальными буквами (латинскими или украинскими/русскими) в соответствии с их названиями: 
 - аденин - А (А);
 - гуанин - G (Г); 
 - цитозин - С ( Ц); 
 - тимин - Т (Т); 
 - урацил - U (У). 
     Сочетание двух нуклеотидов называется динуклеотид, нескольких - олигонуклеотид, множества - полинуклеотид или нуклеиновая кислота. 

Конвергенция

 

На примере сравнения геномных последовательностей дельфинов и летучих мышей — млекопитающих, способных к эхолокации, — европейские ученые выяснили генетические пути конвергентной эволюции. Конвергенция, то есть возникновение сходных признаков у неродственных организмов, считалась результатом эволюции разных наборов генов: слишком уж ничтожной кажется вероятность появления сходных мутаций в сходных генах. Но, как выяснилось, эхолокация — сложный приспособительный признак — у дельфинов и летучих мышей возникла как раз за счет сходных мутаций в сходных генах. Это меняет наши представления о генетической сущности конвергенции, а также показывает, что к результатам применения молекулярных методов для филогенетических реконструкций следует относиться осторожно.

 

 Конвергентные признаки, как считается, формируются в сходных обстановках и служат для выполнения аналогичных функций: роющие конечности для норных обитателей, крылья для летунов, слепота у погруженных во тьму обитателей, живорождение у особенно заботливых родителей и т. д. Конвергентые признаки серьезно осложняют и без того нелегкую жизнь эволюциониста, потому что в каждом конкретном случае приходится решать, является ли сходство указанием на общее происхождение, или на общие адаптивные нужды, или на то и другое вместе.

 

гомоплазия — Независимое возникновение и фиксация одних и тех же хромосомных мутаций (часто Робертсоновских транслокаций) в разных филетических линиях; более широко Г. параллельная, или конвергентная, эволюция. [Арефьев В.А., Лисовенко Л.А. Англо русский… …   Справочник технического переводч

 

Y-гаплотип представляет собой совокупность маркёров, которая позволяет найти людей, которые являются друг другу близкими родственниками. Всего на игрек-хромосоме известно свыше 700 маркёров, но для исследований обычно используют только их часть.

 

Это  небольшая часть  понятий  основы  науки генетики.  Если,  вам будет  интересно  буду  выкладывать  и далее что  будет  интересным  по моему  мнению.

С уважением  B.S

[Boris Suvorov]

Недавние  работы  по генетике.

Самой информативной из них оказалось исследование группы гарвардского генетика Дэвида Райха. Эта группа произвела анализ ДНК из 69 скелетов древних европейцев, живших 3000—8000 лет до новой эры в разных местах Европы. Эта цифра (69) вдвое превышает число ДНК, которые были изучены во всех предшествующих исследованиях такого рода, вместе взятых. В ходе своего исследования группа Райха собрала данные о составе каждой из этих 69 ДНК в четырехстах тысячах (!) ее «снипсов» — так называются те места в ДНК, которые характеризуют индивидуальные отличия разных людей. Эти данные позволили выявить степень родства и различия между изученными скелетами, а так как место их нахождения и время жизни соответствующих людей были известны, то все эти данные в совокупности позволили вычислить, когда те или иные племена пришли в Европу и как они там расселялись. В сочетании с данными предшествующих исследований, полученные результаты привели к новой хронологии заселения Европы.

Согласно этой новой картине, прямые потомки первых европейцев (охот­ники и собиратели) продолжали преобладать в Европе вплоть до эпохи раннего неолита. Но около 7000 лет до новой эры сюда с юго-востока пришли первые земледельцы. То были выходцы из Анатолии, одного из первых очагов оседлого земледелия на планете. Переселяясь с одного средиземноморского острова на другой, они достигли Сардинии, откуда перебрались в Испанию и южную Францию. Еще несколько позже они проникли также в Германию, Венгрию и на Балканы (археологи давно уже обнаружили эту группу по ее так называемой «тисненой керамике», но не знали раньше, откуда она пришла).

