Результаты анализов древних ДНК

[asan-kaygy]

5 минут назад, Samtat сказал:

Хах, главный специалист конечно же Я !!!!  

Просто интересно узнать сколько людей видят такие ошибки ))

[Samtat]

Заметил вот это :

Цитата

Интересно, что в 2009 году венгерскими учеными было выявлено наличие общих гаплотипов Y-хромосомы в популяции казахских аргын (подрод мадьяр) и венгерских мадьяр, имеющих гуннское происхождение. На основе полученных данных было выдвинуто предположение о вероятной генетической связи казахов с венграми в прошлом [9].

Если не ошибаюсь общими были гаплогруппы G, но у аргын G1, а у мадьяр  G2. А это родство никак не общегуннское.

[asan-kaygy]

14 часов назад, Samtat сказал:

Заметил вот это :

Если не ошибаюсь общими были гаплогруппы G, но у аргын G1, а у мадьяр  G2. А это родство никак не общегуннское.

Да, эти авторы вообще не признают нашу статью по гаплогруппе G1aисходя из того что у них предиктор другое показывает№

 Як дети малые

[asan-kaygy]

https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/19/250688

Mitogenomic data indicate admixture components of Asian Hun and Srubnaya origin in the Hungarian Conquerors

Endre Neparaczki, Zoltan Maroti, Tibor Kalmar, Klaudia Kocsy, Kitti Maar, Peter Bihari, Istvan Nagy, Erzsebet Fothi, Ildiko Pap, Agnes Kustar, Gyorgy Palfi, Istvan Rasko, Albert Zink, Tibor Torok

doi: https://doi.org/10.1101/250688

Abstract

It has been widely accepted that the Finno-Ugric Hungarian language, originated from proto Uralic people, was brought into the Carpathian Basin by the Hungarian Conquerors. From the middle of the 19th century this view prevailed against the deep-rooted Hungarian Hun tradition, maintained in folk memory as well as in Hungarian and foreign written medieval sources, which claimed that Hungarians were kinsfolk of the Huns. In order to shed light on the genetic origin of the Conquerors we sequenced 102 mitogenomes from early Conqueror cemeteries and compared them to sequences of all available databases. We applied novel population genetic algorithms, named Shared Haplogroup Distance and MITOMIX, to reveal past admixture of maternal lineages. Phylogenetic and population genetic analysis indicated that more than one third of the Conqueror maternal lineages were derived from Central-Inner Asia and their most probable ultimate sources were the Asian Huns. The rest of the lineages most likely originated from the Bronze Age Potapovka-Poltavka-Srubnaya cultures of the Pontic-Caspian steppe, which area was part of the later European Hun empire. Our data give support to the Hungarian Hun tradition and provides indirect evidence for the genetic connection between Asian and European Huns. Available data imply that the Conquerors did not have a major contribution to the gene pool of the Carpathian Basin, raising doubts about the Conqueror origin of Hungarian language.

Исследовалась древняя мтДНК венгров-завоевателей. Около ста мтДНК, конца 9-го - начала 10-го века. Примерно треть мтДНК азиатского происхожления.

[mechenosec]

38 минут назад asan-kaygy написал:

https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/19/250688

Mitogenomic data indicate admixture components of Asian Hun and Srubnaya origin in the Hungarian Conquerors

Endre Neparaczki, Zoltan Maroti, Tibor Kalmar, Klaudia Kocsy, Kitti Maar, Peter Bihari, Istvan Nagy, Erzsebet Fothi, Ildiko Pap, Agnes Kustar, Gyorgy Palfi, Istvan Rasko, Albert Zink, Tibor Torok

doi: https://doi.org/10.1101/250688

Abstract

It has been widely accepted that the Finno-Ugric Hungarian language, originated from proto Uralic people, was brought into the Carpathian Basin by the Hungarian Conquerors. From the middle of the 19th century this view prevailed against the deep-rooted Hungarian Hun tradition, maintained in folk memory as well as in Hungarian and foreign written medieval sources, which claimed that Hungarians were kinsfolk of the Huns. In order to shed light on the genetic origin of the Conquerors we sequenced 102 mitogenomes from early Conqueror cemeteries and compared them to sequences of all available databases. We applied novel population genetic algorithms, named Shared Haplogroup Distance and MITOMIX, to reveal past admixture of maternal lineages. Phylogenetic and population genetic analysis indicated that more than one third of the Conqueror maternal lineages were derived from Central-Inner Asia and their most probable ultimate sources were the Asian Huns. The rest of the lineages most likely originated from the Bronze Age Potapovka-Poltavka-Srubnaya cultures of the Pontic-Caspian steppe, which area was part of the later European Hun empire. Our data give support to the Hungarian Hun tradition and provides indirect evidence for the genetic connection between Asian and European Huns. Available data imply that the Conquerors did not have a major contribution to the gene pool of the Carpathian Basin, raising doubts about the Conqueror origin of Hungarian language.

