Уйгурский ДНК-проект

[Samtat]

Haplotypes for 26 Y-STR loci detected in 100 unrelated males of Uygur from southern Xingjiang, China

http://www.nature.com/article-assets/npg/srep/2016/160204/srep19998/extref/srep19998-s1.pdf

[ZOOTECHNICIAN]

Спасибо. 

я сам в поп-генетике слабо разбираюсь, хотелось бы у знающих людей узнать:

1. про близкое расположение Уйгуров, Монголов, Венгров(!) и некоторых Китайцев HUI.  (по таблице!!!) Что это значит?

2. Можно ли (и на сколько это правомерно?) проецировать эти выкладки на Сюнну и Гуннов. Ну или хотя бы на прародину Венгров до Лыбедии. 

[Samtat]

Большим специалистом не являюсь, но из статьи понял, что данная популяция уйгуров в своём генофонде имеет как европейские, так и азиатские линии гаплогрупп у-хромосомы. Отсюда такое расположение уйгуров относительно других евразийских популяций. К сожалению самих гаплогрупп нет, в статье говорится только о макрогруппах. Но есть гаплотипы, которые можно прогнать через предиктор и определить с некоторой долей вероятности гаплогруппы, характерные для этой популяции уйгур. А затем уже можно самостоятельно сравнить гаплотипы соответствующих гаплогрупп с гаплотипами других этносов, например из базы ФТДНА. Отсюда выяснить, что собой представляет генофонд исследуемых уйгур, к кому конкретно близки европейские линии, а к кому азиатские.

В идеале надо иметь более менее глубокие снипы, подтверждающие гаплогруппы и их субклады, и сами гаплотипы у-хромосомы.

Проецировать, даже предполагать, проблематично. По тем же причинам. ИМХО

[ZOOTECHNICIAN]

Благодарю еще раз. Скачал-скопировал. Научусь разбираться в этом- может сгодится. 

[Samtat]

Что касается хунну, есть результаты дДНК из их захоронений. На картинке показаны : географическое расположение могильников и гаплогруппы у-хромосомы, которые определили в результате исследований:

Если таковые будут иметься у вышеуказанных уйгуров, то можно будет предполагать о каком-то родстве с хуннами. Но этого мало, в дальнейшем следует сравнить гаплотипы, соответствующих гаплогрупп. Чем больше сходства, тем ближе родство.

[ZOOTECHNICIAN]

А я вот на этот сайт иногда поглядываю, чтобы узнать, где и какой палеоДНК:

http://www.ancestraljourneys.org/adnaintro.shtml

[Bas1]

А я вот на этот сайт иногда поглядываю, чтобы узнать, где и какой палеоДНК:

http://www.ancestraljourneys.org/adnaintro.shtml

Явно из дальневосточного котелка.

[Bas1]

Что касается хунну, есть результаты дДНК из их захоронений. На картинке показаны : географическое расположение могильников и гаплогруппы у-хромосомы, которые определили в результате исследований:

Если таковые будут иметься у вышеуказанных уйгуров, то можно будет предполагать о каком-то родстве с хуннами. Но этого мало, в дальнейшем следует сравнить гаплотипы, соответствующих гаплогрупп. Чем больше сходства, тем ближе родство.

Захоронение в Барколе?

[Турист]

Что касается хунну, есть результаты дДНК из их захоронений. На картинке показаны : географическое расположение могильников и гаплогруппы у-хромосомы, которые определили в результате исследований:

Если таковые будут иметься у вышеуказанных уйгуров, то можно будет предполагать о каком-то родстве с хуннами. Но этого мало, в дальнейшем следует сравнить гаплотипы, соответствующих гаплогрупп. Чем больше сходства, тем ближе родство.

Очень интересно. Каким народам свойственна гаплогруппа Q ?

[Samtat]

Очень интересно. Каким народам свойственна гаплогруппа Q ?

http://gentis.ru/info/ydna-tutorial/hg-q

Но желательно определить более точно конкретную ветку(сублинию) гаплогруппы Q, чтобы сравнить с ныне существующими. Есть вероятность, что эта линия тупиковая и не оставила потомков среди наших современников.

[Samtat]

Захоронение в Барколе?

Похоже, что да. Просто не помню встречал ли я хоть какую-то информацию по нему. По трём другим да, а здесь не припоминаю.

[Samtat]

По уйгурам прогнал гаплотипы через предиктор. Брал только ближайшие 12 маркеров. За достоверность не ручаюсь.

DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385ab DYS426(=0) DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458

14 25 13 11 13,20 12 11 12 13 30 16 Q M346(99%)

13 25 15 11 11,14 12 10 12 11 28 15 R1a(100%)

13 24 15 10 12,14 13 12 13 11 29 17 C2 M217(65%)

12 23 14 11 11,12 12 10 14 14 31 18 N1b(93%)

12 24 14 10 14,17 15 11 12 11 28 16 J2b2(91%)

12 24 17 10 14,19 12 13 12 13 28 21 O3a2(99%)

12 23 17 10 12,17 12 12 12 13 27 18 O3a2(96%)

12 24 14 10 11,14 12 12 13 14 29 14 R1b(99%)

13 23 16,17 9 12 12 11 14 11 31 18 ????

13 24 16 10 11,14 12 10 14 11 30 16 R1a(100%)

12 23 15 10 12,17 12 11 12 13 29 16 L1/O3a2

14 24 13 9 15,22 12 10 14 14 30 15 Q M346(100%)

12 24 14 10 13,16 14 11 13 11 29 20 J2a2(98%)

12 24 16 10 13,17 12 10 13 13 31 16 ?????

14 23 15 10 13,14 12 11 12 11 29 17 G2a2

13 25 15 10 11,14 12 10 14 11 32 15 R1a(100%)

12 25 15 11 12,17 12 12 14 13 30 17 O3a1(96%)

13 19 14 11 13 12 13 14 13 30 18 ?????

13 25 15 10 11,14 12 12 13 11 32 15 R1a(100%)

14 23 14 10 11,13 12 10 13 14 31 18 N1c(92%)

13 25 15 11 11,13 12 10 14 11 30 14 R1a(100%)

13 25 13 11 15,17 12 13 13 11 32 19 E1b1b(99%)

13 25 15 11 11,15 12 10 13 11 30 15 R1a(100%)

13 24 16 11 11,20 12 10 13 11 30 15 R1a/D1a

12 25 14 10 13,20 10 12 13 13 28 18 O3a2(100%)

13 23 15 10 12,17 12 12 12 12 29 18 O3a2(87%)

12 23 16 10 13,17 12 12 13 14 28 17 O3a2(65%)

14 23 14 10 11,13 12 10 14 15 30 17 N1c(100%)

13 25 15 10 12,14 12 10 13 11 30 16 R1a(99%)

13 25 15 10 11 12 13 14 7 30 17 ?????

13 24 13 10 14,17 12 12 13 14 31 18 Q M346(99%)

15 23 16 10 11,18 14 11 13 11 29 16 C2e(100%)

13 24 15 9 12 13 11 13 11 30 19 ????

12 24 14 11 11,15 12 13 13 13 29 18 R1b(100%)

12 23 14 11 12,13 12 12 13 13 29 15 R1b(67%)

12 24 14 10 13,16 14 11 14 11 30 19 J2a2(97%)

15 23 15 10 13,17 13 11 13 11 29 16 ???????

12 25 14 10 13,21 12 12 13 14 30 18 Q M346/O3a2

12 23 14 10 13,16 14 11 13 11 29 20 J2a2(80%)

12 23 15 11 12,16 12 12 12 12 28 20 O3a2(98%)

13 25 15 11 11,14 12 10 13 11 30 15 R1a(100%)

13 19 14 11 13 12 12 14 13 29 17 ?????

12 24 17 10 14,20 12 12 12 13 28 18 O3a1(95%)

13 24 16 10 11,13 12 11 14 14 30 15 N1c(65%)

12 22 15 10 9,16 12 13 13 14 29 17 L1c(100%)

13 23 15 11 14,16 12 11 14 11 30 18 G2b(78%)

13 25 15 11 11,15 12 10 13 11 31 15 R1a(100%)

13 23 13 11 14,15 12 12 14 16 31 18 Q M346(72%)

13 23 15 10 14,17 12 12 14 11 31 16 D1b(98%)

12 22 15 11 9,16 12 12 13 15 29 19 L1c(100%)

12 22 16 11 12,16 15 12 12 11 27 15 J2a1(87%)

14 23 15 10 11,18 12 12 14 11 29 17 C2e(100%)

13 26 15 11 11,15 12 10 14 11 32 16 R1a(99%)

13 25 15 10 11,14 12 10 14 11 31 16 R1a(100%)

13 26 15 10 11,15 12 11 13 11 29 15 R1a(100%)

12 24 15 10 12,20 10 13 13 13 29 15 O3a2(100%)

13 23 15 10 13 12 11 14 14 30 15 ????????

