Связи есть, хакасов исследовали меньше чем кыргыз, но четко установили родство Ичкиликов с хакасами, не понятна степень родства их с Кердери, но они точно близки, а также Он канат и Сол канат (за исключением некоторого количества родов не имеющих с потомками адигине и Тагая общего предка по мужской линии) с южными алтайцами, казахским родом косеули Табын и польско-литовскими князьями Мухлями близки.
Монолдоры и еще часть кыргызских родов С2-старкластера близки Казахскому старшему жузу, но степень близости пока еще не понятна.
У кыргызов как и у казахов разные рода разного происхождения, нету общего Кыргызского ДНК, нету общего Казахского ДНК и т.д. Субклады гаплогрупп имеют четкое сцепление с конкретными родами, но не со всем этносом.