С другой стороны, в восточной Ев­ропе и в России первичное население (охотники и собиратели) преобладало гораздо дольше. Примерно за 4,5—3,5 тысяч лет до новой эры тут сложилась культура «шнуровой керамики», материальные следы которой находят на всей северной части восточной Европы. К этому времени (примерно, 6000 лет до новой эры) в степной полосе к северу от Черного и Каспийского морей возникло сообщество скотоводческих племен, культуру которых назвали «ямной», потому что своих мертвых они хоронили в ямах, над которыми насыпали курганы. Можно думать, что у них получили широкое распространение колеса, поскольку в странствиях за своими стадами им приходилось покрывать большие расстояния. И вот теперь произведенное группой Райха сравнение ДНК из черепов девяти людей «ямной» культуры с ДНК из четырех черепов людей культуры шнуровой керамики показало, что ДНК этих северных людей на три четверти совпадает с ДНК «ямников». Судя по этим ДНК, люди «ямной» культуры примерно за 3500 лет до новой эры начали массами проникать на север, сменяя первоначальное тамошнее население. Скорее всего, с их появлением сложилась и сама культура «шнуровой керамики», которую они затем принесли с собой в северный и центральный регионы западной Европы, расселившись в ней от Дуная до Скандинавии. Поэтому генетическая близость нынешних жителей этих регионов объясняется их общим «степным» происхождением, так же как в южных регионах она объясняется общим происхождением от ближневосточных фермеров.

А что же с языками? Родство европейских языков не меньше, чем родство самих европейцев, — почти все они являются индоевропейскими (исключение составляют финский, карельский, лапландский, эстонский, ливонский, венгерский, баскский, мальтийский и турецкий). По мнению Райха и его коллег, индоевропейский язык, давший начало почти всем нынешним европейским языкам, был принесен в Европу пришельцами из степей и уже здесь разветвился. Этот вывод говорит в пользу теории степного происхождения индоевропейских языков вообще («курганная гипотеза», развитая замечательным американским археологом и лингвистом Марией Гимбутас). Эта теория утверждает, что протоиндоевропейский язык, сложившийся в степях Прикаспия за 5000—4500 лет до новой эры, был разнесен отсюда на восток, в Сибирь, на юго-восток, в Иран и Индию, на северо-запад, в восточную и западную Европу и на юго-запад, на Балканы, откуда он мог проникнуть и в Малую Азию, то есть в Анатолию.

Как уже говорилось, этой теории противостоит теория, по которой индоевропейские языки возникли много раньше (примерно за 7000 лет до новой эры) в Анатолии, откуда некоторые из них были принесены анатолийскими земледельцами в Южную Европу, а другие постепенно (за 4—5 тысяч лет до новой эры) проникли через Балканы на северо-восток, в степи Прикаспия, а через Иран — в Индию.

Сторонники «степной» гипотезы, доказывая свою правоту, напоминают, что словарный состав индоевропейских языков изобилует терминами, связанными с пастушеством, характерным для степей, но содержит гораздо меньше слов, связанных с земледелием, характерным для Анатолии. Но сторонники «анатолийской» теории объясняют скудость земледельческих терминов тем, что в пору возникновения протоиндоевропейского языка земледелие в Анатолии было еще в самом зачатке.

Результаты группы Райха косвенно подкрепили «степную» гипотезу. Но одновременно она получила и дополнительное подтверждение чисто лингвистического плана в другом из упомянутых недавних исследований, проведенном лингвистами Калифорнийского университета Гарреттом, Чангом и их коллегами и опубликованном в 2015 году в журнале «Language». Изучив свыше двухсот групп близких слов из живых и мертвых индоевропейских языков и зная примерное время возникновения и смерти этих языков, Чанг и Гарретт сумели вычислить, с какой скоростью разветвлялось исходное слово каждой группы и, продвигаясь вспять по этому «языковому эволюционному дереву», пришли к выводу, что исходный язык всей группы начал ветвиться примерно 6500 лет назад (4500 лет до новой эры), что совпадает с основным предположением «степной» (но не «анатолийской») гипотезы.