13 23 13 10 15,16 12 14 13 14 30 16 Q M346(98%)

[Samtat]

DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385ab DYS426(=0) DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458

13 22 13 10 11,18 12 14 14 15 30 17 Q L275(85%)

13 25 17 11 11,14 12 11 14 11 31 16 R1a(100%)

14 25 17 10 11,14 12 10 13 11 31 14 R1a(100%)

11 22 14 11 13,17 13 13 13 14 29 15 L1a(100%)

13 25 15 10 11 12 12 14 7 30 17 ????????

13 24 15 10 11,14 12 10 13 11 32 15 R1a(100%)

13 20 14 10 12,14 12 12 13 13 30 14 ?????

13 25 15 10 11,14 12 10 14 11 31 16 R1a(100%)

12 23 15 10 12,17 12 12 12 13 29 16 O3a2(65%)

12 24 14 11 14,15 14 12 12 11 29 16 ??????

13 24 17 11 11,14 12 10 13 11 31 17 R1a(100%)

14 23 15 10 13,16 12 10 14 10 29 17 R2(100%)

13 24 15 11 11,15 12 10 14 11 32 15 R1a(100%)

12 23 15 10 13,18 12 12 12 13 29 17 O3a2(87%)

12 24 14 10 13,16 14 11 13 11 29 20 J2a2(98%)

13 25 15 10 11 12 12 14 7 31 17 ????

13 26 15 11 11 12 10 13 11 30 15 ????

14 23 14 10 11,13 12 10 13 14 31 17 N1c(98%)

12 23 14 10 14,19 16 12 14 11 31 15 ????

13 24 15 11 11,14 12 10 13 11 32 15 R1a(100%)

12 24 16 11 11,15 12 10 13 11 30 15 R1a(99%)

12 24 15 10 13,18 12 10 13 13 30 15 L1b(97%)

13 23 13 11 14,15 12 12 15 16 32 18 Q M346(65%)

13 19 15 11 13,14 12 13 14 13 30 17 R1b V88(98%)

12 25 14 11 14 12 13 13 13 29 16 ???????

13 23 14 11 14,18 12 11 14 10 30 15 R2(100%)

13 25 16 11 11,14 12 10 14 11 31 15 R1a(100%)

13 25 16 10 11 12 12 14 7 30 16 ???????

13 23 14 10 14,16 12 11 14 13 32 17 T(99%)

13 24 15 10 12,15 13 12 13 11 29 18 ???????

13 23 13 10 15,16 12 13 13 14 30 16 Q M346(95%)

14 22 15 10 10,21 12 12 13 13 29 19 Ob2(100%)

12 23 14 11 11,12 12 10 14 14 31 18 N1b(94%)

13 23 13 10 15,16 12 13 13 14 30 15 Q M346(99%)

13 24 17 10 14,20 13 12 12 13 28 17 O3a2(78%)

13 25 15 10 11 12 12 14 7 30 16 ??????

13 25 17 10 12 14 10 13 11 29 18 ??????

13 24 15 11 13,24 12 11 13 13 30 15 Oa2(84%)

12 24 14 10 12,13 10 11 13 14 28 15 O3a2(100%)

12 22 15 10 14,16 12 11 14 11 30 20 H(98%)

12 24 14 10 13,16 14 11 13 11 29 20 J2a2(98%)

[Samtat]

Здесь есть интересная статья, где комментируют линии гаплогруппы Q с использованием результатов дДНК:

Уважаемый Nimissin на Молгене тоже поделился своим мнением по предикции уйгурских гаплотипов:

http://forum.molgen.org/index.php/topic,8791.msg330258.html#msg330258

стр.36 :

http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/149/171

[asan-kaygy]

6 гаплотипов из коммерческого проекта

274414 Mr. Sabitov Kachluk (Kashgar uigur) C-M217 C3-Starcluster

13 25 16 10 12-12 11 14 10 13 11 29

185649  Khamrayev KZ uigur Kazakhstan C-M217 C3-Starcluster

14 25 16 10 12-13 11 14 10 13 11 29 18 8-8 11 12 26 14 22 27 11-11-12-15 10 10 22-23 15 13 17 16 33-36 11 10

K1857 Tudiyarov J2

12 24 15 10 13-16 11 14 11 14 11 30 18 9-9 11 11 19 15 19 29 14-14-16-19 11 10 19-22 15 13 17 18 32-34 11 10 11 7 15-16 8 10 10 8 11 9 13 21-21 15 10 12 13 14 9 13 23 21 13 14 10 13 12 12 12 11

