Y-dnk лошадей

[Shamyrat]

Появились исследования Y-dnk лошадей.Согласно им большинство лошадей мира потомки арабских и ахал-текинских лошадей.Основную информацию можно почитать в этой ссылке:https://www.seeker.com/earth/animals/almost-all-horses-today-are-descendants-of-arabian-and-central-asian-stallions

А это одна часть из этой публикации: They included a Connemara pony, South German draft horse, English thoroughbred, Warmblood Trakehner, Arabian, Icelandic horse, Lipizzan, Norwegian fjord horse, Shetland pony, Sorraia horse, Warmblood Oldenburg, Warmblood Swiss, Morgan horse, Standardbred, American Quarter Horse, Warmblood Baden Wurttemberg, Warmblood Holsteiner, Warmblood Hanoverian, Warmblood Bavarian, Warmblood Westphalian, French Montagne, Przewalski’s horse, and a donkey.The thoroughbred American Pharoah won the Belmont Stakes and the first Triple Crown since 1978 at Belmont Park in 2015.Mike LizziWallner explained that mutations to the Y chromosome accumulate over time, such that males originating from a common patrilineal ancestor will share a particular collection of Y chromosome mutations forming what is called a haplogroup. These can be difficult to identify, which has hampered past efforts to reconstruct the history of stallions.For the new study, the scientists overcame prior challenges by using deep, next-generation DNA sequencing. This allowed them to identify even the smallest changes to the 52 Y chromosomes included in the research.RELATED: Horses Never Forget Human FriendsCombining this chromosome data with written records, the scientists determined that, apart from a few Northern European haplotypes, all modern horse breeds included in the study clustered into a 700-year-old haplogroup. It mostly originated from the Original Arabian lineage of horses from the Arabian Peninsula and the Turkoman horse lineage from the steppes, or grasslands, of Central Asia.“The purest descendant of the Turkoman horse today is the Akhal-Teke,” Wallner noted.

[Steppe Man]

Лошади народа хунну: генотипирование и определение масти

Куслий Мария Александровна

Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, г. Новосибирск, Россия

E-mail: kusliy.maria@mcb.nsc.ru

В настоящее время собраны большие коллекции костных останков древних лошадей из погребальных комплексов на территории Сибири, относящихся к разным историческим эпохам. На уровне ДНК эти уникальные образцы практически не исследованы. Анализ митохондриальных геномов и ядерных генов, ассоциированных с фенотипом, дает возможность определить генетический состав популяций лошадей и филогеографические связи между ними.

Для выделения древней ДНК был использован метод сорбции ДНК на силике, для биотинилирования митохондриального генома и генов окраски - метод ник-трансляции. Было проведено обогащение полученных нами библиотек фрагментов древней ДНК биотинилированными зондами и их секвенирование на платформе MiSeq.

В ходе работы была выделена ДНК из костей 6 лошадей из могильника Царам, элитного комплекса хуннских захоронений (I в. до н.э. - I в. н.э.). Были получены 6 обогащённых библиотек. Секвенировав митохондриальные геномы, мы определили гаплогруппы лошадей хунну по классификации Achilli и их место на филогенетическом древе современных лошадей. Согласно полученным результатам, все древние лошади относятся к гаплогруппе Е, которая встречается среди современных лошадей породы мареммано из Италии. Мы определили, что две лошади хунну принадлежали серой масти, а остальные имели дикую окраску (гнедую или вороную масти). Была построена филогенетическая сеть по последовательностям первого гипервариабельного района митохондриального генома древних и современных лошадей Монголии, Тывы и Бурятии и древних лошадей народа хунну. Исследуемые лошади, как было выявлено, по классификации Cieslak относятся к гаплотипу X3, который является предковым для гаплогруппы X3 современных лошадей Монголии, Тывы, Бурятии.

Было выяснено, что в I в. до н.э. - I в. н.э. серая масть была распространена среди одомашненных лошадей народа хунну. Это позволяет заключить, что именно по этой масти в хуннских племенах происходил искусственный отбор лошадей. По филогенетической сети было определено, что исследуемые лошади являются предками современных лошадей Бурятии, Монголии, Тывы, принадлежащих к гаплогруппе Х3. На основании построенного нами филогенетического древа, был также сделан вывод, что древние лошади хунну и современные лошади породы мареммано являются родственными ветвями эволюции.

