Результаты анализов древних ДНК

[Samtat]

Предположу J2a2 ,  шансов конечно меньше, чем у  R1a.

[ZOOTECHNICIAN]

 

Делаем ставки на результат...

Предполагаю предка современных кыргызов — R1a

 

Я бы не удивился Z93 и т.д., если честно. 

 

А вот как покажут анализы что-нибудь на тему  С3-М217, вот это будет интересно.

 

P/S/ ... если это не девочка, конечно. 

[Мадьяр]

Предположу J2a2 ,  шансов конечно меньше, чем у  R1a.

Мне тоже кажется что будет из гаплогруппы J

[кылышбай]

Останки Золотого человека отправлены в Данию для определения пола https://tengrinews.kz/kazakhstan_news/ostanki-zolotogo-cheloveka-otpravlenyi-daniyu-opredeleniya-293513/

а если окажется не принцом, а принцессой?) а так интересно было б узнать гаплогруппу. предположительно к какой культуре относятся останки золотого человека: усуни, кангюи или саки?

[asan-kaygy]

Отправили давно, ждем результатов

[asan-kaygy]

Еще одна публикация с древним ДНК из Европы "Ледникового периода"

The genetic history of Ice Age Europe

 

    Qiaomei Fu,   Cosimo Posth,   Mateja Hajdinjak,   Martin Petr,   Swapan Mallick,   Daniel Fernandes,   Anja Furtwängler,   Wolfgang Haak,   Matthias Meyer,   Alissa Mittnik,   Birgit Nickel,   Alexander Peltzer,   Nadin Rohland,   Viviane Slon,   Sahra Talamo,   Iosif Lazaridis,   Mark Lipson,   Iain Mathieson,   Stephan Schiffels,   Pontus Skoglund,   Anatoly P. Derevianko,   Nikolai Drozdov,   Vyacheslav Slavinsky,   Alexander Tsybankov,   Renata Grifoni Cremonesi   et al.

 

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature17993.html

 

Abstract

 

Modern humans arrived in Europe ~45,000 years ago, but little is known about their genetic composition before the start of farming ~8,500 years ago. Here we analyse genome-wide data from 51 Eurasians from ~45,000–7,000 years ago. Over this time, the proportion of Neanderthal DNA decreased from 3–6% to around 2%, consistent with natural selection against Neanderthal variants in modern humans. Whereas there is no evidence of the earliest modern humans in Europe contributing to the genetic composition of present-day Europeans, all individuals between ~37,000 and ~14,000 years ago descended from a single founder population which forms part of the ancestry of present-day Europeans. An ~35,000-year-old individual from northwest Europe represents an early branch of this founder population which was then displaced across a broad region, before reappearing in southwest Europe at the height of the last Ice Age ~19,000 years ago. During the major warming period after ~14,000 years ago, a genetic component related to present-day Near Easterners became widespread in Europe. These results document how population turnover and migration have been recurring themes of European prehistory.

[Samtat]

Гаплогруппа R1b в бассейне реки Луга по результатам ДНК-типирования костных останков плохой сохранности у деревни Извоз

 

Чекунов Михаил Константинович

Выпускник (специалист)

Санкт-Петербургский государственный университет, Институт истории,

Санкт-Петербург, Россия

E-mail: micha_chek@mail.ru

 

В течение полевого сезона 2015 г. было проведено исследование палео-ДНК человеческих останков, обнаруженных на месте грунтового могильника у д. Извоз во время мониторинга памятников историко-культурного наследия в бассейне р. Луга. Работы проводила группа исследователей под руководством сотрудников отдела охранной археологии ИИМК РАН С.А. Семенова и С.А. Васильева. Данный могильник известен с 1974 г., когда он был обследован четвертым отрядом Староладожской археологической экспедиции ЛОИА АН СССР, работавшей под руководством Е.А. Рябинина [3]. На момент фиксации памятника в 1974 г. площадь могильника определялась скоплением разрозненных человеческих костей из разрушенных погребений, в беспорядке разбросанных по песчаной поверхности ѕкарьераї. В 1982 г. место могильника было осмотрено В.П. Петренко [2], а в изданной в 1990 г. В.А. Лапшиным "Археологической карте Ленинградской области. Часть 1" , памятник учтён как "Извоз. Грунтовый могильник" и датирован эпохой Средневековья [1]. Целью настоящего исследования стало изучение нескольких фрагментов человеческих костей из грунтового могильника Извоз методами палеогенетики и этногеномики. Особенности геномного полиморфизма изучали путем анализа полиморфных ДНК-маркеров Y-хромосомы в пробах, принадлежащих останкам мужских скелетов (половая принадлежность останков была определена с помощью ДНК-технологий). Генотипирование SNP-маркеров (single nucleotide polymorthism) Y-хромосомы позволило установить, что трое из четырех мужчин из могильника Извоз являются представителями гаплогруппы R1b.

