Активность

Tаблица генетических расстояний между популяциями на основе индекса фиксации (Fst). Позже я построю график многомерного шкалирования (MDS), который позволит наглядно визуализировать генетическое сходство и различия между популяциями. Данные (Fst): https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41431-024-01588-w/MediaObjects/41431_2024_1588_MOESM17_ESM.xlsx Из статьи : Balinova N, Hudjašov G, Pankratov V, et al. Gene pool preservation across time and space in Mongolian-speaking Oirats. Eur J Hum Genet. 2024;32:1150-1158. doi:10.1038/s41431-024-01588-w. https://www.nature.com/articles/s41431-024-01588-w MDS Evk - Эвенки Evn - Эвены Nog - Ногайцы Adg - Адыгейцы Blkr - Балкарцы OsseN - Осетины (северная Оссетия) Chech - Чеченцы Lzg - Лезгины Fin - Фины Komi - Коми Ttr - Татары Mrd - Мордва (Эрзяне?) RusN - Русские (Север) RusS - Русские (Юг) Mari - Марийцы Udm - Удмурты Nnt - Ненцы Hnt - Ханты Mns - Манси Han - Ханцы Tuj - Тувинцы-тоджинцы Dlg - Долганы Ykt - Саха (Якуты) Tzh - Тува (Тожу) MngZ - Mongol Tsaatan Tuva - Тувинцы AltTl - Теленгиты (Алтай) Dau - Дауры Orq - Oroqen AltTb - Тубалары (Алтай) Tu - Тувинцы KlmX - Калмык Синьзян Bur - Буряты KlmKh - Kalmyk Khoshut KlmD - Kalmyk Derbet KlmT - Kalmyk Torgut Kzkh - Казахи Krg - Кыргызы KlmB - Kalmyk Buzav MngD - Mongol Derbet MngT - Mongol Torgut SKlm - Сарт-калмаки Bshk - Башкиры Uyg - Уйгуры Uzb - Узбеки Khk - Хакассы Shor - Шорцы AltKm - Кумандинцы (Алтай) Kum - Кумыки Alt - Алтай AltCh - Челканцы (Алатай)

Признаёт ли научный консенсус роль спящих генов адаптации в эволюции? Да, научный консенсус признает и активно исследует роль "спящих" или, точнее, латентных генов и связанных с ними механизмов в эволюции. Хотя сам термин "спящие гены адаптации" может быть не строго научным термином, идеи, которые он охватывает (генетическая пластичность, эпигенетика, роль регуляции генов, скрытая генетическая вариабельность), являются фундаментальными и широко признанными в современной эволюционной биологии и генетике. Вот ключевые аспекты, которые подтверждают это: * Эпигенетика и фенотипическая пластичность: Это одно из самых активно развивающихся направлений. Эпигенетические изменения (например, метилирование ДНК, модификации гистонов) могут "включать" или "выключать" гены без изменения самой последовательности ДНК. Эти изменения могут быть унаследованы в течение нескольких поколений и играют важную роль в адаптации к меняющимся условиям среды, обеспечивая фенотипическую пластичность. Способность организма проявлять разные фенотипы в ответ на разные условия среды, имея при этом один и тот же генотип, является признанной адаптивной стратегией. * Регуляция экспрессии генов: Эволюция происходит не только за счет мутаций в кодирующих частях генов, но и (и, возможно, в большей степени) за счет изменений в регуляторных областях, которые контролируют, когда, где и насколько сильно ген экспрессируется. Гены, которые ранее были неактивны или малоактивны, могут стать "пробужденными" и приобрести новую функцию благодаря изменениям в их регуляции. * Скрытая генетическая вариабельность: В популяциях существует значительное количество генетических вариаций, которые не проявляются в нормальных условиях. Эти вариации могут быть "скрыты" или "замаскированы" другими генами (например, доминантными аллелями) или стабильными условиями среды. Однако при изменении условий среды (стресс, новые болезни, изменение климата) эти скрытые вариации могут проявиться и стать основой для быстрого отбора и адаптации. * Дупликации генов и псевдогены: Дупликация гена создает "лишнюю" копию, которая может свободно мутировать, не угрожая основной функции оригинала. Такая дуплицированная копия может в конечном итоге стать "спящей" (псевдогеном) или, наоборот, быть реактивированной и приобрести совершенно новую функцию, способствуя эволюционным инновациям. * Горизонтальный перенос генов: Особенно у микроорганизмов, горизонтальный перенос генов (передача генетического материала между организмами, не являющимися родителями и потомками) является мощным двигателем эволюции. Приобретенные гены могут быть поначалу неактивными ("спящими"), но при изменении условий могут активироваться и предоставить организму новые адаптивные возможности (например, устойчивость к антибиотикам). Современный синтез и новые направления: Классическая теория эволюции (Дарвинизм и современный синтез) фокусировалась в основном на случайных мутациях и естественном отборе. Однако последние десятилетия привели к расширению этого понимания, включив в него более сложные механизмы, такие как эпигенетика, фенотипическая пластичность, роль регуляторных элементов и скрытой генетической вариабельности. Таким образом, "спящие гены адаптации" — это не просто фантазия, а часть признанного научного понимания того, как организмы адаптируются и эволюционируют, используя свои генетические ресурсы в динамичном взаимодействии с окружающей средой. Это активно исследуемая область, которая продолжает расширять наше представление о сложности и гибкости эволюционных процессов.