Исследовалась древняя мтДНК венгров-завоевателей. Около ста мтДНК, конца 9-го - начала 10-го века. Примерно треть мтДНК азиатского происхожления.

Ну так не зря венгры помнят о своём азиатском происхождении, думаю то же самое касается и казанских татар. Венгры бывшие кочевники , читал что они прикочевали с Урала где щас башкиры, и ведь остановились именно в степи ,у них пушта называется, и мучали всех набегами вплоть до Парижа, пока их не остановили баварцы, на реке Лех кажется? Давно читал ,да и йогурт выдаёт их прошлое 

[asan-kaygy]

27 минут назад mechenosec написал:

Ну так не зря венгры помнят о своём азиатском происхождении, думаю то же самое касается и казанских татар. Венгры бывшие кочевники , читал что они прикочевали с Урала где щас башкиры, и ведь остановились именно в степи ,у них пушта называется, и мучали всех набегами вплоть до Парижа, пока их не остановили баварцы, на реке Лех кажется? Давно читал ,да и йогурт выдаёт их прошлое 

Там натяжки идут. ИМХО, пытаются завысить свой азиатский компонент

[mechenosec]

7 минут назад asan-kaygy написал:

Там натяжки идут. ИМХО, пытаются завысить свой азиатский компонент

Думаю он у них немалый ,кисломолочный йогурт ведь они всему миру навязали, это их национальный продукт, почти то же самое что наш с вами кумыс. А имя Аттила ,тоже о чем то говорит, осталась у них память о предках, возможно малой части предков ,но всё-таки это именно их предки. У татар думаю та же история, внешне вроде европейцы ,а какая-то малая часть предков передала им сказки о своём азиатском  происхождении, но это их предки, потому имеют право.

[asan-kaygy]

15 часов назад mechenosec написал:

Думаю он у них немалый ,кисломолочный йогурт ведь они всему миру навязали, это их национальный продукт, почти то же самое что наш с вами кумыс. А имя Аттила ,тоже о чем то говорит, осталась у них память о предках, возможно малой части предков ,но всё-таки это именно их предки. У татар думаю та же история, внешне вроде европейцы ,а какая-то малая часть предков передала им сказки о своём азиатском  происхождении, но это их предки, потому имеют право.

Право то имеют, но как минимум на 85 % генетически они европейцы )))

[asan-kaygy]

DNA profiling of Hungarian King Béla III and other skeletal remains originating from the Royal Basilica of Székesfehérvár

https://link.springer.com/article/10.1007/s12520-018-0609-7

 

Judit Olasz, Verena Seidenberg, Susanne Hummel, Zoltán Szentirmay, György Szabados, Béla Melegh, Miklós Kásler

 

Abstract

 

A few decades after the collapse of the Avar Khaganate (c. 822 AD), Hungarian invaders conquered the Carpathian Basin (c. 862–895 AD). The first Hungarian ruling dynasty, the Árpáds played an important role in European history during the Middle Ages. King Béla III (1172–1196) was one of the most significant rulers of the dynasty. He also consolidated Hungarian dominance over the Northern Balkans. The provostry church of the Virgin Mary (commonly known as the Royal Basilica of Székesfehérvár) played a prominent role as a coronation church and burial place of medieval Hungarian kings. The basilica’s building and graves had been destroyed over the centuries. The only royal graves that remained intact were those of King Béla III and his first spouse, Anna of Antioch. These graves were discovered in 1848. We defined the autosomal STR (short tandem repeat) fingerprints of the royal couple and eight additional individuals (two females and six males) found in the Royal Basilica. These results revealed no evidence of first-degree relationship between any of the investigated individuals. Y-chromosomal STR profiles were also established for all the male skeletons. Based upon the Y-chromosomal data, one male skeleton showed an obvious patrilineal relationship to King Béla III. A database search uncovered an existing Y-chromosomal haplotype, which had a single-repeat difference compared to that of King Béla. It was discovered in a person living in an area close to Hungary. This current male line is probably related paternally to the Árpád Dynasty. The control region of the mitochondrial DNA was determined in the royal couple and in the remains of the inferred relative. The mitochondrial results excluded sibling relationship between the King and the patrilineal relative. In summary, we successfully defined a Y-chromosomal profile of King Béla III, which can serve as a reference for the identification of further remains and disputed living descendants of the Árpád Dynasty. Among the examined skeletons, we discovered an Árpád member, whose exact affiliation, however, has not yet been established.