277594 Ashimov R1a

13 25 15 10 11-14 12 12 10 13 11 31 16 9-10 11 11 25 14 20 32 12-15-15-16 11 11 19-23 15 16 21 20 35-39 12 11 11 8 17-17 8 12 10 8 11 10 12 22-22 15 10 12 12 13 8 14 23 21 12 13 11 13 11 11 12 13

421426  Kibirov Valihan, Kashgar, 18?? China R1a

13 25 15 11 11-14 12 12 10 14 11 32

K1823 Yakupov R1a

13 25 17 10 11-14 12 12 10 13 11 31 15 9-9 11 11 24 14 20 37 12-15-15-15 11 11 19-23 16 14 19 18 34-37 12 11 11 9 17-17 8 11 10 8 12 10 12 22-22 15 10 12 12 13 8 14 23 21 12 12 11 13 10 11 12 13

[asan-kaygy]

https://www.familytreedna.com/public/uigurs/default.aspx?section=yresults

[asan-kaygy]

Y-STR гаплотипы узбеков, уйгуров, таджиков, пуштунов, хазарейцев, моголов из базы данных Family Tree DNA

Жаксылык Сабитов, Нурбол Баймуханов

 

Abstract

 

В данном сообщении вводятся в научный оборот Y-STR гаплотипы узбеков, уйгуров, таджиков, пуштунов, хазарейцев, моголов из базы данных Family Tree DNA. 37 гаплотипов были исследованы авторами статьи. Остальные 81 гаплотип публиковались ранее другими авторами, либо лежат в открытом доступе в базах данных Family Tree DNA. В статье исследованы также данные по роду барлас, разные части которого относятся к разным этносам (узбеки, моголы). Аргументирована мысль об изначальной принадлежности барласов к субкладу С2-F4002 (старкластер).

Ниже, в Приложении 1, приведены гаплотипы, использованные в этой работе. 

http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/156/182

[Samtat]

Это может не так "критично", но:

DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385ab DYS426 DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458

12 24 14 10 14-17 0 15 11 12 11 28 16 |J2b2(91%)уйгур

12 24 14 10 14-17 11 15 11 12 11 28 17 |66138 Peter Zwiefka, b.1855, Wroclow, Poland

[Samtat]

https://www.familytreedna.com/public/uigurs/default.aspx?section=yresults

Гаплотипы из проекта и работы:

DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385ab DYS426 DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458

13 25 15 10 11-14 12 12 10 13 11 31 16 277594 Ashimov

13 25 15 10 11,14 0 12 10 14 11 31 16 R1a(100%)

13 25 15 10 11,14 0 12 10 14 11 31 16 R1a(100%)

13 25 15 11 11-14 12 12 10 14 11 32 421426 Kibirov

13 25 15 10 11,14 0 12 10 14 11 32   R1a(100%)

13 25 15 11 11-14 12 12 10 13 11 30 433098 YUNCU

13 25 15 11 11,14 0 12 10 13 11 30   R1a(100%)

[Samtat]

[Kenan]

R1a1-Z93 как у османов, башкир и татаров? 

[Samtat]

Cубклады уйгуров R1a1-Z93 неизвестны. По крайней мере, я такими данными не располагаю, но предполагаю, что может быть да.

[Samtat]

J2a2-PH3085,SK1403: Ancient Altai, modern Uygur and Turkish

http://j2-m172.info/2015/06/j2a2-ph3085-sk1403-ancient-altai-modern-uygur-turkish/

 

Результат дДНК с  сары-бельского кургана определил гаплогруппу J2a2 , аналогичную линию данной гаплогруппы нашли у современных турка и уйгура.

Похожие гаплотипы есть и в работе, указанной в начале темы.

 

12 24 14 10 13,16   14 11 13 11 29 20                        

12 24 14 10 13,16   14 11 13 11 29 20

[asan-kaygy]

У части казахских кыпчаков эта гаплогруппа

[Samtat]

Гаплотип, на который ссылается автор:

J-M410 U2 Uyghur

DYS393 DYS390 DYS394/19 DYS391 DYS385 DYS426 DYS388 DYS439 DYS389a DYS392 DYS389B DYS458 DYS459 DYS455 DYS454 DYS447 DYS437 DYS448 DYS449 DYS464 DYS460 YGATAH4 YCAII DYS456

12 24 14 10 13-16 11 14 11 13 11 16 20 9-9 11 11 18 15 19 28 14-14-16-19 11 20 19-22 15

Взял лишь ближайшие локусы к панели ФТДНА.