ДНК-проект: общие вопросы

[Шад]

Гаплогруппа Q1b: вдоль Великого Шелкового пути

 

http://goo.gl/WEWGn7

[asan-kaygy]

Quantitating and Dating Recent Gene Flow between European and East Asian Populations

Pengfei Qin, Ying Zhou,Haiyi Lou, Dongsheng Lu, Xiong Yang,Yuchen Wang, Li Jin, Yeun-Jun Chung, Shuhua Xu
 

Цитировать

Historical records indicate that extensive cultural, commercial and technological interaction occurred between European and Asian populations. What have been the biological consequences of these contacts in terms of gene flow? We systematically estimated gene flow between Eurasian groups using genome-wide polymorphisms from 34 populations representing Europeans, East Asians, and Central/South Asians. We identified recent gene flow between Europeans and Asians in most populations we studied, including East Asians and Northwestern Europeans, which are normally considered to be non-admixed populations. In addition we quantitatively estimated the extent of this gene flow using two statistical approaches, and dated admixture events based on admixture linkage disequilibrium. Our results indicate that most genetic admixtures occurred between 2,400 and 310 years ago and show the admixture proportions to be highly correlated with geographic locations, with the highest admixture proportions observed in Central Asia and the lowest in East Asia and Northwestern Europe. Interestingly, we observed a North-to-South decline of European gene flow in East Asians, suggesting a northern path of European gene flow diffusing into East Asian populations. Our findings contribute to an improved understanding of the history of human migration and the evolutionary mechanisms that have shaped the genetic structure of populations in Eurasia.

 

http://www.nature.com/srep/2015/150329/srep09500/full/srep09500.html
http://www.nature.com/srep/2015/150329/srep09500/extref/srep09500-s1.pdf

[asan-kaygy]

Дмитрий Адамов, Жаксылык Сабитов Расчет TMRCA казахских родов The Russian Journal of Genetic Genealogy. Volume 7, No 2 (2015). C.14-19.

http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/155

https://www.academia.edu/15130584/%D0%A0%D0%B0%D1%81%D1%87%D0%B5%D1%82_TMRCA_%D0%BA%D0%B0%D0%B7%D0%B0%D1%85%D1%81%D0%BA%D0%B8%D1%85_%D1%80%D0%BE%D0%B4%D0%BE%D0%B2_The_Russian_Journal_of_Genetic_Genealogy._Volume_7_No_2_2015_._C.14-19

[asan-kaygy]

Chao Ning et al.

Abstract

The human Y-chromosome haplogroup O-M134 is one of the most abundant paternal lineages in East Asian populations, comprising ~13% of Han Chinese males, and also common in Kazakh, Korean, Japanese, Thai and so on. Despite its considerable prevalence, its current substructure is poorly resolved with only one downstream marker (M117) previously investigated. Here we address this deficiency by investigating some single-nucleotide polymorphisms (SNPs) previously reported being potentially associated with O-M134 based on high-throughput DNA-sequencing data. Using a panel of 1301 Chinese males we first identified 154 haplogroup O-M134 subjects. We then investigated the phylogenetic structure within this haplogroup using 10 SNPs (F444, F629, F3451, F46, F48, F209, F2887, F3386, F1739 and F152). Two major branches were identified, O-M117 and O-F444 and the latter was further divided into two main subclades, O-F629 and O-F3451, accounting for 10.84 and 0.92% of the Han Chinese, respectively. This update of O-M134 diversification permits better resolution of male lineages in population studies of East Asia.

http://www.nature.com/ejhg/journal/vaop/ncurrent/abs/ejhg2015183a.html

[Tynych]

[elimkaz]

 

скажите пожалуйста носители гаплогруппы С3 (С2) в Европе на кого похожи? и ваши r1a и r1b в Азии. и как связать гаплогруппы с антропологией людей.

[Tynych]

скажите пожалуйста носители гаплогруппы С3 (С2) в Европе на кого похожи? и ваши r1a и r1b в Азии. и как связать гаплогруппы с антропологией людей.

гаплогруппа с антропологией,насколько мне известно,никак не связаны..Арийи(R1а)выглядят монголоидами и наоборот..И,кстати,видеоролик не мой..и R1a и R1b не мои,а общие..

[asan-kaygy]

Reconstructing Genetic History of Siberian and Northeastern European Populations

Anton Valouev, Emily HM Wong, Andrey Khrunin, Larissa Nichols, Dmitry Pushkarev, Denis Khokhrin, Dmitry Verbenko, Oleg Evgrafov, James Knowles, John Novembre, Svetlana Limborska

Posted October 18, 2015.

