Генофонд митохондриальной ДНК и Y-хромосомы населения Южной Сибири гунно-сарматского времени
(конец I тыс. до н.э. – первая половина I тыс. н.э.)

Черданцев С.
Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия
stephancherd@gmail.com

...Был исследован генофонд мтДНК (в сумме 205 образцов) и Y-хромосомы четырех групп населения гунно-сарматского времени: хунну с территории Забайкалья, население гунно-сарматского времени Тувы, носителей таштыкской культуры Минусинской котловины и булан-кобинской культуры Горного Алтая.

Результаты: Исследованы структура и филогенетическое положение мтДНК для 18 образцов населения хунну Забайкалья, 35 представителей населения гунно-сарматского времени Тывы, 48 индивидов таштыкской культуры и 104 образца представителей булан-кобинской культуры Горного Алтая. Высокая доля успешно проанализированных образцов (более 70 % от взятых в исследование) свидетельствует о высокой сохранности древней ДНК в антропологическом материале. Данные о вариабельности мтДНК в генофонде всех перечисленных популяций свидетельствуют о высоком генетическом разнообразии популяций. Это подразумевает участие генетически контрастных компонентов в формировании их генетического состава. Получены данные о вариабельности линий Y-хромосомы в мужском генофонде хунну Забайкалья, населения гунно-сарматского времени Тувы, носителей булан-кобинской культуры Горного Алтая и таштыкской культуры Минусинской котловины...

стр.772 BGRS_2024__A4.pdf

Изучили таштыкскую культуру, результаты под сукно...(

Генетическая структура сарматского населения Нижнего Поволжья и Южного Приуралья
Томилин М.
Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия
tomilin@bionet.nsc.ru

Мотивация и цель: Сарматы – конфедерация воинственных кочевых племен,которые с IV в. до н.э. по IV в. н.э. заселяли западную часть степного пояса Евразии от бассейна Дуная на западе до Уральских гор на востоке. Благодаря античным письменным источникам современные ученые имеют представление о ключевой роли сарматов в различных этнокультурных и политических событиях западной части Евразийских степей. Помимо античной литературы, важную роль сарматов подтверждают археологические исследования многочисленных памятников сарматской культуры. За долгую (более ста лет) историю исследования сарматского населения с точки зрения археологии и антропологии удалось выработать периодизацию их культуры, а также охарактеризовать сарматов с точки зрения физической антропологии. Однако, несмотря на высокую степень изученности, до сих пор остаются нерешенными вопросы их происхождения и связи с населением других регионов Евразии. Одним из наиболее эффективных подходов для объективной реконструкции истории сарматского населения является проведение палеогенетического исследования останков носителей различных этапов сарматской культуры. Получение данных о генетическом составе сарматских популяций, его формировании и динамике позволяет более детально реконструировать историю этих групп населения, игравших высокую роль в политических и этнокультурных процессах на западе степного пояса Евразии.
Цель работы – исследование генетической структуры савромато-сарматского населения Нижнего Поволжья и Приуралья по данным вариабельности митохондриальной ДНК и Y-хромосомы и реконструкция механизмов формирования генофонда сарматских популяций в контексте происходивших в этих регионах исторических и этнокультурных процессов. Методы и алгоритмы: Экстракция древней ДНК из репрезентативных серий палеоантропологических образцов, анализ нуклеотидной последовательности гипервариабельного сегмента I и филогенетически значимых позиций в кодирующей части мтДНК, филогенетический и филогеографический анализ, определение половой принадлежности останков, анализ структуры Y-хромосомы с помощью анализа аллельных профилей STR-маркеров и статуса филогенетически значимых ОНП Y-хромосомы. Работы выполнены на базе специализированной инфраструктуры для палеогенетических исследований в межинститутской лаборатории молекулярной палеогенетики и палеогеномики ИЦиГ СО РАН. В процессе работы соблюдались все необходимые требования по предотвращению влияния контаминации и верификации полученных результатов.

Результаты:
􀁸 Получены серии образцов для предсавроматского и савроматского времени Нижнего Поволжья (N=16).
􀁸 Исследована репрезентативная выборка сарматских материалов Нижнего Поволжья, относящихся к разным этапам культуры (раннесарматскому (IV в.до н.э. – I в. до н.э.), среднесарматскому (I – первая половина II в. н.э.),позднесарматскому (вторая половина II–IV в. н.э.)) общей численностьюболее 100 образцов (индивидов).
􀁸 Получены результаты по разнообразию вариантов мтДНК раннесарматского населения Приуралья (N=15).
􀁸 Получены первые данные по разнообразию вариантов мтДНК разновременных групп населения Нижнего Поволжья эпохи бронзы (ямная,
катакомбная, срубная культуры).
􀁸 Получены предварительные данные по мужскому генофонду (разнообразие вариантов Y-хромосомы) всех перечисленных групп древнего населения.
Выводы:
􀁸 Было установлено, что сарматы не демонстрируют преемственности относительно срубной культуры, обитавшей в Нижнем Поволжье в эпоху поздней бронзы, согласно данным по мтДНК и Y-хромосомы. Полученные данные свидетельствуют о высокой роли мигрантов в происхождении сарматского населения Нижнего Поволжья.
􀁸 Материалы из Приуралья демонстрируют признаки интенсивного миграционного притока в данный регион населения из более восточных районов степного пояса Евразии, включая южные районы Сибири.
Финансирование: Исследование поддержано за счет средств бюджетного проекта ИЦиГ СО РАН № FWNR-2022-0011.

