Изначально авторы первых памятников тюрки и уйгуры были нносителями йокающих диалектов,так и пошла литературная традиция.
Аномалия это или нет трудно судить,НО!если мы взглянем на относительно чистые сибирские тюркские ,то там и йокащих то нету:тувинский,хакасский-чокающие,алтайский-дёкающий,джокающий,скорее всего -диалектно уже было разграничения,однако койне было -йокающим