ПАЛЕОДНК ТУВЫ

[Samtat]

Genetic kinship and admixture in Iron Age Scytho-Siberians

Scythians are known from written sources as horse-riding nomadic peoples who dominated the Eurasian steppe throughout the Iron Age. However, their origins and the exact nature of their social organization remain debated. Three hypotheses prevail regarding their origins that can be summarized as a “western origin”, an “eastern origin” and a “multi-regional origin”. In this work, we first aimed to address the question of the familial and social organization of some Scythian groups (Scytho-Siberians) by testing genetic kinship and, second, to add new elements on their origins through phylogeographical analyses. Twenty-eight Scythian individuals from 5 archeological sites in the Tuva Republic (Russia) were analyzed using autosomal Short Tandem Repeats (STR), Y-STR and Y-SNP typing as well as whole mitochondrial (mtDNA) genome sequencing. Familial relationships were assessed using the Likelihood Ratio (LR) method. Thirteen of the 28 individuals tested were linked by first-degree relationships. When related, the individuals were buried together, except for one adult woman, buried separately from her mother and young sister. Y-chromosome analysis revealed a burial pattern linked to paternal lineages, with men bearing closely related Y-haplotypes buried on the same sites. Inversely, various mtDNA lineages can be found on each site. Y-chromosomal and mtDNA haplogroups were almost equally distributed between Western and Eastern Eurasian haplogroups. These results suggest that Siberian Scythians were organized in patrilocal and patrilineal societies with burial practices linked to both kinship and paternal lineages. It also appears that the group analyzed shared a greater genetic link with Asian populations than Western Scythians did.

https://link.springer.com/article/10.1007/s00439-019-02002-y

[Samtat]

Samples	Last SNP	Y haplogroup
ARZ-T1	Z93	R1a1a1b2
ARZ-T28	Z93	R1a1a1b2
ARZ-T2	M513	R1a
ARZ-T12	M513	R1a
ARZ-T13	M513	R1a
ARZ-T6	M513	R1a
ARZ-T7	M513	R1a
ARZ-T24	M513	R1a
ARZ-T9	M513	R1a
ARZ-T8		NA
ARZ-T15	M231	N
ARZ-T18	L330	Q1b1a3
ARZ-T19	L330	Q1b1a3
ARZ-T20	L330	Q1b1a3
ARZ-T21	L330	Q1b1a3
ARZ-T23	L330	Q1b1a3
ARZ-T25	L54	Q1b1a

 

 

[Le_Raffine]

В целом прямые потомки скифов по Y гаплогруппе это таки тюркоязычные народы с R1a1 (башкиры, татары...)?

[Samtat]

В этой работе нет глубоких снипов.

[Le_Raffine]

Не удивлюсь если так и окажется

[Le_Raffine]

Просто тюркоязычие скифов всегда считалось маргинальной теорией, но необязательно чтобы предки и потомки говорили на одном языке.

[кылышбай]

2 часа назад, Le_Raffine сказал:

В целом прямые потомки скифов по Y гаплогруппе это таки тюркоязычные народы с R1a1 (башкиры, татары...)?

Q-L330 встречается и у казахов (канглы, кыпчак, есть и найман), узбеков. вообще это большая субклада и она, например, распространена и у кетов, и у селькупов, и в Монголии и Европе встречается. учитывая что скифы обитали в степях и не так давно (славяне, финно-угры, самодийцы уже жили далеко от нее) то найденные у скифов R1a, N и Q скорее предковые для носителей среди совр. тюрков (+монголов)

[Le_Raffine]

9 часов назад, кылышбай сказал:

Q-L330 встречается и у казахов (канглы, кыпчак, есть и найман), узбеков. вообще это большая субклада и она, например, распространена и у кетов, и у селькупов, и в Монголии и Европе встречается. учитывая что скифы обитали в степях и не так давно (славяне, финно-угры, самодийцы уже жили далеко от нее) то найденные у скифов R1a, N и Q скорее предковые для носителей среди совр. тюрков (+монголов)

Интересно, что многие академические историки очень негативно относятся к популяционной генетике. Просто потому что понимают, что эта наука показала, что все во что они верили годами и десятилетиями - полная ерунда.