стр. 764 BGRS_2024__A4.pdf

Две публикации с конференции 2024 года одной работы, одного гранта . Авторы те же, только поменяли местами. Интересно, была уже официальная научная статья?

Изучение древней ДНК населения Северного Кавказа бронзового и железного веков

Габидуллина Л.1*, Джаубермезов М.1, 2, Екомасова Н.1, 2, Чагаров О.3, 4,
Атабиев Б.5, Кадиева А.6, Кушнеревич А.7, Тамбетс К.7, Виллемс Р.7,
Хуснутдинова Э.1, 2
1 Уфимский университет науки и технологий, Уфа, Россия
2 Институт биохимии и генетики УФИЦ РАН, Уфа, Россия
3 НИИ и Музей антропологии МГУ, Москва, Россия
4 Институт археологии РАН, Москва, Россия
5 Институт археологии Кавказа, Нальчик, Россия
6 Государственный исторический музей, Москва, Россия
7 Институт геномики Тартуского университета, Тарту, Эстония
* liliya.gab@gmail.com

Мотивация и цель: Географической особенностью Северного Кавказа является его расположение на границе Европы и Передней Азии, что вместе с соседством с Причерноморьем и Поволжьем послужило формированию миграционных и торговых путей, связавших Ближний Восток и Европу в различные исторические периоды, что в свою очередь отразилось на этногенезе народов региона. Формирование генетической структуры народов Северного Кавказа в большей степени протекало до начала выделения этнических групп в период бронзового и железного веков. В бронзовом веке на территории Кавказа развивались несколько археологических культур: майкопская, кура-аракская, северокавказская и завершающая период кобанская, во времена которой население уже было знакомо с железом, что говорит о начале перехода от бронзового к железному веку [1, 2]. В период железного века происходили повсеместные миграции на территории степной и горно-долинной Евразии, что отразилось на генофондах популяций [3]. В связи со сложными процессами этногенеза популяций на территории Северного Кавказа имеется вопрос о предковых компонентах в их генофондах –преемственности от древних археологических культур региона. Для решения данной задачи проводится исследование древней ДНК культур бронзового и железного века с территории Северного Кавказа.
Методы и алгоритмы: Для исследования был отобран палеоматериал в виде зубов 28 представителей майкопской, кобанской, сарматской и гуннской археологических культур. Информация о принадлежности образцов к определенной культуре и о возрасте исследуемых образцов первоначально была предоставлена археологами. Для подтверждения принадлежности исследуемых образцов к изучаемому временному периоду было проведено датирование методом радиоуглеродного анализа, всего таким образом было исследовано 10 образцов. Древняя ДНК выделялась из зубов, с дальнейшим созданием ДНК библиотек для NGS секвенирования на платформе Illumina HiSeq. В результате биоинформатического анализа данных NGS секвенирования были вычислены BGRS/SB-показатели содержания эндогенной ДНК (среднее 32.15 %), уровни контаминации(<3 % 23 образца, 4–17 % 5 образцов) и степени повреждений древней ДНК поC>T заменам (8–27 %). Определен генетический пол исследуемых образцов –11 женщин и 17 мужчин, а также по результатам метода READ исключены родственники из дальнейшего анализа (1 образец). Были определены гаплогруппы митохондриальной ДНК и Y-хромосомы. Для анализа полногеномных данных проводились PCA и ADMIXTURE с использованием набора данных “1240K+HO” лаборатории Dr David Reich, при этом 5 образцов из исследуемой выборки были исключены из анализа из-за низкого количества определенных SNP(<10 000 SNP) [4].
Результаты: Гаплогруппы митохондриальной ДНК образцов исследуемых археологических культур бронзового и железного веков представлены в основном западноевразийскими линиями гаплогрупп H, I, J, T, U, X (82.1 %). Восточно-евразийские линии представлены ветвями гаплогрупп A, C, M (17.9 %). Среди гаплогрупп Y-хромосомы образцов бронзового и железного века преобладают переднеазиатские линии гаплогрупп G2 и J Y-хромосомы, встречаются также единичные носители гаплогруппы R1b, ранее выявленной у представителей степных культур. Образцы всех исследуемых археологических культурбронзового и железного веков по данным PCA анализа кластеризуются в основном с современными популяциями Кавказа и Ближнего Востока. По результатам ADMIXTURE анализа кавказский компонент является основным у большинства исследуемых образцов. Данные, полученные методами PCA и ADMIXTURE, соответствуют определенным нами гаплогруппам однородительских маркеров.
Выводы: Полученные результаты демонстрируют высокие показатели ряда предковых компонентов в генофондах археологических культур Северного Кавказа, что отражает сложные пути этногенеза в регионе в период бронзового и железного веков.
Финансирование: Исследование выполнено в рамках государственного задания Министерства науки и высшего образования РФ (№ 075-03-2024-123/1).

