Казахский ДНК-проект

[Samtat]

Спасибо, если будет возможность дополнить инфу за ранее благодарен.

[asan-kaygy]

Какую именно инфу?

[Samtat]

Уточнить выданную.

[Samtat]

Аsan-kaygy, а других албанов вы не тестировали. Я так понимаю у вышеуказаных R1a1 458+. Кто у них в совпаденцах?

Далеко ли будут от них татары: 262802 Sharafutdinov,255242 Ibragimov ?

[Samtat]

Один видимо точно албан.

[asan-kaygy]

  В 20.01.2014 в 09:51, Samtat сказал:

Аsan-kaygy, а других албанов вы не тестировали. Я так понимаю у вышеуказаных R1a1 458+. Кто у них в совпаденцах?

Далеко ли будут от них татары: 262802 Sharafutdinov,255242 Ibragimov ?

У албанов С3 старкластер преобладает.

[Samtat]

Я в принципе так и думал. А где можно посмотреть выборку? Вышеуказанные выходит "туристы"?

[asan-kaygy]

  В 20.01.2014 в 13:58, Samtat сказал:

Я в принципе так и думал. А где можно посмотреть выборку? Вышеуказанные выходит "туристы"?

Выборки научные и не опубликованные.

2 С3 опубликованы в статье по казахам, остальные научные 5 или 6 все С3

[Samtat]

Что интересно у кубанских ногайцев эта ветвь R1a1(м458) достигает 18%, судя по работе ТЮРКИ КАВКАЗА...(Р.А. Схаляхо и др.)

[Samtat]

Аsan-kaygy смотрю спорите на МолГене. У меня возник вопрос. Там прозвучала мысль,что при всей внешней схожести гаплотипов существует вероятность того, что они могут относится к разным ветвям. Схожесть объясняется гомоплазией. И без снипов подтвердить или опровергнуть эту схожесть невозможно. Какова при этом вероятность этой схожести(или различия), 50/50 ? На Ваш взгляд.

[asan-kaygy]

  В 21.01.2014 в 15:32, Samtat сказал:

Аsan-kaygy смотрю спорите на МолГене. У меня возник вопрос. Там прозвучала мысль,что при всей внешней схожести гаплотипов существует вероятность того, что они могут относится к разным ветвям. Схожесть объясняется гомоплазией. И без снипов подтвердить или опровергнуть эту схожесть невозможно. Какова при этом вероятность этой схожести(или различия), 50/50 ? На Ваш взгляд.

Зависит от конкретного гаплотипа или гаплогруппы. Где то четко можно кластеры и субклады выделять на 12 маркерах, а где-то и 67 не понятно какой субклад.

[Samtat]

Ну  скажем гаплогруппа  R1a1. Применительна ли к вышеуказанным албанам вероятность гомоплазии?

[asan-kaygy]

  В 21.01.2014 в 16:38, Samtat сказал:

Ну  скажем гаплогруппа  R1a1. Применительна ли к вышеуказанным албанам вероятность гомоплазии?

К сожалению не спец по этой гаплогрупппе и характерных маркерах для разных субкладов.

[Samtat]

Жаль конечно. Но по сути получается, что в каждом отдельном случае подход индивидуальный . Ещё такой вопрос, реально ли отстроить нынешний предиктор, чтобы он указывал точнее субклады или ветви гаплогрупп? Урасин не планирует внести обновления?

[asan-kaygy]

  В 21.01.2014 в 16:56, Samtat сказал:

Жаль конечно. Но по сути получается, что в каждом отдельном случае подход индивидуальный . Ещё такой вопрос, реально ли отстроить нынешний предиктор, чтобы он указывал точнее субклады или ветви гаплогрупп? Урасин не планирует внести обновления?

Не в случае а в гаплогруппе и субкладе.

По предиктору слишком много инфы надо вносить, плюс она быстро дополняется и устаревает, поэтому эти обновления будут бесконечными.

[Samtat]

Да я понял, что в гаплогруппе, но индивидуально. Тогда так, по гаплотипам  какой гаплогруппы легче строить прогноз ? По какой из них,зная значения определённых локусов, можно с минимальной погрешностью определить субклад? 

 

По предиктору всё-таки стоит уже вносить обновления, именно потому, что информация устаревает. 

[Samtat]

 

  В 21.01.2014 в 16:15, asan-kaygy сказал:

Зависит от конкретного гаплотипа или гаплогруппы. Где то четко можно кластеры и субклады выделять на 12 маркерах, а где-то и 67 не понятно какой субклад.

 

Вернусь к прежнему вопросу. Гаплотипы каких гаплогрупп чаще других подвержены явлению гомоплазия ? Какие из них сложнее отнести к определённому субкладу сравнивая лишь значение локусов.

[Samtat]

Аsan-kaygy, извините если забрасываю Вас вопросами. Я ведь к чему спрашиваю, если вообще смысл обращать внимание на положение того или иного гаплотипа в ФТДНА проектах когда он ещё не проснипирован? Т.е. не сделав снипа его забивают в ту или иную подгруппу гаплотипов, определённой ветви. Тот же пример проект ФТДНА R1a1. Или как говорится доверять, но проверять?

[asan-kaygy]

  В 21.01.2014 в 18:28, Samtat сказал:

 

 

Вернусь к прежнему вопросу. Гаплотипы каких гаплогрупп чаще других подвержены явлению гомоплазия ? Какие из них сложнее отнести к определённому субкладу сравнивая лишь значение локусов.

 

N1c1 сложнее по ветвям разобрать.

[asan-kaygy]

  В 22.01.2014 в 04:02, Samtat сказал:

Аsan-kaygy, извините если забрасываю Вас вопросами. Я ведь к чему спрашиваю, если вообще смысл обращать внимание на положение того или иного гаплотипа в ФТДНА проектах когда он ещё не проснипирован? Т.е. не сделав снипа его забивают в ту или иную подгруппу гаплотипов, определённой ветви. Тот же пример проект ФТДНА R1a1. Или как говорится доверять, но проверять?

Обычно знатоки могут предположить с высокой долей вероятности субклад, но иногда сомневаются и предлагают сделать апгрейд.

[Samtat]

Т.е в принципе в проектах ФТДНА распределяют гаплотипы верно. Но исключать "но" никто не может.

[asan-kaygy]

Да.

[asan-kaygy]

240748

13 25 16 10 11-14 12 12 11 13 11 29

из рода кожа - R1a1

[asan-kaygy]

240731

J2

12 25 15 10 15-16 11 15 12 13 11 31

240749

R1a1a

13 25 16 10 11-14 12 12 10 13 11 30

240720

G

14 23 14 10 13-14 11 12 12 13 11 31

240729

R1a1a

14 24 16 11 12-14 12 12 11 13 11 30

[JALAIR]

  В 23.01.2014 в 17:35, asan-kaygy сказал:

 

240731

J2

12 25 15 10 15-16 11 15 12 13 11 31

240749

R1a1a

13 25 16 10 11-14 12 12 10 13 11 30

240720

G

14 23 14 10 13-14 11 12 12 13 11 31

240729

R1a1a

14 24 16 11 12-14 12 12 11 13 11 30

 

А кто они по родам?

Жаке по жалаирам можете сделать пост с обобщением результатов. Есть новые данные и хоть что-нибудь по жалаирам Монголии и АРВМ?