[Rust]

Они считают, что к популяционной генетике надо относится осторожно. И это правильно, потому-что часто генетики делают далеко идущие выводы.

[Zake]

2 часа назад, Le_Raffine сказал:

Интересно, что многие академические историки очень негативно относятся к популяционной генетике. Просто потому что понимают, что эта наука показала, что все во что они верили годами и десятилетиями - полная ерунда.

Что например оказалось полной ерундой?

[asan-kaygy]

19 часов назад, Samtat сказал:

Samples	Last SNP	Y haplogroup
ARZ-T1	Z93	R1a1a1b2
ARZ-T28	Z93	R1a1a1b2
ARZ-T2	M513	R1a
ARZ-T12	M513	R1a
ARZ-T13	M513	R1a
ARZ-T6	M513	R1a
ARZ-T7	M513	R1a
ARZ-T24	M513	R1a
ARZ-T9	M513	R1a
ARZ-T8		NA
ARZ-T15	M231	N
ARZ-T18	L330	Q1b1a3
ARZ-T19	L330	Q1b1a3
ARZ-T20	L330	Q1b1a3
ARZ-T21	L330	Q1b1a3
ARZ-T23	L330	Q1b1a3
ARZ-T25	L54	Q1b1a

 

 

Хорошие результаты

[Samtat]

10 минут назад, asan-kaygy сказал:

Хорошие результаты

По некоторым из них хотелось бы по точнее знать результат.  

[asan-kaygy]

Согласен

[Samtat]

23 часа назад, Zake сказал:

Что например оказалось полной ерундой?

Ну к примеру устоявшейся научный тезис, что аланы предки современных осетин. Сейчас -это далеко не так однозначно.

[mechenosec]

7 часов назад, Samtat сказал:

Ну к примеру устоявшейся научный тезис, что аланы предки современных осетин. Сейчас -это далеко не так однозначно.

Хорошо, и кто же потомки тех аланов? Тюрки? Тогда почему кыпчаки бросили их перед Джэбэ на Кавказе? 

[asan-kaygy]

11 часов назад, mechenosec сказал:

Хорошо, и кто же потомки тех аланов? Тюрки? Тогда почему кыпчаки бросили их перед Джэбэ на Кавказе? 

не надо все впихивать в устаревшие дихотомические схемы.

Плюс надо помнить, что генетика по прямой мужской линии и языки не всегда пересекаются.

[кылышбай]

30.03.2019 в 13:39, Zake сказал:

Что например оказалось полной ерундой?

что казахи в основном потомки местных кыпчаков, что кыргызы не связаны с енисейскими, что турки и азербайджанцы потомки переселенцев с ЦА, что южные славяне такие же близкие родичи восточных как и западные и т.д. и т.п. (тут везде речь про мужские линии). конечно ученые, которые предполагали об этих выводах генетиков, были и до этого, но их было меньшинство

[Samtat]

I0577 R1a1a1b S441: A10 Arzhan, Russia AldyBel_IA 7th–6th c. BC 427557 M

S441: 7683058G->A; [Additional info: roughly R-YP1456* (but Y29558-) ]

Additional SNPs from Vladimir Tagankin of YFull

[Shamyrat]

Friday, March 29, 2019 в 22:26, Samtat сказал:

Samples	Last SNP	Y haplogroup
ARZ-T1	Z93	R1a1a1b2
ARZ-T28	Z93	R1a1a1b2
ARZ-T2	M513	R1a
ARZ-T12	M513	R1a
ARZ-T13	M513	R1a
ARZ-T6	M513	R1a
ARZ-T7	M513	R1a
ARZ-T24	M513	R1a
ARZ-T9	M513	R1a
ARZ-T8		NA
ARZ-T15	M231	N
ARZ-T18	L330	Q1b1a3
ARZ-T19	L330	Q1b1a3
ARZ-T20	L330	Q1b1a3
ARZ-T21	L330	Q1b1a3
ARZ-T23	L330	Q1b1a3
ARZ-T25	L54	Q1b1a

 

 

То что у скифов много представителей Q показывает что Q немонголоидного происхождения и то что представители  Q и R общего происхождения.