стр.738 https://bgrssb.icgbio.ru/2024/wp-content/uploads/sites/4/2024/09/BGRSSB_2024_Abstracts.pd

Изучение древней ДНК населения Северного Кавказа в 4000 до н.э. – 1800 н.э.

Джаубермезов М.1, 2*, Габидуллина Л.1, Екомасова Н.1, 2, Чагаров О.3, Атабиев Б.4,
Коробов Д.5, Науменко В.6, Крутоголовенко К.7, Кадиева А.8, Прокофьев Р.9,
Вольная Г.10, Кушнеревич А.11, Тамбетс К.11, Виллемс Р.11, Хуснутдинова Э.1, 2
1 Уфимский университет науки и технологий, Уфа, Россия
2 Институт биохимии и генетики УФИЦ РАН, Уфа, Россия
3 НИИ и Музей антропологии МГУ, Москва, Россия
4 Институт археологии Кавказа, Нальчик, Россия
5 Институт археологии РАН, Москва, Россия
6 Крымский федеральный университет им. В.И. Вернадского, Симферополь, Россия
7 Всероссийское общество охраны памятников истории и культуры, Краснодар, Россия
8 Государственный исторический музей, Москва, Россия
9 ООО «Ростовская археологическая экспедиция», Ростов-на-Дону, Россия
10 Институт истории и археологии, Владикавказ, Россия
11 Институт геномики Тартуского университета, Тарту, Эстония
* murat-kbr@mail.ru

Мотивация и цель: Кавказ – преимущественно горный регион на границе Восточной Европы и Ближнего Востока. Растянувшись на более чем 1000 км между Черным и Каспийским морями, он тем не менее всегда оставался полупроницаемым для движущихся потоков древних культур [1, 2]. Располагаясь на стыке Европы и Азии, территория Кавказа на протяжении тысячелетий была связующим звеном между культурами Месопотамии, Ирана, Малой Азии, Средиземноморья и Восточной Европы [3], что приводило к взаимному влиянию как на культурный облик, так и на генофонд населения [4]. Учитывая особую ценность изучения археогеномики древнего населения данного региона, следует отметить, что до сих пор не освещены длительные исторические периоды истории Кавказа. В особенности это касается эпохи позднего бронзового века (конец II –начало I тыс. до н.э.) и отрезка от раннего Средневековья до периода Нового времени (V в. н.э. – начало XX в. н.э.).Методы и алгоритмы: ДНК была извлечена из археологических материалов(зубы, височная кость, слуховые косточки) 100 человек с последующим проведением полногеномного секвенирования с низкой глубиной охвата и анализом их в контексте древних и современных генетических вариаций как изучаемого, так и близлежащих регионов. Покрытие геномов составило 0.0001–0.300X (медианное покрытие 0.0911X, содержание эндогенной ДНК 30.16 %).
Результаты: Радиоуглеродный анализ проведен для 31 из 100 исследованных образцов. За исключением единичных образцов, радиоуглеродное датирование практически соответствовало археологическому. Палитра гаплогрупп мтДНК как населения поздней бронзы, так и Средневековья, состоящая из 15 различных гаплогрупп (A, C, D, F, H, HV, I, J, K, M, N, T, U, W, X), схожа с разнообразием гаплогрупп мтДНК современных автохтонных популяций Кавказа. Разнообразие гаплогрупп Y-хромосомы алан, состоящих из 6 различных гаплогрупп (E, G, I, J,Q и R), схоже с палитрой современных автохтонных популяций Северного Кавказа только на поздней стадии развития аланской культуры. Вызывает интерес,что гаплогруппы Y-хромосомы средневековых балкарцев (у 10 из 11 индивидов определены линии гаплогруппы R) разительным образом отличаются от разнообразия гаплогрупп, выявленных у средневековых осетин (гаплогруппа G определена у 6 из 8 образцов), однако близки с таковым у степных культур, что может указывать на различные процессы этногенеза для соседних популяций. PCA-анализ указывает на существенную генетическую однородность всего разнообразия представленных в работе культур, а также на их сходство с современными популяциями Кавказа. Лишь единичные индивиды выбиваются из «кавказского» кластера, демонстрируя примесь центральноазиатского, восточно-азиатского или европейского компонентов.
Выводы: Полученные результаты подтверждают теорию кавказского происхождения кобанской культуры поздней бронзы. Предварительный анализ позволяет предположить существование тесных контактов сарматов и алан с населением Северного Кавказа.

Финансирование: Исследование выполнено в рамках государственного задания Министерства науки и высшего образования РФ (№ 075-03-2024-123/1).

стр.742 https://bgrssb.icgbio.ru/2024/wp-content/uploads/sites/4/2024/09/BGRSSB_2024_Abstracts.pd