Перейти к содержанию
asan-kaygy

Узбекский ДНК-проект

Рекомендуемые сообщения

Опубликовано

Новый представитель G-L830 - узбек родом из Жалпак-тобе (Казахстан).

По преданию стариков, предок протестированного в 4 или 5 поколении был усыновленным киргизом во время голодомора, по другой версии он был узбеком жившим среди казахов.

Аутосомная ДНК протестированного показывает максимальную близость к узбекам Ферганской долины.

  • Thanks 1
Опубликовано

Узбек из Тахара

R1b → R-M478 → R-BY40441

По данным исследования 2012 года [1], у узбека с кодом образца 26 из провинции Тахар определена гаплогруппа R-BY40441, общий предок современных носителей которой жил около 4600 г. до н. э. Современные представители линии разделяются на две основные ветви: R-BY13053, более распространённую среди степных и среднеазиатских народов, и R-BY67329, встречающуюся преимущественно среди кавказских и европейских популяций.

Палеогенетические образцы данной линии чаще всего фиксируются среди степных популяций, включая сарматов, тюрков и монголов.

 

ПалеоДНК образцы
⚱️🇨🇳 Dongtalede 36
 (Алтай Железного века, 755 - 420 гг. до н. э.)
⚱️🇷🇴 Pogorăști 10 / Târgșor 118
 (сарматы, 43 г. до н. э. - 205 г. н. э.)
⚱️🇰🇿 Pavlodar 92 (кочевник Железного века, 51 г. до н. э. - 204 г. н. э.)
⚱️🇲🇳 Tavan 5 (монгол, 1300 - 1400 гг. н. э.)
Источник: https://t.me/uzbekdna
Опубликовано

Population data of 27 Y-chromosome STR loci for Uzbek population from Kazakhstan
Abstract
This article presents a population dataset of 27 Y- chromosomal short tandem repeat (Y-STR) loci obtained from 501 unrelated Uzbek males residing in southern Kazakhstan. Samples were collected from four geographic locations: Saryagash District (N = 79), Sayram District (N = 213), Taraz (N = 70), and Turkistan (N = 139). Genotyping was performed using the Yfiler™ Plus PCR Amplification Kit, and the resulting profiles were used to estimate haplotype frequencies, forensic parameters, and interpopulation genetic relationships. A total of 424 distinct haplotypes were identified, and summary diversity metrics were calculated for each regional group and for the pooled dataset. The overall haplotype diversity reached 0.9991, while discrimination capacity was 0.85. Allele frequency distributions for 23 single-copy loci and allele combination frequencies for multi-copy loci are provided, together with information on microvariants, null alleles, and copy number variations. Predicted haplogroup assignments derived from Y-STR haplotypes, AMOVA outputs, pairwise Rst matrices, median-joining networks, and multidimensional scaling plots based on overlapping marker sets for comparative populations, are included as part of the dataset. Haplogroup prediction based on Y-STR haplotypes showed that the paternal gene pool is mainly represented by haplogroups R1a (21.6%) and C2 (21.4%), followed by J2, R1b, N1, O2, and Q. These data expand the representation of Central Asian populations in forensic and population-genetic reference datasets and provide a resource for future studies of paternal lineage diversity, forensic reference data, interpopulation comparison, and comparative analyses of Y-chromosomal variation in Central Asia.

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340926003665?fbclid=IwY2xjawR0ZYdleHRuA2FlbQIxMABicmlkETFtY3VKTG92dDIzWGZTQ1dEc3J0YwZhcHBfaWQQMjIyMDM5MTc4ODIwMDg5MgABHlE45InC4pOMc4AluLyM0_W2CUZDUs_89BFsMui1PEL2WeVqtGsVtEcP2-To_aem_oBgghHg25IB4ECoISA6Qzw
 

Опубликовано

Работы так теряют свою информативность. Поп.генетики в этом плане уже отстают от палеогенетиков) 

Опубликовано

Погребение Кашкарчи, Ферганская область, Узбекистан.

Образцы:
I4153
Датировка: 1200–1000 гг. до н. э.
Пол: мужчина.
Y-ДНК: R-M417.
Покрытие на 1.15M аутосомных целевых позициях: 0.7055x.
Примечание: образец имеет низкое покрытие, поэтому его следует использовать с осторожностью.

I4255
Датировка: 1200–1000 гг. до н. э.
Пол: мужчина.
Y-ДНК: R-Z93.
Покрытие на 1.15M аутосомных целевых позициях: 2.7135x.

Публикация: Narasimhan, Vagheesh M., et al. 2019. “The Formation of Human Populations in South and Central Asia.” Science 365 (6457):  https://www.science.org/doi/10.1126/science.aat7487
---

Таштыкская культура, Оглахтинский могильник, могила 4.
Образцы:
KE9609 - мужчина; WGS-покрытие: 2.89x.
LC8544 - женщина; WGS-покрытие: 3.44x.
Y-ДНК:
KE9609: R-Y39884
Датировка:
Радиоуглеродная могилы 254–306 гг. н. э.

Источник: Nedoluzhko, Artem V., et al. 2022. “First Ancient DNA Analysis of Mummies from the Post-Scythian Oglakhty Cemetery in South Siberia.” Research Square. https://europepmc.org/article/ppr/ppr537431


Размер SNP-панели: 584,131 SNP.
Общее количество образцов в панели: 711.

 

 

pca-PC1-PC2.png

 

 

 

 

 

genetic-similarity-dendrogram.png

Опубликовано
50 минут назад, olley сказал:

Погребение Кашкарчи, Ферганская область, Узбекистан.

Образцы:
I4153
Датировка: 1200–1000 гг. до н. э.
Пол: мужчина.
Y-ДНК: R-M417.
Покрытие на 1.15M аутосомных целевых позициях: 0.7055x.
Примечание: образец имеет низкое покрытие, поэтому его следует использовать с осторожностью.

 

I4153 опубликован как R-M417, вероятно, из-за консервативной классификации при низком покрытии Y-хромосомы. Повторно проверил  BAM и AADR 1240K и проверка показала  более глубокое положение - R-Z645. Ниже R-Z645 образец пока не может быть надежно отнесен ни к R-Z93, ни к R-Z283/Z282.

Для публикации сообщений создайте учётную запись или авторизуйтесь

Вы должны быть пользователем, чтобы оставить комментарий

Создать аккаунт

Зарегистрируйте новый аккаунт в нашем сообществе. Это очень просто!

Регистрация нового пользователя

Войти

Уже есть аккаунт? Войти в систему.

Войти


×
×
  • Создать...