Впервые исследования кыргызов были проведены в 1999 году, когда были взяты пробы кыргызов двух географических районов: селения Сарыташ на Памире и Бакай-ата в Таласской долине [1].
Согласно их данным 29 из 43 кыргызов Сарыташа и 8 из 41кыргызов Бакай-ата имели гаплотип
16-12-11-25-11-11-13 (порядок маркеров: DYS19, DYS388, DYS389-1, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393)
Кроме того близки к ним были следующие гаплотипы
16-12-11-25-10-11-13 (2 из Сарыташа и 4 из Байкай-ата)
15-12-11-25-11-11-13 (3 и 1)
16-12-11-26-11-11-13 (1 и 2)
В общем, судя по значениям маркеров, данные гаплотипы могут относиться к гаплогруппе R1a1.
Позже в 2001 году были опубликованы данные Спенсера Уэллса по гаплогруппному распределению среди кыргызов:
63 % тестированных кыргызов (33 из 52) имели гаплогруппу R1a1a-M17 [2].
В работе 2009 года были опубликованы гаплогруппы кыргызов, собранных в рамках программы National Genographic.
50 % (77 из 154) кыргызов, относились к гаплогруппе R1a1a-M17 [3]
В работе Балаганской О.А. эти данные были представлены полностью и дополнены тестированными кыргызами Мургабского района Горно-Бадахшанской АО Таджикистана. В итоге в Нарынской и Таласской области были собраны 140 образцов, а в Мургабском районе 106 образцов.
В общем, среди 246 тестированных кыргызов были обнаружены следующие гаплогруппы:
R1a1a-M198 - 42,1 % (104)
С-М130 (большая часть из них относятся к С3с) – 33,1 % (81)
N1b-P43 – 12,1 % (30)
Остальные гаплогруппы набрали менее 5 %
Кроме того данные популяции показали еще одно отличие.
Если в популяциях кыргызов Таласской и Нарынской области N1b представлены минимально, то у кыргызов Мургабского района они занимают около 25 % популяции [4].
Кроме того среди кыргызов выделяют три устойчивых кластера N1b и один кластер гаплогруппы R1a, который также есть среди южных алтайцев. Общий предок этого кыргызско-алтайского кластера жил 900±400 лет назад (расчет на основе генеалогических скоростей) [4, с. 22]
Также доступны данные из интервью Алдашева А. о гаплогруппном распределении среди разных кыргызских субэтносов:
Согласно его данным среди родов, относящихся к подразделению Онг Канат (Адигине-Тагай): 45 % относятся к гаплогруппе С3 и 40 % относятся к гаплогруппе R1a1.
Среди родов, относящихся к подразделению Ичкилик (Теит, Кесек)
R1a1 – 40 %
C3 – 25 %
N1c (бывшая N3) – 23 % [5]
Видимо Алдашев А. озвучил данные Балаганской О.А. по двум районам Кыргызстана, но ошибся с гаплогруппой. По данным Балаганской О.А. гаплогруппа N1c1 встречается только у 0,5 % кыргызов. А вот N1b встречается у 12,1 %.
По разным данным из Интернета: среди тестированных в Нарынской области могут быть представители племен Сарыбагыш, Саяк, Черик, Монолдор. Среди тестированных в Таласской области могут быть представители племен Саруу, Кушчу, Китай.
В Мургабском районе могут проживать представители племен Ичкиликов (Теит, Кесек, Найман, Кипчак, Канды и т.д.) плюс возможно представители Адигине-Тагай и Саруу. Судя по данным Алдашева, большинство тестированных в Мургабском районе были Ичкиликами.
Также интересны данные 2010 года по китайским кыргызам: 31 из 45 человек (68,8 %) относятся к гаплогруппе R1a1-M17 [6]. Там же были опубликованы 8-маркерные гаплотипы этой гаплогруппы.
Недостатком почти всех работ (за исключением данных Алдашева А.) по данной тематике было абсолютное игнорирование вопроса родоплеменной структуры кыргызов и учета его при генетическом тестировании. На данный момент вышла только одна работа, где вводятся данные по относительно большому количеству кыргызов, чья родоплеменная атрибуция фиксировалась и учитывалась при написании статьи [7]. Данные той статьи будут приведены ниже.
Еще одна статья по происхождению кыргызов вышла в Вестнике РА ДНК-генеалогии: статья Клесова А.А., в которой он предположил, что среди кыргызов есть одна из ветвей, восходящая к славянам [8]. Согласно его данным предок кыргызов по 39-маркерных гаплотипам из статьи Андерхилла жил около 1300 лет назад. Также Клесов А.А. без критического анализа принял на веру сведения источника о происхождении кыргызов от славян, игнорируя более ранние китайские и тюркские источники о кыргызах.