 

Такой результат вызывает оосбый интерес, поскольку вероятность обнаружения представителей данной гаплогруппы в этом регионе оценивается в 1-2% [4]. По современным представлениям [5,6] носители гаплогруппы R1 (по Y-хромосоме) в ледниковый период (20 тыс.лет назад) заселяли территорию современной Европы. В результате продвижения ледников популяция оказалась разделена. Те из них, кто обосновался на территории Испании, с началом потепления 10-15 тыс. лет назад расселились по Западной Европе как носители гаплогруппы R1b, а представители другого субклада R1a развили индоевропейскую экспансию на запад и восток 68 тыс. лет назад. Проведение исследования осложнялось крайне плохой сохранностью костного материала. Не смотря на это, вышеупомянутые результаты были получены и перепроверены. Факт нахождения носителей гаплогруппы R1b в погребениях могильника Извоз может стать первой вехой в процессе изучения палеоэтнической истории бассейна р. Луга.

 

http://lomonosov-msu.ru/archive/Lomonosov_2016/data/8419/uid17076_report.pdf

[кылышбай]

https://tengrinews.kz/science/drevnim-voinam-jenschine-prinadlejat-ostanki-naydennyie-294139/

R1b или R1a?)

[asan-kaygy]

https://tengrinews.kz/science/drevnim-voinam-jenschine-prinadlejat-ostanki-naydennyie-294139/

R1b или R1a?)

не делали

[Samtat]

5. Анализ генетической связи между потомками протоказахской популяции аргын и древними костными останками гуннского периода из Венгрии

Приоритет 5. Интеллектуальный потенциал страны

5.1. Фундаментальные и прикладные научные исследования в области социально-экономических и гуманитарных наук

5.1.3 Актуальные проблемы социальных и общественно-гуманитарных наук и междисциплинарные исследования.

Научный руководитель: к.б.н., доцент Джансугурова Л.Б.

Объем финансирования на 2015 год – 4 627, 750 тыс.тенге.

Лаборатория молекулярной генетики

Результаты: Проведены аналитические исследования и осуществлены экспедиции по уточнению родовой принадлежности, произведен сбор нового биоматериала, представляющего современных аргын (89 человек, из них 15 женщины). Проанализированы останки гуннского периода, хранящиеся в Венгерском музее естественной истории, произведен забор образцов костной ткани для палео-генетического исследования. Проведено выделение ДНК и генотипирование популяции современных казахов рода аргын, определены гаплотипы Y-хромосомы. Проведено антропологическое исследование объекта гунского периода из Венгерского музея естественной истории (г. Будапешт, Венгрия). Выделены и охарактеризованы ДНК из древних костных останков.

 

http://iggc.kz/otchet-po-rezultatam-nauchnoj-i-finansovo-xozyajstvennoj-deyatelnosti-rgp-institut-obshhej-genetiki-i-citologii-kn-mon-rk-za-2015-g/

 

8. Программа «Изучение этногенетической истории населения Казахстана»

(Изучение популяционно – генетической структуры современного населения Казахстана; Палеогенетические исследования)

Направление «Народ в потоке истории на 2014-2016гг.»

Исполнители: лаборатория популяционной генетики

Научный руководитель: Джансугурова Л.Б.

         

Результаты: Проведен анализ проблемы становления культур сакского облика на территории Восточного Казахстана, изучены антропологические особенности археологической находки «Урджарская принцесса» (погребение Тасарык, Урджарский район Восточно-Казахстанской области, 2012 г.). Проведен осмотр древних костных останков и сделаны спилы фрагментов костной ткани для палеогенетического исследования (4 фрагмента). Проведено выделение палео-ДНК из древних костных останков гунского периода, взятых из Венгерского музея естественной истории. Пробное генотипирование показало возможность наличия гаплотипа L Y-хромосомы. В связи с этим освещена проблема возникновения и существования позднесарматской  культуры, джетыасарской культуры и населения среднего течения Сырдарьи и Таласа в общем движении гуннов с Востока на Запад. В связи с планируемым палеогенетическим изучением находки энеолитического периода с поселения Ботай, проведен анализ антропологических данных «Ботайских»  черепов в  контексте проблемы формирования  физического облика населения  степной полосы Евразии.

