Смотрю здесь обсуждение про гаплы Чингизхана речь пошла, решил Вам толкнуть свои "видения" на счет этого.
Конечно же у Чингизхана как у настоящего кыргыза из рода Кушчу (в науке принято считать, что Кушчу это черневые татары) гаплагруппа была R1a или на худой конец - Q. Род Кушчу в основном имеет гаплагруппу R1a и редко Q. А на то, что у сыновей Чингизхана гаплы С2 и С3 Вы не обращайте внимание, не родные они все, не только первенец Джучи! Профессиональная деятельность Великого (постоянное попадание в детстве, юности и молодости в плен врагам) вероятно не позволял ему иметь собственных детей и это он хорошо знал. По этому для сохранения своего рода Кушчу вел институт "вечного молочного братства - Кукульдашство", между так называемыми "чингизидами" и представителями рода Кушчу.
А так Чингизхан к кыргызам относился очень даже хорошо и это видно из исторических источников. Когда туматы отказались отдавать 30 девушек, Чингизхан отправил на разборку кыргызов. Однако кыргызы вступились за туматов и вместе устроили засаду войскам ЧХ и в первый раз одержали победу. Во второй раз когда они проиграли участь туматов и кыргызов была разной. Монголоязычные туматы (которые защищались) почти полностью были истреблены, а кыргызы которые открыто перешли к врагам (считай предали) ЧХ были помилованы, пострадали только "организаторы" неповиновения. Такой милости Чингизхан никогда никакому народу не давал. Кыргызы остались в своих тогдашних кочевьях западнее Каракорума, о чем можно узнать из трудов Гильема де Рубрука.
Монголом или казахом Чингизхан быть не мог, так как народа "монгол" создал он сам. Ман (н - с хвостиком) - переводится с кыргызского как одурманенный, обкуренный или безрассудный, а кол - войско, отряд. Создавая свой ОПГ Чингизхан Есугеевич не хотел туда втягивать кыргызов, так как он знал что они благородные, демократичные, арийцы и т.д. и т.п.
А казахи появились потом, после монголов.