Вопрос к искусственному интеллекту.Признаёт ли научный консенсус существование спящих генов адаптации? "Спящие гены адаптации" — это концепция, которая описывает гены, которые присутствуют в геноме организма, но в нормальных условиях не активны (или их активность сильно подавлена). Они могут "спать" в процессе эволюции, если перестают быть нужными, но способны "пробудиться" и активироваться при изменении условий окружающей среды, предоставляя организму новые или ранее использовавшиеся адаптивные черты. Что такое спящие гены? Более точный термин для таких генов — "латентные гены" или "скрытые гены". Они представляют собой последовательности ДНК, которые могут быть фенотипически неактивны (т.е. не проявляются в признаках организма), но могут быть реактивированы различными генетическими механизмами. Важно понимать, что это не обязательно "сломанные" гены. Они могут быть полностью функциональными, но их экспрессия (процесс, при котором генетическая информация из гена преобразуется в функциональный продукт, такой как белок) подавлена или регулируется таким образом, что они включаются только при определенных условиях. Как они работают (механизмы активации): Активация спящих генов может происходить различными способами: * Изменение экспрессии генов: Это наиболее распространенный механизм. Гены не изменяются сами по себе, но меняются условия, при которых они "читаются" и "переводятся" в белки. * Эпигенетические изменения: Это изменения в активности генов, которые не связаны с изменением самой последовательности ДНК. Например, метилирование ДНК или модификации гистонов могут "включать" или "выключать" гены, делая их "спящими" или "пробуждая" их. * Регуляция транскрипции/трансляции: Клетки могут контролировать, когда и как сильно ген экспрессируется, путем изменения активности белков, участвующих в процессе транскрипции (переписывания ДНК в РНК) и трансляции (синтеза белка по матрице РНК). * Мутации: В некоторых случаях, "спящие" гены могут стать активными в результате мутации. Мутация может изменить регуляторную область гена, "включив" его, или изменить сам кодирующий участок, придав ему новую или восстановленную функцию. * Перемещающиеся элементы (транспозоны): Эти "прыгающие гены" могут перемещаться по геному, иногда встраиваясь в регуляторные области других генов и активируя их или изменяя их экспрессию. * Дупликации генов: Если ген дуплицируется, одна из копий может оставаться "спящей" или менее активной, а затем активироваться при необходимости, или же одна из копий может свободно мутировать и приобретать новые функции, сохраняя при этом исходную функцию другой копии. * Горизонтальный перенос генов: Особенно у бактерий, организмы могут обмениваться генами с другими видами. Полученные гены могут быть поначалу "спящими", но затем активироваться, если окажутся полезными. Роль в адаптации и эволюции: Спящие гены играют важную роль в способности организмов адаптироваться к изменяющимся условиям среды и в эволюционном процессе: * Потенциал для быстрой адаптации: Вместо того, чтобы ждать возникновения случайных мутаций, которые могут оказаться полезными, организм уже имеет в своем "генетическом запасе" гены, которые могут быть активированы в ответ на стресс или новые условия. Это позволяет быстрее реагировать на изменения. * Гибкость и устойчивость: Наличие таких "резервных" генов повышает генетическую гибкость популяции. В условиях, когда старые адаптации становятся неэффективными, организм может "включить" спящие гены, которые были полезны в прошлом или могут стать полезными в будущем. * Эволюционный "буфер": Спящие гены могут накапливаться в геноме, не причиняя вреда организму (поскольку они неактивны). Это создает своего рода "банк" генетического материала, который может быть использован в будущем. Если условия изменятся, и какой-либо из этих генов станет полезным, он может быть активирован и подвергнуться отбору. * Примеры: * У человека: Есть примеры "остаточных" генов, которые отвечают за признаки, давно утраченные человеком в ходе эволюции (например, густая шерсть, хвост). Хотя они обычно не активны, в редких случаях могут проявляться атавизмы, что указывает на их потенциальное существование. * У бактерий: Бактерии, живущие в нестабильных условиях, часто имеют спящие гены, которые позволяют им быстро переключаться между различными метаболическими путями для использования разных источников питания или устойчивости к антибиотикам. * У растений: Растения могут иметь спящие гены, которые активируются при засухе, засолении почвы или нападении вредителей, обеспечивая им устойчивость. Таким образом, спящие гены адаптации представляют собой ценный генетический ресурс, который позволяет организмам проявлять фенотипическую пластичность и выживать в меняющемся мире, не дожидаясь появления новых полезных мутаций. Они являются важным элементом стратегии выживания и адаптации в эволюции.