С целью сбора нового материала, представляющего современное население Казахстана был совершен ряд экспедиционных выездов для сбора биоматериалов  в Атыраускую, Мангистаускую, Акмолинскую, Карагандинскую, Северо-Казахстанскую области и Павлодарскую области., собраны биологические образцы от 202 человек, представляющих казахские семьи различной родовой принадлежности. Проведено выделение ДНК современных казахов. Образцы ДНК охарактеризованы количественно и качественно. 100 человек были генотипированы по 17 STR-локусам Y-хромосомы.

http://iggc.kz/otchet-po-rezultatam-nauchnoj-i-finansovo-xozyajstvennoj-deyatelnosti-rgp-institut-obshhej-genetiki-i-citologii-kn-mon-rk-za-2015-g/

 

 

[asan-kaygy]

Maternal Genetic Ancestry and Legacy of 10th Century AD Hungarians

Aranka Csosz, Anna Szecsenyi-Nagy, Veronika Csakyova, Peter Lango, Viktoria Bodis, Kitti Kohler, Gyongyver Tomory, Melinda Nagy, Balazs Gusztav Mende
doi: http://dx.doi.org/10.1101/056655 

Abstract

The ancient Hungarians originated from the Ural region in today's central Russia and migrated across the Eastern European steppe, according to historical sources. The Hungarians conquered the Carpathian Basin 895-907 AD, and admixed with the indigenous communities. Here we present mitochondrial DNA results from three datasets: one from the Avar period (7-9th centuries) of the Carpathian Basin (n = 31); an almost four-fold enlarged dataset from the Hungarian conquest-period (n=101); and one from the contemporaneous Hungarian-Slavic contact zone (n = 23). We compare these mitochondrial DNA hypervariable segment sequences and haplogroup results with other ancient and modern Eurasian data. Whereas the analyzed Avars represents a certain group of the Avar society that shows East and South European genetic characteristics, the Hungarian conquerors' maternal gene pool is a mixture of West Eurasian and Central and North Eurasian elements. Comprehensively analyzing the results, both the linguistically recorded Finno-Ugric roots and historically documented Turkic and Central Asian influxes had possible genetic imprints in the conquerors' genetic composition. Our data allows a complex series of historic and population genetic events before the formation of the medieval population of the Carpathian Basin, and the maternal genetic continuity between 10-12th centuries and modern Hungarians.

http://biorxiv.org/content/early/2016/06/02/056655

[asan-kaygy]

Появились тезисы конференции Society for Molecular Biology and Evolution Conference 2016, 3-7 июля 2016: http://smbe2016.org/program/

Из интересного:

Геном ранненеолитической женщины из юго-западного Ирана, гор Загрос. Генетически она близка кавказским охотникам-собирателям, а не анатолийским земледельцам, несмотря на то что принадлежала земледельческой группе. 

The Neolithic Revolution developed among geographically adjacent but genetically distinct populations (35146)

Marcos Gallego Llorente 1 , Sarah Connell 2 , Eppie Jones 1 , Deborah Merrett 3 , Yeonsu Jeon 4 , Anders Eriksson 1 , Veronika Siska 1 , Cristina Gamba 2 , Christopher Meiklejohn 5 , Robert Beyer 1 , Sungwon Jeon 4 , Yunsung Cho 4 , Michi Hofreiter 6 , Jong Bhak 4 , Andrea Manica 1 , Ron Pinhasi 2

University of Cambridge, Cambridge, CAMBRIDGESHIRE, United Kingdom

School of Archaeology and Earth Institute, University College Dublin, Belfield, Dublin, Ireland

Department of Archaeology, Simon Fraser University, Burnaby, BC, Canada

The Genomics Institute, Ulsan National Institute of Science and Technology (UNIST), Ulsan, South Korea

Department of Anthropology, University of Winnipeg, Winnipeg, MB, Canada

Evolutionary Adaptive Genomics, Institute for Biochemistry and Biology, Department of Mathematics and Natural Sciences, University of Potsdam, Potsdam, Germany