 

Игрек-хромосома короля Венгрии Белы III (1148-1196) - из гаплогруппы R1a.

DYS456 DYS389 I DYS390 DYS389 II DYS458 DYS19 DYS385 DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 GATA H4 DYS437 DYS438 DYS448

 

16 13 25 33 15 16 11,13 13 11 10 23 11 13 14 11 20

[Samtat]

Лучше бы куманов изучили, было бы больше пользы.

[кылышбай]

2 часа назад asan-kaygy написал:

Игрек-хромосома короля Венгрии Белы III (1148-1196) - из гаплогруппы R1a.

DYS456 DYS389 I DYS390 DYS389 II DYS458 DYS19 DYS385 DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 GATA H4 DYS437 DYS438 DYS448

 

16 13 25 33 15 16 11,13 13 11 10 23 11 13 14 11 20

по гаплотипу можно прикинуть европейская или азиатская ветка?

[Koshoj]

2 hours ago, Samtat said:

Лучше бы куманов изучили, было бы больше пользы.

Слушайте, ну это делали венгры и немцы, им интересна их собственная история, вот они венгерских королей и изучают. Каким к ним могут быть претензии?

[asan-kaygy]

2 часа назад кылышбай написал:

по гаплотипу можно прикинуть европейская или азиатская ветка?

По гаплотипу трудно сказать

[asan-kaygy]

4 часа назад Samtat написал:

Лучше бы куманов изучили, было бы больше пользы.

За деньги их налогоплатильщиков изучать нашу родню )))

[Samtat]

3 часа назад Koshoj написал:

Слушайте, ну это делали венгры и немцы, им интересна их собственная история

Куманы тоже их собственная история. Есть какие-то сомнения на этот счёт?

[Samtat]

1 час назад asan-kaygy написал:

По гаплотипу трудно сказать

Об этом и речь.

[asan-kaygy]

дДНК лангобардов, Венгрия, Италия, эпоха Великого переселения народов

Перепост с Молгена

https://www.biorxiv.org/content/early/2018/02/20/268250

 

 

Understanding 6th-Century Barbarian Social Organization and Migration through Paleogenomics

 

Carlos Eduardo G Amorim, Stefania Vai, Cosimo Posth, Alessandra Modi, István Koncz, Susanne Hakenbeck, Maria Cristina La Rocca, Balazs Mende, Dean Bobo, Walter Pohl, Luisella Pejrani Baricco, Elena Bedini, Paolo Francalacci, Caterina Giostra, Tivadar Vida, Daniel Winger, Uta von Freeden, Silvia Ghirotto, Martina Lari, Guido Barbujani, Johannes Krause, David Caramelli, Patrick J Geary, Krishna R Veeramah

 

doi: https://doi.org/10.1101/268250

 

Abstract

 

Despite centuries of research, much about the barbarian migrations that took place between the fourth and sixth centuries in Europe remains hotly debated. To better understand this key era that marks the dawn of modern European societies, we obtained ancient genomic DNA from 63 samples from two cemeteries (from Hungary and Northern Italy) that have been previously associated with the Longobards, a barbarian people that ruled large parts of Italy for over 200 years after invading from Pannonia in 568 CE. Our dense cemetery-based sampling revealed that each cemetery was primarily organized around one large pedigree, suggesting that biological relationships played an important role in these early Medieval societies. Moreover, we identified genetic structure in each cemetery involving at least two groups with different ancestry that were very distinct in terms of their funerary customs. Finally, our data was consistent with the proposed long-distance migration from Pannonia to Northern Italy.