Но  споры продолжаются.

[asan-kaygy]

Когда пойдут палеоДНК валом там все будет видно

[Boris Suvorov]

2 часа назад asan-kaygy написал:

Когда пойдут палеоДНК валом там все будет видно

Абсолютно  согласен   с  вами.  Достоверность  информации  в этой  области  пока связана  с  двумя факторами, как минимум: 1- надежностью  методов  лабораторных  исследований  и  2 - количеством (массой необходимых)  данных  для  более  реальных  выводов.

[Boris Suvorov]

Есть  еще  один  фактор,  который  всегда  влиял  и возможно  имеет  влияние  в настоящее  время. По  крайне  мере надо  держать его  в уме  - это  политика.

Откуда  ученные  или  целые  лаборатории  получают  финансирование  и  какие  задачи  ставят  хозяева  финансирования  задачи  перед  ними.

В  современном  мире  это  может  быть  осуществлено  скрытыми  рычагами.  Думаю  в этом  отношении  мир  не  изменился.

Хорошо  было  бы  чтобы  такого  влияния  не  было  особенно  на лаборатории.  

[asan-kaygy]

Про теории заговора пожалуйста в другом месте. Этот бред не надо тут писать

[wozaixuexi]

Появился новый совпаденец 600042 который сходися на 12-ти маркерах с протестрованным мною человеком 661705.

Вторая страница в проекте https://www.familytreedna.com/public/alash/default.aspx?section=yresults

Есть ли общие сведения о его корнях? Где брался тест и какова национальность у протестированного?

[asan-kaygy]

12 часов назад wozaixuexi написал:

Появился новый совпаденец 600042 который сходися на 12-ти маркерах с протестрованным мною человеком 661705.

Вторая страница в проекте https://www.familytreedna.com/public/alash/default.aspx?section=yresults

Есть ли общие сведения о его корнях? Где брался тест и какова национальность у протестированного?

Казах, из рода Калмак-толенгут

[wozaixuexi]

Осмелюсь сделать предложение по тесту 600042. Было бы очень удобно если бы в графе 'Paternal Ancestor' указывалось Шежире, оно намного информативней чем ФИО человека сдавшего тест на мой взгляд.

А так вырисовывается общая картина по протестированному 661705, осталось только ВБОП определить.

[mechenosec]

16 часов назад asan-kaygy написал:

Казах, из рода Калмак-толенгут

Из наших пленных теленгудов? Последствия 1771 г ?

[asan-kaygy]

6 часов назад mechenosec написал:

Из наших пленных теленгудов? Последствия 1771 г ?

Кажется. Год может быть раньше

[asan-kaygy]

8 часов назад wozaixuexi написал:

Осмелюсь сделать предложение по тесту 600042. Было бы очень удобно если бы в графе 'Paternal Ancestor' указывалось Шежире, оно намного информативней чем ФИО человека сдавшего тест на мой взгляд.

А так вырисовывается общая картина по протестированному 661705, осталось только ВБОП определить.

Шежире не большое и малой локальной группы, то есть ничего особого не говорит, потомок пленных калмыков

[Le_Raffine]

7 часов назад mechenosec написал:

Из наших пленных теленгудов? Последствия 1771 г ?

Там возможно были и те кто добровольно подчинился Аблаю.

[asan-kaygy]

Этот из западных калмак-толенгутов.

[Le_Raffine]

Значит пленный.

[Zake]

11 часов назад Le_Raffine написал:

Там возможно были и те кто добровольно подчинился Аблаю.

Все таки кто из джунгаров ведь переходил на сторону казахов. 

[asan-kaygy]

Вышел еще один аргын
600037
Mr. Osman Serekbay             G-M201    
13    23    13    10    13-17    11    12    14    14    12    29    15    9-9-9    11    11    24    16    22    27    13-13-14-15-15-16    9    10    20-20    16    13    19    19    35-35-37    11    10    11    8    16-16    8    11    10    8    11    10    12    20-21    14    10    12    12    18    8    12    23    21    14    12    11    13    10    11    11    11