[bektemir2]

10 часов назад, Samtat сказал:

I0577 R1a1a1b S441: A10 Arzhan, Russia AldyBel_IA 7th–6th c. BC 427557 M

S441: 7683058G->A; [Additional info: roughly R-YP1456* (but Y29558-) ]

Additional SNPs from Vladimir Tagankin of YFull

Было бы неплохо не только выкладывать образцы, но и давать какое-то толкование (пояснения)для непосвященной публики. Люди, я думаю,  были бы вам очень благодарны

[Rust]

7 часов назад, Shamyrat сказал:

То что у скифов много представителей Q показывает что Q немонголоидного происхождения и то что представители  Q и R общего происхождения.

Антропология и генетика не коррелируют. У кыргызов основной ген R1a и все они монголоиды.

[bektemir2]

8 часов назад, Rust сказал:

Антропология и генетика не коррелируют. У кыргызов основной ген R1a и все они монголоиды.

Ув. Руст, уверяю вас не все кыргызы монголоиды, примерно 2/3 возможно. Очень много смешанного, чисто европеоидных тоже немало.

[Rust]

Уважаемый Бектемир, антропология точная наука, как математика. Измеряются параметры черепа. Современные кыргызы в большинстве являются представителями южносибирской монголоидной расы. Есть конечно более европеоидные типажи, но это исключение. 

[Samtat]

Результаты палеогенетических исследований

Палеогенетические исследования проводились в специализированной лаборатории исторической генетики Московского физико-технического института. Для исследования в качестве образцов были отобраны и переданы в лабораторию по 1–2 зуба от каждого индивида. Допускалась возможность полной деструкции образцов. В настоящей статье представлены результаты исследования 19 индивидов из могильников Саускен1–7. Основное внимание в работе было уделено исследованиям Y-хромосомной ДНК, которая в отличие от митохондриальной ДНК проявляет большую изменчивость и информативность. Ценность результатов обусловлена ещё и тем, что данных изучения Y-хромосомы из археологических материалов в исследуемом регионе опубликовано сравнительно немного. Генетические исследования для 19 индивидов из могильников урочища Саускен были выполнены с использованием на этапах пробоподготовки и выделения ДНК инновационного подхода, при котором все работы осуществлялись в изолированных перчаточных боксах в атмосфере азота особой чистоты. Для большинства образцов была выделена древняя ДНК высокого качества, что обеспечило возможность проведения полноценного комплексного генетического исследования. Подробно методы работы с исследуемыми образцами описаны в публикации [Килуновская и др., 2022. С. 293–294]. ДНК была успешно выделена для всех исследуемых 19 индивидуумов. Использование набора Quantifiler™Trio (TFS) позволило, в частности, установить, какие образцы ДНК содержат Y-хромосому (мужские образцы), а какие — не содержат (женские образцы). Для всех исследованных, кроме Eerbk-34, 35, 51 и 52, определенная по морфологическим признакам на костях скелетов половая принадлежность была подтверждена (мужской пол); по указанным выше образцам – определена впервые или уточнена (для них пол оказался женским). В таблице 1 представлены количественные результаты анализа качества выделенной ДНК всех исследованных индивидов из могильников Саускен 1–7. Обращает на себя внимание высокая степень деградации древней ДНК у Eerbk-31 и Eerbk-35 по сравнению со значениями у других образцов. Возможно, это связано с состоянием и особенностями конкретных погребений.