[Shamyrat]

Анализ ДНК показывает, что все домашние лошади происходят от сравнительно небольшого числа диких жеребцов, входивших в одну и ту же популяцию. А вот кобылы для этого использовались самые разные. Вероятно, с распространением коневодства в каждом регионе люди использовали для получения потомства местных диких кобыл. Крупное исследование,проведенное в 2012 году, в ходе которого были секвенированы геномы 300 лошадей различных пород, а также учтены данные предыдущих исследований по митохондриальной и Y-хромосомной ДНК и свидетельство археологических источников, привело авторов к выводу, что лошади были первоначально одомашнены в западной части евразийских степей. Впоследствии, как уже говорилось, домашняя популяция неоднократно пополнялась генами от диких кобыл из самых разных регионов. Возможно, независимый центр приручения лошади существовал на Пиренейском полуострове, но это предположение пока не смогли ни подтвердить, ни опровергнуть.Однако по-прежнему многие неизвестно об истории конкретных пород лошадей, поэтому генетические исследования лошади продолжаются. Изучение истории лошадей облегчается наличием племенных книг, которые конезаводчики вели на протяжении многих поколений. Но такая практика в Европе началась только в 1700-х годах, так что о более ранней истории лошадей надо судить по данным, полученным в ходе секвенирования ДНК. Нынешнее исследование проведено большой группой ученых из Австрии, Швейцарии, Германии, Швеции и США, которую возглавила Барбара Валлнер (Barbara Wallner) из Университета ветеринарной медицины в Вене. Результаты их работы опубликованы в журнале Current Biology.Валлнер и ее коллеги сочетали изучение старых племенных книг с генетическим методом. Авторы работы описали десятки вариаций сегмента Y-хромосомы у 52 современных жеребцов, принадлежащих к 21 различной породе. Поскольку эти мутации содержатся в Y-хромосоме, они наследуются всем мужским потомством жеребца, позволяя проследить, какие кони от какого предка происходят.Предположив, что новое поколение лошадей появляется в среднем за семь лет, и основываясь на скорости мутаций, Валлернер и ее коллеги определили, что самый последний общий предок 18 современных пород жил около 700 лет назад. Родство с остальными трех оставшихся пород оказалось более отдаленным. К этим трем породам относятсяшетлендский пони,норвежская фиордская иисландская лошади.На втором этапе исследования группа ученых включила в рассмотрения 363 жеребцов, представляющих 57 современных пород (то есть одной пятой всех признанных современных пород лошадей), получив в итоге обширную схему Y-хромосомных линий. Оказалось, что почти все современные лошади восходят к двум линиям азиатского происхождения. Одна из них – арабские лошади, родина которых Аравия. Вторая – ныне исчезнувшие древниетуркменские лошади. Самыми близкими из современными потомками, сохранившими многие их внешние признаки, являются современные породы лошадей Туркменистана:ахалтекинская, йомудская, гокланская и нохурлийская.В течение сотен лет европейские коннозаводчики отмечали, что жеребцы арабские и туркменские дают потомство с высокими качествами, поэтому они неоднократно использовали этих лошадей для улучшения местных пород, пока эти две линии не стали практически повсеместными. Сегодня они образуют патрилинейную основу почти каждой современной породы лошадей.Для многих пород их происхождение от арабских и туркменских истоков и так было известно. Таковы, например, английская чистокровная верховая лошадь и орловский рысак. Для выведения последней породы граф Алексей Орлов специально закупал в Османской империи племенных жеребцов, а непосредственным родоначальником ее считается арабский жеребец Сметанка, купленный у турецкого султана. Для других же пород наличие арабских и/или туркменских (ахалтекинских) кровей оказалось сюрпризом для ученых и для специалистов по коневодству. К таким породам относятся, например, липпицианская лошадь (выведена в словенском поселке Липица на границе с Италией) или фрайбергер (порода из округа Франш-Монтань в швейцарском кантоне Юра).

[Shamyrat]

Учитывая то что и арабские кони считаются потомками туркменских коней,то можно сказать большинство коней мира по отцовской линии потомки нисийских или как еще назывались небесных коней. 

[Shamyrat]

"Арабская порода действительно была выведена на Аравийском полуострове племенами кочевых арабов-бедуинов. Первые лошади, похожие по типу на арабских, были известны еще в античные времена — около 2500 тысяч лет назад. Эти лошади еще не являлись самостоятельной породой, но отличались от других животных характерным типом телосложения: невысоким ростом, сухой конституцией, высоко поднятым хвостом. Невысокий рост и сухость — качества, характерные для всех пород засушливых районов, а хорошо развитая репица (корень хвоста), из-за которой он кажется поднятым, свойственна лошадям восточных пород, в первую очередь ахалтекинским. Таким образом, ахалтекинские и арабские лошади имеют общих предков."

"Завоевав Ирак, Иран, Египет, Испанию, Сирию и Северную Африку, арабы получили в свое распоряжение отличных азиатских лошадей: туркменских, персидских и др. Это дает все основания полагать, что данные пополнения Аравии ценными лошадьми позволили получить генетический материал, воплощенный в современной арабской лошади. Таким образом, можно сделать вывод, что арабская порода была создана в IV—VII веках н.э."