У нас есть племя арабачы,что переводится как тележники,как и канглы

Нашёл опубликованную статью о генетике ойратских и тюркских групп на уровне всего генома. Статья опубликована в 2024г. Balinova N, Hudjašov G, Pankratov V, et al. Gene pool preservation across time and space in Mongolian-speaking Oirats. Eur J Hum Genet. 2024;32:1150-1158. doi:10.1038/s41431-024-01588-w. https://www.nature.com/articles/s41431-024-01588-w Впервые проанализированы полногеномные генотипы 80 человек, а также митохондриальная ДНК (мтДНК) 453 человек, представляющих различные ойратские группы (калмыков и западных монголов), сарт-калмаков и ряд популяций Южной Сибири. ---- Ниже PCA график из статьи. Метод основных компонент (PCA) является стандартным инструментом для визуализации аутосомной вариации и сравнительного анализа генетической близости популяций. Левый график - по регионам, правый - по этносам. Узбеки и уйгуры формируют отдельный кластер; кыргызы и казахи - свой, сарт-калмаки располагаются неподалёку на графике. Алтайцы тяготеют к тувинцам и бурятам. Также представлена таблица генетических расстояний между популяциями на основе индекса фиксации (Fst). Позже я построю график многомерного шкалирования (MDS), который позволит наглядно визуализировать генетическое сходство и различия между популяциями. Табличка (Fst) https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41431-024-01588-w/MediaObjects/41431_2024_1588_MOESM17_ESM.xlsx PCA график

Какие «монголы» 2,5 – 3 тыс. лет назад, даже если в заголовке статьи термин «обычные монголы»? Как вообще можно связать SNP возрастом 2,5 – 3 тыс. лет с этносом «монгол»? Прочитайте статью полностью: её цель — вовсе не привязать этот снип к монголам.

Те же авторский коллектив: "Анализ всей последовательности показывает, что скопление звезд Y-хромосомы C2* восходит к обычным монголам, а не к Чингисхану. Гаплогруппа Y-хромосомы C3*-Star Cluster (пересмотренная в этом исследовании в C2*-ST) была предложена в качестве Y-профиля Чингисхана. Здесь мы повторно изучили происхождение C2*-ST и его связи с популяциями Чингисхана и монголов. Мы проанализировали 34 последовательности Y-хромосомы гаплогруппы C2*-ST и ее наиболее близкородственную линию. Мы переопределили эту отцовскую линию как C2b1a3a1-F3796 и создали сильно пересмотренное филогенетическое дерево гаплогруппы, включая 36 подлиний и 265 нечастных вариантов Y-хромосомы. Мы провели комплексный анализ и оценку возраста этой линии в Восточной Евразии, включая 18 210 человек из 292 популяций. Мы обнаружили, что происхождение популяций с высокой частотой C2*-ST можно проследить либо до древнего монгольского клана Ниру'ун, либо до обычных монгольских племен. Важно отметить, что возраст самого последнего общего предка C2*-ST (2576 лет, 95% ДИ = 1975–3178) и его подгрупп, а также их модели экспансии согласуются с диффузией всех монголоязычных популяций, а не с самим Чингисханом или его близкими родственниками мужского пола. Мы пришли к выводу, что гаплогруппа C2*-ST является одной из отцовских линий-основателей всех монголоязычных популяций, и прямых доказательств связи между C2*-ST и Чингисханом еще предстоит обнаружить". https://www.nature.com/articles/s41431-017-0012-3