 

Несмотря на многовековые исследования, до сих пор идут горячие обсуждения многих вопросов о миграциях варваров, которые имели место между четвертым и шестым веками в Европе. Чтобы лучше понять эту ключевую эпоху, которая знаменует начало современных европейских обществ, мы получили древнюю геномную ДНК из 63 образцов с двух кладбищ (из Венгрии и Северной Италии), которые ранее были связаны с лангобардами, варварским народом, которые правили большими частями Италии более 200 лет после вторжения из Паннонии в 568 году н.э. Наша плотная выборка на основе кладбища показала, что каждое кладбище было в основном организовано вокруг одной большой родословной, что свидетельствует о том, что биологические отношения сыграли важную роль в этих раннесредневековых обществах. Кроме того, мы выявили генетическую структуру на каждом кладбище, включающую по крайней мере две группы с различным происхождением, которые были очень различны с точки зрения их погребальных обычаев. Наконец, наши данные согласуются с предлагаемой миграцией на большие расстояния из Паннонии в Северную Италию.

 

Код: [Выделить]

Table S9.2. Haplogroup attribution for 37 Medieval and 1 Bronze age individuals

 

Site label haplogroup last downtream SNP major distribution

Collegno CL38 E1b1b1a1b1a3 PF2211 Balkans, Southern Italy

CL31 G2a1a1 Z6644 Caucasus, Balkans, Central Europe, Italy, Sardinia

CL63 I1a3 Z79 Central Eastern Europe

CL23 T1a2b L446 Southern Europe

CL110 R1b1a2a M694 Europe

CL53 R1b1a2a PF6434 Europe

CL57 R1b1a2a1a L151 Western Europe

CL93 R1b1a2a1a L151 Western Europe

CL145 R1b1a2a1a L151 Western Europe

CL146 R1b1a2a1a L151 Western Europe

CL92 R1b1a2a1a L52 Western Europe

CL84 R1b1a2a1a2c1g1a1 Z381 Central Europe

CL30 R1b1a1a2a1a2 S116 Central Europe, Italy

CL49 R1b1a1a2a1a2b1a Z367 Central Europe, Italy

CL94 R1b1a1a2a1a2f S11987 Central Europe, Italy

CL121 R1b1a2a2 Z2103 Eastern Europe, Caucasus

 

Szólád SZ18 E1b1b1a1b2 CTS2817 Italy, Iberia, North Africa

SZ45 I1a1b1 L22 Central Europe, Scandinavia

SZ12 I2a2a1 CTS9183 Balkans, Central Europe

SZ14 I2a2a1 CTS9183 Balkans, Central Europe

SZ24 I2a2a1 CTS9183 Balkans, Central Europe

SZ43 I2a2a1a2a1a S391 Central Europe

SZ3 I2a2a1b2a2 S390 Germanic region

SZ13 I2a2a1b2a2a2 ZS20 Germanic region

SZ22 I2a2a1b2a2a2 ZS20 Germanic region

SZ7 I2a2a1b2a2a2 ZS20 Germanic region

SZ36 T1a1a PF5620 Italy, Iberia

SZ15 R1a1a1b1a3a S200 Northern and Eastern Europe

SZ4 R1b1a2a1a1b Z16 Central and Western Europe

SZ16 R1b1a2a1a1c Z381 Central Europe

SZ23 R1b1a2a1a1c Z381 Central Europe

SZ2 R1b1a1a2a1a1c2b2a1b1a L130 Central and Western Europe

SZ11 R1b1a1a2a1a1c2b2b1a1a1 Z351 Central Europe, Italy

SZ27B R1b1a1a2a1a2 S116 Central Europe, Italy

SZ37 R1b1a1a2a1a2 S116 Central Europe, Italy

SZ42 R1b1a1a2a1a2 S116 Central Europe, Italy

SZ5 R1b1a1a2a1a2a1b CTS1595 Central Europe, Italy

 

Szólád(bronze) SZ1 R1a1a1b2a2a Z2123 Eastern Europe, Caucasus

[asan-kaygy]

Яросла́в  Осмомы́сл (ок. 1130—1 октября 1187), прапраправнук Ярослава Мудрого, умер в Галиче и похоронен в Успенском соборе. 

Останки Ярослава обнаружил в 1937 году археолог Ярослав Пастернак. Однако в сентябре 1939 года началась Вторая мировая война. Останки Ярослава Осмомысла были спрятаны в крипте собора святого Юра во Львове, сам Ярослав Пастернак эмигрировал в Канаду, где умер в 1969 году. Опять найдены останки Ярослава Осмомысла были только в 1991 году во время раскопок в крипте после возвращения храма УГКЦ. 1995 была осуществлена реконструкция портрета Ярослава Осмомысла. Фотографию саркофага в подземелье церкви Крилоса можно видеть в журнале «Летопись Красной Калины» (№ 10, октябрь 1937 - С. 7.).
http://avr.org.ua/getPDFasFile.php/arhupa/nblnu-7-0-0-1937-010.pdf