The shift from hunter-gathering to food production, the so-called Neolithic Revolution, profoundly changed human societies. Whilst much is known about the mode of spread of people and domesticates into Europe during the Neolithic period, the origin of this cultural package in the Ancient Near East and Anatolia is poorly understood. By sequencing the whole genome (1.39x) of an early Neolithic woman from Ganj Dareh, in the Zagros Mountains of Iran, we show that the eastern part of the Ancient Near East was inhabited by a population genetically most similar to hunter-gatherers from the Caucasus but distinct from the Neolithic Anatolian people who later brought food production into Europe. Despite their key role in developing the Neolithic package, the inhabitants of Ganj Dareh made little direct genetic contribution to modern European populations, suggesting they were somewhat isolated from other populations in this region. Their high frequency of short runs of homozygosity, comparable to other early Neolithic farmers, suggests that they overwintered the Last Glacial Maximum in a climatically favourable area, where they may have received a genetic contribution from a population basal to modern Eurasians. Thus, the Neolithic package was developed by at least two genetically-distinct groups which coexisted next to each other, implying a degree of cultural yet little genetic exchange among them.

Два охотника-собирателя, но уже с керамикой, 5700 лет до н.э., из российско-корейского пограничья. Более всего сходны с коренным населением Приамурья, например с ульчами, но есть более отдалённое сходство и с корейцами и японцами. Предоположительно это может означать более плавный переход к земледелию в Восточной Азии по сравнению с Европой.

The Neolithic in Northeast Asia in light of a 7,700 year-old genome (34323)

Veronika Siska 1 , Eppie Ruth Jones 1 , Tatiana Balueva 2 , Jong Bhak 3 , Daniel G. Bradley 4 , Yunsung Cho 5 , Anders Eriksson 1 , Marcos Gallego Llorente 1 , Michi Hofreiter 6 , Sungwon Jeon 3 , Hakmin Kim 3 , Hyunho Kim 5 , Kyusang Lee 3 , Ron Pinhasi 7 , Elizaveta Veselovskaya 2 , Andrea Manica 1

University of Cambridge, Cambridge, United Kingdom

Institute of Ethnology and Anthropology Russian Academy of Science, Moscow, Russia

The Genomics Institute, Ulsan National Institute of Science and Technology, Ulsan, Republic of Korea

Smurfit Institute of Genetics, Trinity College Dublin, Dublin, Ireland

Theragen BiO Institute, TheragenEtex, Suwon, Republic of Korea

Institute for Biochemistry and Biology, Faculty for Mathematics and Natural Sciences, University of Potsdam, Potsdam-Golm, Germany

School of Archaeology and Earth Institute, University College Dublin, Dublin, Ireland

Ancient genomes have revolutionised our understanding of Holocene prehistory in Western Eurasia, but Asia has received limited attention. Here we report genomic data from two individuals from an early Neolithic site, Devil’s Gate (7742-7638 cal years before present) in East Asia, on the border between Russia and Korea. These hunter-gatherers are genetically most similar to geographically close populations from the Amur Basin, in particular the Ulchi, implying a high level of continuity in this region over most of the Holocene. Japanese and Koreans, who live further south, also showed genetic affinity to Devil’s Gate; both these modern day populations were best described as mixes of a population close to Devil’s Gate, likely the ancestral hunter-gatherers who inhabited that region, and modern populations from southern China and South-East Asia, possibly linked to the onset of the Neolithic around 8,000 years ago in the region. Thus, in contrast to Western Eurasia, East Asia experienced a higher degree of continuity, with little input in the northern regions and an integrations of incoming farmers and local hunter-gatherers further south.

 

[Samtat]

Maternal Genetic Ancestry and Legacy of 10th Century AD Hungarians

Интересно уДНК когда-нибудь будут ?

[asan-kaygy]

Не знаю.

[кылышбай]

случайно прочитал про культуру хуншань, на юге манчжурии, недалеко от пекина (5 тыс. лет до н.э.). вроде как есть результаты ДНК и там нашли микс-гаплогрупп: С, N, O и D. кто нибудь что нибудь знает?

http://bmcevolbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2148-13-216

[ZOOTECHNICIAN]

случайно прочитал про культуру хуншань, на юге манчжурии, недалеко от пекина (5 тыс. лет до н.э.). вроде как есть результаты ДНК и там нашли микс-гаплогрупп: С, N, O и D. кто нибудь что нибудь знает?

http://bmcevolbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2148-13-216

По Хуншань это очень интересно, Спасибо за ссыль. 