Как это противоречит датировке снипа C2b1a3a1-F3796, возраст которого, по разным исследованиям, составляет около 3000 лет? В работе Wei et al. (2018) был проанализирован 34-секвенционный набор Y-хромосомной линии, обозначенной как C2*-ST (эквивалент C2b1a3a1-F3796). Авторы оценили возраст ближайшего общего предка этой гаплогруппы в приблизительно 2576 лет . Следовательно, C2b1a3a1-F3796 сформировалась задолго до средневековой эпохи. На сегодняшний день общепринято, что гаплогруппа C2b1a3a1-F3796 возникла ~ 2,5–3 тыс. лет назад. Разброс оценок обусловлен разной методикой: ранние STR-методы давали более «молодые» цифры, тогда как высокоточное секвенирование по SNP указывает на более древний возраст с умеренной погрешностью. Альтернативные расчёты (Wang et al., 2024) дают сопоставимые результаты и подтверждают, что эта ветвь C2b1a3a1-F3796 возникла значительно раньше монгольского периода. То, что носители F3796 обнаружены в монгольских захоронениях 13-14 вв., не означает «монгольского» происхождения всей линии: аналогично, нельзя назвать R1a-Z93 «кыргызской» или «пуштунской» лишь потому, что её фиксировали у этих народов например сто лет назад. Или в настоящее время привязать ветвь к одному или другому этносу. Авторы упомянутой статьи и не называют F3796 сугубо монгольской; в контексте, они обсуждают миграционные процессы, ускоренные экспансией Монгольской империи.

Это палеоДНК, которая найденная монгольских захоронениях. "На данный момент найдено только два древних образца, которые однозначно относятся к гаплогруппе C2b1a3a1-F3796. Эти образцы (MRI001 и SHG003) происходят из позднесредневековых монгольских захоронений (около 1200–1400 гг. н. э.) в Морь-Баридаг (Хувсгул) и Шарга-Уул (Сухэ-Батор), Монголия".

Как из процитированного вами текста следует, что авторы называют ветвь C2b1a3a1-F3796 'монгольской', которой приблизительно 3,000 лет? Это вы ее так назвали, а не авторы опубликованной статьи.

