Монгольский ДНК-проект

[asan-kaygy]

Вроде нет по идее. Саму статью еще не прочитал полностью.

[Samtat]

Там вроде С3 анализируют. 

[Samtat]

В этой старой работе Малярчука есть гаплотипы С3, по казахам, алтайцам, калмыкам, бурятам и монголам:

 

http://www.nature.com/jhg/journal/v57/n10/suppinfo/jhg201293s1.html

[asan-kaygy]

Там вроде С3 анализируют. 

Один субклад C2b-M407

[Samtat]

Там вроде С3 анализируют.

Один субклад C2b-M407

Только в работе используется старая номенклатура : C3-M407 и C3*-M217.

[Samtat]

там есть информация по R1a1a (как я помню)?

Вот тут есть два гаплотипа:

Работа относительно старая, но в ней есть приложение с гаплотипами туркмен, узбеков, пуштунов, монгол , кыргызов и таджиков:

Afghan Hindu Kush: Where Eurasian Sub-Continent Gene Flows Converge

http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0076748#pone.0076748.s014

[Samtat]

В работе Андерхила один из этих гаплотипов отнесли к Z2125, другой к M780(L657).

[Samtat]

Analysis of 17 Y-STR loci haplotype and Y-chromosome haplogroup distribution in five Chinese ethnic groups

http://onlinelibrary.wiley.com/wol1/doi/10.1002/elps.201500089/abstract

В работе есть 100 17-ти маркерных гаплотипов монгол. Файл эксел:

http://onlinelibrary.wiley.com/wol1/doi/10.1002/elps.201500089/suppinfo

[Samtat]

По этой выборке получились такие результаты:

[Samtat]

[Samtat]

[Kenan]

Значит O и C основные галпогруппы у монголов.

О3а2 наверное в большинстве своем монгольские найманы? 

[Samtat]

Сейчас посмотрел гаплотипы О3а2 казахов и монголов, схожести почти нет.ИМХО Если у казахов гаплотипы идут в один один строем, то у монголов гаплотипы однородны гораздо меньше.

[Samtat]

Предиктор по-моему ошибочно определил монгольский гаплотип как R1b Z2103

13 19 14 11 13,13 0 0 13 14 13 30

13 19 14 11 13-13 12 12 13 14 13 31

Нижний гаплотип из татарского проекта R1b-М73

[Le_Raffine]

Сейчас посмотрел гаплотипы О3а2 казахов и монголов, схожести почти нет.ИМХО Если у казахов гаплотипы идут в один один строем, то у монголов гаплотипы однородны гораздо меньше.

 

А С2/С3?

[Samtat]

Напоминаю я не специалист. . Возможно отдельные гаплотипы или их ряд имеет близость, и есть общие линии, определяющие родство монголов и казахов. Ситуация с С3 мне кажется аналогичной с О3, вероятно я не прав, но чтобы знать однозначно нужно иметь более длинные гаплотипы. К примеру, вот ряд гаплотипов монголов и казахов:

Haplotype Count DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385 DYS426 DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458

Монголы:

Ht6 1_ 13 24 16 10 12,12 0 0 10 13 11 29 19 C2-M217

Ht9 1_ 13 24 16 9 12,12 0 0 11 13 11 29 17 C2-M217

Ht28 1 13 24 16 9 12,12 0 0 11 13 11 29 17 C2-M217

Ht32 1 13 24 16 9 12,12 0 0 12 13 11 29 17 C2-M217

Ht34 1 13 24 16 9 12,12 0 0 11 13 11 29 16 C2-M217

Ht95 1 13 24 16 9 12,12 0 0 11 14 11 30 18 C2-M217

Казахи:

H50 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 28 18 C2-M217

H51 1_ 13 24 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217

H52 1_ 13 24 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217

H53 2_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217

H54 4_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 17 C2-M217

H55 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217

H56 11 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217

H57 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 11 13 11 29 18 C2-M217

H58 1_ 13 26 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 19 C2-M217

H59 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 14 11 30 18 C2-M217

Я взял по группе гаплотипов каждого этноса однородных более-менее внутри каждой группы и между группами.

Гаплотипы на первый взгляд имеют сходство, но по значению ряда локусов отличаются. Например по локусу DYS385: у монголов он равен 12-12, а у казахов 12-13.

[Samtat]

А вот о сходстве:

Монголы:

Ht59 1 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 19 C2-M217

Ht93 1 13 25 16 10 12,13 0 0 11 13 11 29 18 C2-M217

Казахи:

H50 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 28 18 C2-M217

H53 2_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217

H55 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217

H56 11 13 25 16 10 12,13 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217

H57 1_ 13 25 16 10 12,13 0 0 11 13 11 29 18 C2-M217

Эти два гаплотипа монголов определённо близки гаплотипам казахов.

[Samtat]

И ещё:

Ht45 1 13 25 16 10 12,14 0 0 10 13 11 29 19 C2-M217(монгол)

H60_ 2 13 25 16 10 12,14 0 0 10 13 11 29 18 C2-M217(казахи)

Но не стоит забывать, что есть вероятность того, что увеличивая кол-во маркеров(локусов) может увеличится и расхождение между гаплотипами.

[Bas1]

Насколько помню у адаев 12-12. Речь об этих 12-12?

[Samtat]

Не в курсе. Здесь я привёл гаплотипы казахов Китая.В этой выборке С2-М217 нет DYS385=12-12.

[Bas1]

Если сравнивать по алшинскому кластеру, то внутри него тоже есть расхождение 12-12 и 12-13, однако это не считается дальним расхождением. Так и по старкластеру также не сильно отдаляет.

[Samtat]

Посмотрите другие локусы, там тоже есть расхождения. Например DYS390 и DYS391. Три шага на 12-ти маркерах уже показатель определённой закономерности, не 100%-ой , но всё же.

Тут видна некая тенденция, показывающая степень родства, что не мешает этим гаплотипам входить в старкластер или алшынский кластер.

[Samtat]

Y-chromosome lineage in five regional Mongolian populations

Toshimichi Yamamoto *, Tomoki Senda, Daiki Horiba, Masayoshi Sakuma,

Yuuka Kawaguchi, Yuuichi Kano

http://www.fsigeneticssup.com/article/S1875-1768(13)00134-0/pdf

[Шад]

Y-chromosome lineage in five regional Mongolian populations

Toshimichi Yamamoto *, Tomoki Senda, Daiki Horiba, Masayoshi Sakuma,

Yuuka Kawaguchi, Yuuichi Kano

http://www.fsigeneticssup.com/article/S1875-1768(13)00134-0/pdf

 

Загадочная статья. Непонятно что авторы именуют Q1b. Причем письменные запросы игнорируют. 

[Samtat]

Жаль, что нет дополнительных материалов. У них в качестве ссылочных материалов стоит:Hierarchical Y-SNP assay to study the hidden diversity and phylogenetic relationship of native populations in South America

Может оттуда взяли данные?