"Ахалтеки́нская ло́шадь, илиахалтеки́нец (туркм. Ahal-teke aty), — верховая породалошадей, выведенная на территории современнойТуркмении (Ахал-Теке) предположительно около 5000 лет назад. Это древнейшая изкультурных пород, оказавшая влияние на многие породы —арабскую, чистокровную верховую (или английскую скаковую, англ. Thoroughbred) и другие."

[Shamyrat]

В исторических источниках не упоминаются о том что арабы имели какую то особо примечательную лошадь.Но постоянно упоминаются нисийские кони: Геродот сообщал: «Есть вМидии равнина Несея, где водятся величественные кони»[2][5][8]. Под Несеей, по-видимому.

Только после арабского завоевания Хорасана у них появляются хорошие лошади.Возможно в этом сыграло свою роль то что в гвардии Халифата хорасанские тюрки играли основную роль.

[кылышбай]

1. Скифские лошади.

Для расшифровки генома было отобрано 11 лошадей из захоронения в Казахстане (Берель) и 2 с Алтая (Аржан). Анализ ДНК показал возраст – от 2300 до 2700 лет, а возможности прослеживать географическое распространение ДНК в исторической ретроспективе помогли установить, что 4100 лет назад в районе современного российского города Челябинска проживал общий предок этих 13 жеребцов. Этот период в истории Сибири ученые называют временем культуры Сынтасты (Синташта). Она подарила миру первый образец универсальной в применении двухколесной брички, где тягловой силой были прирученные лошади.

История коневодства начинается примерно 5500 лет назад. Анализ извлеченных из скифских усыпальниц останков лошадей и сравнение их с современными скакунами показал, что за последние 2300 лет случился демографический коллапс. В результате в глобальном поголовье одомашненных лошадей произошло значительное сокращение генетической диверсификации. Т. е. за этот период человечество имело тенденцию незримо, но постоянно сокращать круг и количество жеребцов-производителей до такой степени, что практически все одомашненные лошади сегодня в прямом смысле являются носителями идентичной, если не очень похожей Y-ДНК. В скифских поголовьях лошадей сосуществовало много Y-хромосом – это обеспечивало большое разнообразие здоровых мужских линий. Так было первые три тысячи лет коневодства. Потом эта практика в течение двух последних тысяч лет сокращалась. Это способствовало накоплению в геноме лошади вредоносных мутаций. Мутаций, которые подрывают физические природные характеристики животного. Но ранние этапы одомашнивания лошадей, т. е. времена культур Ситашты и скифов такими отклонениями не отличались. Как сказано выше, анализ останков скифских жеребцов показал сильное генетическое отличие не в пользу современности. Об этом чуть подробней – в мире широко распространена гипотеза «издержек одомашнивания». Согласно ей, приручение диких животных влечет генетическую нагрузку на них, что в свою очередь способствует выработке и накапливанию генетических мутаций. Следовательно, у скифов, как считает группа, были какие-то секреты, в результате применения которых скифское коневодство составило исключение из общего правила «издержек одомашнивания». Вопрос этот открыт и подлежит дальнейшему длительному изучению.

Все 11 скакунов из казахстанского могильника (Берель) не приходились друг другу родичами, что говорит о том, скифы могли или активно торговать конями, или же отбирать только самых красивых и быстрых лошадей для сопровождения умерших вождей в иной мир. Другое объяснение этому — скифы не вмешивались в нормальную жизнь табунов своих лошадей, что помогало им избегать вырождения и близкородственного скрещивания.

Все это, как отмечают ученые, ставит под сомнение устоявшееся представление о том, что все современные лошади происходят от одного или нескольких предков, чья численность была крайне малой. По всей видимости, потеря генетического разнообразия произошла не в процессе одомашнивания, а уже после него, около 2,3  тысячи лет назад, когда селекционеры древнего мира начали выводить идеальные, на их взгляд, породы.

2. Филогенетическое дерево TreeMix показывает связь между древними образцами из Якутии и Таймыра (синий цвет), современными якутскими лошадьми (коричневый), лошадьми Пржевальского (зеленый) и современными породами (красный): 

 

[Steppe Man]

 

[құйрықит батыр]

http://asiarussia.ru/news/19029/

[Peacemaker]

 

 

Quote

The origins of Chinese horse

Chinese ancient horses were more related to the modern Mongolian horses. As a result, our results do not support the previous hypothesis that early Chinese domestic horses were derived from the Przewalski horse.

Китайские древние лошади были больше связаны с современными монгольскими лошадьми. Наши результаты не подтверждают предыдущую гипотезу о том, что ранние китайские домашние лошади были получены от лошади Пржевальского.

http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/download;jsessionid=D0D477BCEB53C08E3A65A6BF2F2552D7?doi=10.1.1.674.6638&rep=rep1&type=pdf