Abstract

Siberia and Western Russia are home to over 40 culturally and linguistically diverse indigenous ethnic groups. Yet, genetic variation of peoples from this region is largely uncharacterized. We present whole-genome sequencing data from 28 individuals belonging to 14 distinct indigenous populations from that region. We combine these datasets with additional 32 modern-day and 15 ancient human genomes to build and compare autosomal, Y-DNA and mtDNA trees. Our results provide new links between modern and ancient inhabitants of Eurasia. Siberians share 38% of ancestry with descendants of the 45,000-year-old Ust-Ishim people, who were previously believed to have no modern-day descendants. Western Siberians trace 57% of their ancestry to the Ancient North Eurasians, represented by the 24,000-year-old Siberian Malta boy. In addition, Siberians admixtures are present in lineages represented by Eastern European hunter-gatherers from Samara, Karelia, Hungary and Sweden (from 8,000-6,600 years ago), as well as Yamnaya culture people (5,300-4,700 years ago) and modern-day northeastern Europeans. These results provide new evidence of ancient gene flow from Siberia into Europe.

http://biorxiv.org/content/early/2015/10/18/029421

http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2015/10/18/029421.full.pdf

Supplementary Information:
http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2015/10/18/029421.DC1/029421-1.pdf

Supplementary Figures and Tables:
http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2015/10/18/029421.DC1/029421-2.pdf

[asan-kaygy]

Y-STR гаплотипы узбеков, уйгуров, таджиков, пуштунов, хазарейцев, моголов из базы данных Family Tree DNA

Жаксылык Сабитов, Нурбол Баймуханов
 

Цитировать

В данном сообщении вводятся в научный оборот Y-STR гаплотипы узбеков, уйгуров, таджиков, пуштунов, хазарейцев, моголов из базы данных Family Tree DNA. 37 гаплотипов были исследованы авторами статьи. Остальные 81 гаплотип публиковались ранее другими авторами, либо лежат в открытом доступе в базах данных Family Tree DNA. В статье исследованы также данные по роду барлас, разные части которого относятся к разным этносам (узбеки, моголы). Аргументирована мысль об изначальной принадлежности барласов к субкладу С2-F4002 (старкластер).
Ниже, в Приложении 1, приведены гаплотипы, использованные в этой работе.

 

http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/156

[Samtat]

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ КОСТНЫХ ОСТАНКОВ ИЗ НЕКРОПОЛЯ ХАН МОЛАСЫ

Реконструкции по костным останкам :

 

Слева - №178; справа - №92. Первая выполнена российскими антрополагами(Нечвалода), вторая венгерскими.

[enhd]

 

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ КОСТНЫХ ОСТАНКОВ ИЗ НЕКРОПОЛЯ ХАН МОЛАСЫ

Реконструкции по костным останкам :

 

Слева - №178; справа - №92. Первая выполнена российскими антрополагами(Нечвалода), вторая венгерскими.

 

вообще-то реконструкция по черепу не очень точная система как я думаю. Все зависит от фантазии человека который лепит из тесто.

[Timur]

 

 

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ КОСТНЫХ ОСТАНКОВ ИЗ НЕКРОПОЛЯ ХАН МОЛАСЫ

Реконструкции по костным останкам :

 

Слева - №178; справа - №92. Первая выполнена российскими антрополагами(Нечвалода), вторая венгерскими.

 

вообще-то реконструкция по черепу не очень точная система как я думаю. Все зависит от фантазии человека который лепит из тесто.

 

Когда-то где-то читал, что при реконструкции внешности по черепу процентов 20 - это фантазия реконструктора, остальное довольно точно. Но, возможно, эти 20% как раз создают общее впечатление.

[asan-kaygy]

http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0139705

[Бахтияр]

Y-STR гаплотипы узбеков, уйгуров, таджиков, пуштунов, хазарейцев, моголов из базы данных Family Tree DNA

Жаксылык Сабитов, Нурбол Баймуханов

 

Цитировать

 

В данном сообщении вводятся в научный оборот Y-STR гаплотипы узбеков, уйгуров, таджиков, пуштунов, хазарейцев, моголов из базы данных Family Tree DNA. 37 гаплотипов были исследованы авторами статьи. Остальные 81 гаплотип публиковались ранее другими авторами, либо лежат в открытом доступе в базах данных Family Tree DNA. В статье исследованы также данные по роду барлас, разные части которого относятся к разным этносам (узбеки, моголы). Аргументирована мысль об изначальной принадлежности барласов к субкладу С2-F4002 (старкластер).

Ниже, в Приложении 1, приведены гаплотипы, использованные в этой работе.

http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/156

 

Потомок Махмут Кашгари, приколько. Еще и с Алматинской области )

По уйгурам, надо этнограф группу долан обязательно протестировать, они кстати есть в Андижанской обл., компактное поселение, так и называется село "Дулан". Они есть чистые могулы не утратившие племенного деления и мало смешавшиеся с др. группами уйгуров.

 

Куропаткин отмечает что еще в конце 19 века они именовали себя "могол".

 

А также представителей потомственной знати, в бывшем СССР многие семьи из знати утеряли связь. В СУАР же с этим гораздо лучше, там есть и прямые потомки комульских ханов, разных беков, ходжей и др. групп знати. Там знать имела влияние свое на общество вплоть до культурной революции.