Высокая (для древней ДНК) концентрация локусов Y-хромосомы, которая была получена для всех мужских образцов, является важным фактором надёжности результатов микросателлитных исследований ДНК. В таблице 2 представлены результаты фрагментного анализа (гаплотипы по 27-маркерной панели Yfiler™Plus) для 15 мужских образцов. Почти для всех образцов получены полные гаплотипы. Отдельные пропуски в значениях аллелей в гаплотипах присутствуют только для образцов со сравнительно высокой степенью деградации ДНК. Однозначность при фрагментном анализе по аллелям в каждом локусе подтверждает для мужских индивидов отсутствие эндогенной контаминации, что исключительно важно для обеспечения достоверности результатов. Для образцов Eerbk-38 и 39 получены полностью совпадающие Y-хромосомные гаплотипы по 27-маркерной панели. Для пар образцов Eerbk-42 и 49, Eerbk-53 и 55, Eerbk-49 и 55 гаплотипы так же оказались близкими. Совпадение или близость гаплотипов указывает на вероятную родственную связь указанных пар индивидуумов по мужской линии. Для всех исследованных мужских индивидов по гаплотипам с помощью online-инструментариев nevgen.org и hprg.com определены наиболее вероятные гаплогруппы, к которым они могут относиться. Для большинства образцов дополнительно проведено секвенирование c использованием технологии обогащения целевых регионов ДНК по разработанной лабораторией кастомной панели. В частности, осуществлялось обогащение тех участков Y-хромосомы, в которых могут быть обнаружены SNP, определяющие Y-хромосомную гаплогруппу. Полученные в результате NGS Y-хромосомные SNP и гаплогруппы подтвердили результаты микросателлитных исследований. Они представлены в таблице 3.  В таблицах 2 и 3 образцы сгруппированы по принадлежности к разным этапам уюкско-саглынской археологической культуры: ранний, или уюкский (памятники V–IVвв. дон.э.) и поздний, или озен-ала-белигский (III–II вв. дон.э.). Почти для всех исследованных образцов уюкско-саглынской культуры, включая ранний этап, характерна гаплогруппа Q1b-M346 (или её субклады). Эта гаплогруппа, точнее, её субклад Q1b1a3- L330, для 10 исследованных представителей уюкско-саглынской археологической культуры из могильников Эки-Оттуг 1 и 2 оказалась основной и единственной [Килуновская и др., 2023. С.267]. Исключение в настоящем исследовании составляет образец Eerbk-36, для которого выявлена гаплогруппа C2a1a2-M48. Аналогичная гаплогруппа была зафиксирована для образца Eerbk-03 из БайДага 6, в котором наблюдаются погребальные комплексы алды-бельской культуры [Килуновская и др., 2022. С. 295]. Для исследованных образцов озен-ала-белигского этапа уюкско-саглынской культуры характерно генетическое разнообразие. Наряду с индивидуумами, для которых выявлена гаплогруппа Q1b1a3-L330 (Eerbk-42 и 48), основную часть исследованных составляют носители гаплогруппы R1a1a1b2-Z93 (или её подгруппы). Регионы распространения этих гаплогрупп – Средняя и Центральная Азия, Западная и Южная Сибирь. Более подробно, с указанием соответствующих археологических памятников, эта информация приведена в предыдущей работе авторов [Килуновская и др., 2023. С. 297]. Результатом, заслуживающим особого внимания, является гаплогруппа, выявленная для образца Eerbk-54 – I2a1b1-M223. Ареал распространения гаплогруппы I2a – прежде всего, Балканы и Юго-Восточная Европа. Данных о присутствии этой гаплогруппы у скифов очень мало [GuecchiRuscone et al., 2021]. Полученный результат может указывать на наличие контактов между западными и восточными скифами.

https://uavestnik.ru/uploads/pdf_articles/2024_2/3.UAV-24.2(Kilunovskaya).pdf

[Samtat]