Y-ДНК
По Y-ДНК памирские киргизы Таджикистана и Афганистана значительно отличаются от киргизов Киргизии и не похожи ни на одну исследованную популяцию Средней Азии. Главное отличие - 24% гаплогруппы N-P43.
Это можно сформулировать и так, что географически удаленные популяции киргизов (Киргизии и Таджикистана-Афганистана) оказались генетически сходны, различия между ними связаны лишь соотношением центрально-азиатских и сибирских гаплогрупп. Так, у киргизов Тянь-Шаня преобладает степное влияние на генофонд, а на высокогорном (4000 м над уровнем моря) плато Памира степные влияния слабее, и поэтому у памирских киргизов лучше сохранились свидетельства сибирского происхождения киргизов, проявляющиеся в высокой частоте (до 25%) «сибирской» гаплогруппы N1a2b (P43).
Гаплогруппа N1a2b (ранее N1b) определяется мутацией P43. Предполагается, что N1a2b возникла 4500 — 10 000 лет назад на территории Саян или поблизости.
Эта Y-хромосомная гаплогруппа распространена у народов уральской группы, тюрков, монголов. До 2008 года носила название N2.