[asan-kaygy]

Deep History of East Asian Populations Revealed Through Genetic Analysis of the Ainu

Choongwon Jeong, Shigeki Nakagome, Anna Di Rienzo

Early Online October 23, 2015

Abstract

Despite recent advances in population genomics, much remains to be elucidated with regard to East Asian population history. The Ainu, a hunter-gatherer population of northern Japan and Sakhalin island of Russia, are thought to be key to elucidating the prehistory of Japan and the peopling of East Asia. Here, we study the genetic relationship of the Ainu with other East Asian and Siberian populations outside the Japanese archipelago using genome-wide genotyping data. We find that the Ainu represent a deep branch of East Asian diversity more basal than all present-day East Asian farmers. However, we did not find a genetic connection between the Ainu and populations of the Tibetan plateau, rejecting their long-held hypothetical connection based on Y chromosome data. Unlike all other East Asian populations investigated, the Ainu have a closer genetic relationship with northeast Siberians than with central Siberians, suggesting ancient connections among populations around the sea of Okhotsk. We also detect a recent genetic contribution of the Ainu to nearby populations, but no evidence for reciprocal recent gene flow is observed. Whole genome sequencing of contemporary and ancient Ainu individuals will be helpful to understand the details of the deep history of East Asians.

http://www.genetics.org/content/early/2015/10/20/genetics.115.178673.short

http://www.genetics.org/content/early/2015/10/20/genetics.115.178673.full.pdf+html

[asan-kaygy]

Ancient mitochondrial genome reveals trace of prehistoric migration in the east Pamir by pastoralists

Chao Ning, Shizhu Gao, Boping Deng, Hongxiang Zheng, Dong Wei, Haoze Lv, Hongjie Li, Li Song, Yong Wu, Hui Zhou and Yinqiu Cui.

Abstract

The complete mitochondrial genome of one 700-year-old individual found in Tashkurgan, Xinjiang was target enriched and sequenced in order to shed light on the population history of Tashkurgan and determine the phylogenetic relationship of haplogroup U5a. The ancient sample was assigned to a subclade of haplogroup U5a2a1, which is defined by two rare and stable transversions at 16114A and 13928C. Phylogenetic analysis shows a distribution pattern for U5a2a that is indicative of an origin in the Volga–Ural region and exhibits a clear eastward geographical expansion that correlates with the pastoral culture also entering the Eurasian steppe. The haplogroup U5a2a present in the ancient Tashkurgan individual reveals prehistoric migration in the East Pamir by pastoralists. This study shows that studying an ancient mitochondrial genome is a useful approach for studying the evolutionary process and population history of Eastern Pamir.

http://www.nature.com/jhg/journal/vaop/ncurrent/abs/jhg2015128a.html

[suetvi]

Балановский выложил картографию из своей книги Генофонд Европы:
http://генофонд.рф/?page_id=5608&cpage=1#comment-1635

[Samtat]

Карта генетических расстояний от ногайцев

(генетический ландшафт по гаплогруппам Y-хромосомы)

Интересные данные по ногаям.

[Samtat]

Не менее интересна ещё одна публикация:

Геногеография гаплогрупп Y-хромосомы в Европе

http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=5629

[suetvi]

Самая интересная карта это пожалуй карта казанских татар:

http://генофонд.рф/?page_id=5500

 

остается только сожалеть что марийцы, коми-пермяки и вычегодские коми пока не картографированы. Судя по всему, казанские татары именно с ними составят общий паттерн. А это ооочень интересно с точки зрения историка.

[Peacemaker]

Чем еврей отличен от русского, а казах - от татарина

 

 

http://asiarussia.ru/articles/7345/

 

 

[asan-kaygy]

Сабитов Ж.М. Абдуллин А.К. Y-STR гаплотипы ногайцев в базе данных Family Tree DNA//The Russian Journal of Genetic Genealogy. Volume 7, No 2 (2015). C.40-50.

Abstract

В данной статье приведены краткие сведения о ногайском народе, исторических особенностях его этногенеза. Приведён обзор результатов различных исследований генетических данных полиморфизма Y-хромосомы у ногайцев, в том числе данных, полученных самими авторами.

https://www.academia.edu/19122083/%D0%A1%D0%B0%D0%B1%D0%B8%D1%82%D0%BE%D0%B2_%D0%96.%D0%9C._%D0%90%D0%B1%D0%B4%D1%83%D0%BB%D0%BB%D0%B8%D0%BD_%D0%90.%D0%9A._Y-STR_%D0%B3%D0%B0%D0%BF%D0%BB%D0%BE%D1%82%D0%B8%D0%BF%D1%8B_%D0%BD%D0%BE%D0%B3%D0%B0%D0%B9%D1%86%D0%B5%D0%B2_%D0%B2_%D0%B1%D0%B0%D0%B7%D0%B5_%D0%B4%D0%B0%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D1%85_Family_Tree_DNA_The_Russian_Journal_of_Genetic_Genealogy._Volume_7_No_2_2015_._C.40-50

http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/158

[Samtat]

СБОРНИК ТЕЗИСОВ:КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ ФГБНУ «МГНЦ»

 

http://www.med-gen.ru/docs/sbornik-mu-2015.pdf

[asan-kaygy]

Спасибо за ссылку.

[asan-kaygy]

Поздравляем Олега Павловича Балановского с выходом книги «Генофонд Европы»!

http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=6579