Был изъят зуб из черепа и проведен анализ ДНК.
Результат:
576  18
389 I  13
448  20
389 II  nr
19  13
391  10
481 22
549 12
533  12
438 10
437 nr
570 21
635 21
390 nr
439 12
392 11
643 nr
393 13
458 17
385 16 18
456 17
H4  13

Predicted haplogroup:   E1b1b

https://youtu.be/3pitjzmz0Uo?t=2985

[asan-kaygy]

Еще один перепост

"The Beaker Phenomenon and the Genomic Transformation of Northwest Europe"
Olalde et al. 2018

https://reich.hms.harvard.edu/datasets

400 samples with newly reported data.
Raw sequence data in the form of BAM files can be dowloaded from the
European Nucleotide Archive (www.ebi.ac.uk/ena), accession PRJEB23635.

[кылышбай]

2 часа назад asan-kaygy написал:

Яросла́в  Осмомы́сл (ок. 1130—1 октября 1187), прапраправнук Ярослава Мудрого, умер в Галиче и похоронен в Успенском соборе. 

Останки Ярослава обнаружил в 1937 году археолог Ярослав Пастернак. Однако в сентябре 1939 года началась Вторая мировая война. Останки Ярослава Осмомысла были спрятаны в крипте собора святого Юра во Львове, сам Ярослав Пастернак эмигрировал в Канаду, где умер в 1969 году. Опять найдены останки Ярослава Осмомысла были только в 1991 году во время раскопок в крипте после возвращения храма УГКЦ. 1995 была осуществлена реконструкция портрета Ярослава Осмомысла. Фотографию саркофага в подземелье церкви Крилоса можно видеть в журнале «Летопись Красной Калины» (№ 10, октябрь 1937 - С. 7.).
http://avr.org.ua/getPDFasFile.php/arhupa/nblnu-7-0-0-1937-010.pdf

Был изъят зуб из черепа и проведен анализ ДНК.
Результат:
 

Скрытый текст

576  18
389 I  13
448  20
389 II  nr
19  13
391  10
481 22
549 12
533  12
438 10
437 nr
570 21
635 21
390 nr
439 12
392 11
643 nr
393 13
458 17
385 16 18
456 17
H4  13

Predicted haplogroup:   E1b1b

https://youtu.be/3pitjzmz0Uo?t=2985

у рюриковичей R1a и N1c. турист?

[asan-kaygy]

6 минут назад кылышбай написал:

у рюриковичей R1a и N1c. турист?

видимо да

[Koshoj]

Странно что тут до сих пор не опубликовали:

The Genomic Formation of South and Central Asia
https://www.biorxiv.org/content/early/2018/03/31/292581

Abstract

The genetic formation of Central and South Asian populations has been unclear because of an absence of ancient DNA. To address this gap, we generated genome-wide data from 362 ancient individuals, including the first from eastern Iran, Turan (Uzbekistan, Turkmenistan, and Tajikistan), Bronze Age Kazakhstan, and South Asia. Our data reveal a complex set of genetic sources that ultimately combined to form the ancestry of South Asians today. We document a southward spread of genetic ancestry from the Eurasian Steppe, correlating with the archaeologically known expansion of pastoralist sites from the Steppe to Turan in the Middle Bronze Age (2300-1500 BCE). These Steppe communities mixed genetically with peoples of the Bactria Margiana Archaeological Complex (BMAC) whom they encountered in Turan (primarily descendants of earlier agriculturalists of Iran), but there is no evidence that the main BMAC population contributed genetically to later South Asians. Instead, Steppe communities integrated farther south throughout the 2nd millennium BCE, and we show that they mixed with a more southern population that we document at multiple sites as outlier individuals exhibiting a distinctive mixture of ancestry related to Iranian agriculturalists and South Asian hunter-gathers. We call this group Indus Periphery because they were found at sites in cultural contact with the Indus Valley Civilization (IVC) and along its northern fringe, and also because they were genetically similar to post-IVC groups in the Swat Valley of Pakistan. By co-analyzing ancient DNA and genomic data from diverse present-day South Asians, we show that Indus Periphery-related people are the single most important source of ancestry in South Asia — consistent with the idea that the Indus Periphery individuals are providing us with the first direct look at the ancestry of peoples of the IVC — and we develop a model for the formation of present-day South Asians in terms of the temporally and geographically proximate sources of Indus Periphery-related, Steppe, and local South Asian hunter-gatherer-related ancestry. Our results show how ancestry from the Steppe genetically linked Europe and South Asia in the Bronze Age, and identifies the populations that almost certainly were responsible for spreading Indo-European languages across much of Eurasia.