 

Есть очень интересная статья про этот период, но регион "Северная Двина". Не менее интересно, но встречается R1a (M17?)

http://www.archeo.ru/izdaniya-1/vagnejshije-izdanija/pdf/archaeoloy_of_lake_settlements_2014.pdf/view

Статья: 

Первые результаты генотипирования коренных жителей и человеческих костных останков из археологических памятников Верхнего Подвинья

[Balkin]

Цитата

Возвращаемся к Чингисхану. Тут Ж.М.Сабитов сторонник точки зрения, что Чингисхан был представителем StarCluster из гаплогруппы С2а3[9]+F4002[10], другие точки зрения по умолчанию Ж.М.Сабитовым относятся к наивным. На чем основано мнение, что Чингисхан был представителем StarCluster из гаплогруппы С2а3+F4002? В конце 1990-х Спенсер Уэллс руководил несколькими экспедициями на родину Чингисхана, в степи и горы Центральной Азии, по результатам экспедиций пришли к выводу, что около 16 млн. человек представители одного субклада из гаплогруппы С[11]. На основании этого был сделан вывод что это «ген Чингисхана». Ни тебе тестирования потомков Чингисхана от разных его сыновей, не палео-днк, — ничего. Но миф прочно укоренился, особенно этот миф понравился «политологам» вроде Ж.М.Сабитова. Позднее подсчитали более точно и возраст субклада StarCluster С2а3+F4002, — это около 1 000 с небольшим лет назад. Вспомнили историю, что Чингисхан то жил в XII-XIII вв.! Тогда StarCluster стали относить к предкам Чингисхана.

Цитата

Тем не менее, миф, что Чингисхан был из субклада С2а3+F4002 StarCluster — прочно живёт, подтвердится ли он или нет — неизвестно. Пока же очевиден вывод, а именно: мнение о том, что Чингисхан из субклада С2а3+F4002 по сути своей — является гипотезой, как и то, что Чингисхан был представителем субклада R1b+M269. Но вместо этого вывода, мы видим слабые потуги «политологов» вроде Ж.М.Сабитова, желающих внушить и убедить читателей, что миф «Чингисхан это С2а3+F4002 StarCluster» — это реальность, а вот все остальные мнения — наивны. Гипотеза о «гене Чингисхана» как о субкладе С2а3+F4002 у Ж.М.Сабитова безоговорочно считается единственно верной. С оппонентами же у Ж.М.Сабитова можно решать вопрос проще, прикрепить им ярлык наивности и для надежности приписать им свою отсебятину.

 

[кылышбай]

неужели нет ни одного останка подтвержденного чингизида на всем пространстве от крыма до монголии чтобы протестировать его?

[Samtat]

Если Гиреи в самом деле Чингизиды, то можно их тестировать. В Казани один молодой учёный Аникеев хотел сделать тест из кремлевских захоронений. Участвовал в распределении грантов, в том числе и на свой проект. Но не знаю получил ли он его.

[Samtat]

Название его проекта:Установление гаплотипов Y-хромосомы в погребениях из Мавзолея Казанского кремля.

[asan-kaygy]

47 минут назад, кылышбай сказал:

неужели нет ни одного останка подтвержденного чингизида на всем пространстве от крыма до монголии чтобы протестировать его?

Тестировали как современных Чингизидов так и останки Абулхаир-хана казахского

[asan-kaygy]

Если Гиреи в самом деле Чингизиды, то можно их тестировать. В Казани один молодой учёный Аникеев хотел сделать тест из кремлевских захоронений. Участвовал в распределении грантов, в том числе и на свой проект. Но не знаю получил ли он его.

они кажется там только мито делали

[asan-kaygy]

3 часа назад, Balkin сказал:

 

Вы реально согласны с тем человеком о том, что башкирские бурзяне это борджигины?

Тот человек ни одного чингизида или нируна не тестировал, я массу их протестировал

[Samtat]

2 минуты назад, asan-kaygy сказал:

они кажется там только мито делали

Это было давно, а здесь в 2014 году подавали заявку на грант.

[asan-kaygy]

2 минуты назад, Samtat сказал:

Это было давно, а здесь в 2014 году подавали заявку на грант.

Интересно