Формирование генофонда популяций Центральной и Южной Азии было неясным из-за отсутствия древней ДНК. Чтобы устранить этот пробел, мы собрали геномные данные 362-х древних людей, в том числе впервые из восточного Ирана, Турана (Узбекистан, Туркменистан и Таджикистан), бронзового века Казахстана и Южной Азии. Наши данные показывают сложный набор генетических источников, которые в конечном итоге объединяются, чтобы сформировать генофонд современных южных азиатов. Мы документируем распространение генетического компонента из Евразийской степи на юг, что согласуется с археологически известным распространением скотоводческих памятников из степи в Туран в средний бронзовый век (2300-1500 гг. до н. э.). Эти степные сообщества генетически смешивались с народами Бактрийско-Маргианского археологического комплекса (BMAC), с которыми они столкнулись в Туране (в основном потомки ранних земледельцев Ирана), но нет никаких доказательств того, что основная популяция BMAC внесла генетический вклад более поздним южным азиатам. Вместо этого, степные сообщества интегрировались дальше на юг на протяжении 2-го тысячелетия до нашей эры, и мы показываем, что они смешиваются с более южным населением, которое мы документируем на нескольких участках как генетически отличающихся от основного населения, поскольку эти отличающиеся индивидуумы демонстрируют своеобразную генетическую смесь связанную с иранскими земледельцами и южноазиатскими охотниками-собирателями. Мы называем эту группу периферией Инда, потому что они были найдены в местах культурного контакта с цивилизацией долины Инда (IVC) и вдоль ее Северной окраины, а также потому, что они были генетически похожи постхараппские группы в долине Сват в Пакистане. Совместно анализируя древние ДНК и геномные данные из разных современных южноазиатов, мы показываем, что люди, связанные с Периферией Инда, являются наиболее важным генетическим компонентом в Южной Азии - в соответствии с идеей, что индивидуумы Периферией Инда предоставляют нам первый прямой взгляд на родословную народов цивилизации долины Инда - и мы разрабатываем модель для формирования современных южных азиатов с точки зрения временных и географически близких источников генетических компонентов Периферии Инда, степи и южноазиатских охотников-собирателей. Наши результаты показывают, как генетический компонент из Степи генетически связал Европу и Южную Азию в эпоху бронзы, и идентифицирует популяции, которые почти наверняка отвечали за распространение индоевропейских языков на большей части Евразии.

Много ДНК из бронзового века Средней Азии

[asan-kaygy]

На выходных не за компом

А данные конечно супер богатые

[asan-kaygy]

Перепост от Теда Канделла

The Huns! Sample ERS2374355 / DA101 now on the YFull tree in R-YP1456 is a Hun from the Tien Shan mountains on the border of Kyrgyzstan, Kazakhstan, and China from 1783 BP (uncalibrated). That would be something like the year 300 CE.

He matches people today from Kyrgyzstan, Tatars from the Altai Mountains of Russia, and Lithuanian Tatars!

https://en.wikipedia.org/wiki/Tian_Shan

https://yfull.com/tree/R-YP1456/

[asan-kaygy]

https://www.nature.com/articles/s41586-018-0097-z

Abstract
Hepatitis B virus (HBV) is a major cause of human hepatitis. There is considerable uncertainty about the timescale of its evolution and its association with humans. Here we present 12 full or partial ancient HBV genomes that are between approximately 0.8 and 4.5 thousand years old. The ancient sequences group either within or in a sister relationship with extant human or other ape HBV clades. Generally, the genome properties follow those of modern HBV. The root of the HBV tree is projected to between 8.6 and 20.9 thousand years ago, and we estimate a substitution rate of 8.04 × 10−6–1.51 × 10−5 nucleotide substitutions per site per year. In several cases, the geographical locations of the ancient genotypes do not match present-day distributions. Genotypes that today are typical of Africa and Asia, and a subgenotype from India, are shown to have an early Eurasian presence. The geographical and temporal patterns that we observe in ancient and modern HBV genotypes are compatible with well-documented human migrations during the Bronze and Iron Ages1,2. We provide evidence for the creation of HBV genotype A via recombination, and for a long-term association of modern HBV genotypes with humans, including the discovery of a human genotype that is now extinct. These data expose a complexity of HBV evolution that is not evident when considering modern sequences alone.