Это фундаментальное исследование ДНК, проведенное китайскими учеными из престижного Фуданского университета, изучает генетическое наследие кыргызов, проживающих в регионе Синьцзян, Китай. Особенность этого исследования заключается в его широком охвате, включающем кыргызскую диаспору в таких регионах, как Алтай, Южная Сибирь, Центральная Азия и Синьцзян. Кроме того, исследование предоставляет сравнительные данные о других этнических меньшинствах этого исторически значимого региона, что позволяет глубже понять сложную генетическую и культурную динамику области. «Кыргызы — это трансграничная этническая группа, основное население которой проживает в Кыргызстане. Предыдущие генетические исследования центральноазиатских народов неоднократно изучали кыргызов Центральной Азии. Однако с точки зрения эволюции человека и генетического разнообразия кыргызы северо-западного Китая остаются одной из наименее изученных популяций. В данном исследовании мы проанализировали не рекомбинирующую часть Y-хромосомы у 298 мужчин-кыргызов из Синьцзян-Уйгурского автономного района на северо-западе Китая, используя высокоточный анализ 108 биаллельных маркеров и 17 или 24 STR. Во-первых, на основе Y-SNP анализа и графика PCA (метод главных компонент) кыргызы северо-западного Китая формируют кластер, схожий с другими кыргызскими популяциями, и относятся к западноазиатской и центральноазиатской группам. Во-вторых, мы обнаружили, что кыргызы северо-западного Китая демонстрируют высокую долю Y-линии R1a1a1b2a2a-Z2125, связанной с бронзовым веком Сибири, а также Y-линии C2b1a3a1-F3796, связанной с монголами эпохи Средневековья, такими как племя уйсунов у казахов. С помощью NETWORK-анализа в этих двух доминирующих линиях были обнаружены два уникальных кластера недавнего происхождения, которые имеют почти одинаковый возраст TMRCA (около XIII–XIV веков). Эти результаты вновь подтверждают, что расширение Монгольской империи оказало значительное влияние на генофонд Центральной Азии. Кыргызы как трансграничная этническая группа в основном расселены в Кыргызстане, где они составляют 69,2% от общей численности населения. Остальные кыргызы рассредоточены в Китае, Узбекистане, Таджикистане, Казахстане и Афганистане. Согласно шестой переписи населения Китая в 2010 году, численность кыргызов составляет от 180 до 190 тысяч человек. Они преимущественно проживают в Киргизском автономном округе Кызылсу на юго-западе Синьцзян-Уйгурского автономного района, а также частично в провинции Хэйлунцзян. Основой экономической жизни кыргызов является пасторализм. Исторически древние кыргызы считались енисейскими кыргызами, которые, возможно, были связаны с таштыкской культурой. Они проживали в верховьях Енисея, на юге Минусинской котловины, и расселялись среди множества скотоводческих народов Саяно-Алтая с VI по XIII века. В китайских анналах они упоминаются под разными названиями: Гянь-Гунны (鬲昆) в Ши цзи («Исторические записки», 91 г. до н. э.), Цзянькун (坚昆) в Ханьшу («Книга Хань», 92 г. н. э.), Хэгу (纥骨) в Бэйши («История Северных династий», 659 г. н. э.), Цигу (契骨) в Чжоушу («Книга Чжоу», 636 г. н. э.) и Суйшу («Книга Суй», 636 г. н. э.), Цзегу (结骨) в Цзю Таншу («Старая книга Тан», 945 г. н. э.) и Тан хуяо («Институциональная история Тан», 618–907 гг. н. э.), Сяцзясы (黠戛斯) в Синь Таншу («Новая книга Тан», 1060 г. н. э.), в Истории Ляо (1344 г. н. э.) и Сунши («История Сун», 1345 г. н. э.), Хэлицисы (纥里迄斯) в Цзиньши («История Цзинь», 1344 г. н. э.), Цзилицзисы (吉利吉思) в Юаньши («История Юань», 1370 г. н. э.) и Минши («История Мин», 1739 г. н. э.), Булуты (布鲁特) в Цин шигао («Черновая история Цин», 1927 г. н. э.). (Дополнение от КАФ: Александр Бернштам: «Первые упоминания о древних Гянь-Гунн-Кыргызах относятся примерно к 209–201 гг. до н. э., когда, согласно китайским хроникам, предводитель гуннов Модэ Шаньюй подчинил несколько племен, среди которых были динлины и Гегун (также известные как Гянь-Гунн или Джян-Кюн).» Сыма Цянь, «Исторические записки», том 110: “後北服渾庾、屈射、丁零、鬲昆、薪犁之國。…… 是時漢初定中國，……。” Перевод: «Позднее на севере [Модун] подчинил племена Хунью, Цюйше, Динлинь, Гяньгун и Синли. […] Это произошло, когда Хань только что установила стабильность в Центральном регионе (около 202 г. до н. э.).» Примечательно, что, согласно записям Синь Таншу, большинство представителей народа Цзегу описывались как «все высокие и крупные, с рыжими волосами, белой кожей и зелеными глазами», а те, у кого были «темные волосы и глаза», утверждали, что являются потомками Ли Лина, внука знаменитого генерала Ли Гуана эпохи династии Хань. Современный кыргызский язык относится к западной ветви тюркской группы в рамках алтайской языковой семьи (www.ethnologue.com). Однако кыргызский язык Фую, диалект, найденный в уезде Фуюнь (провинция Хэйлунцзян, Китай), имеет общие корни с современными хакасским и шорским языками Южной Сибири. Эти древние сибирские популяции принадлежат к северной ветви тюркской языковой группы. Возможно, замена языка в кыргызском произошла во время их миграции из Южной Сибири в регионы современного проживания. Генетический анализ кыргызских популяций изначально был сосредоточен на митохондриальной ДНК и ограниченных маркерах Y-хромосомы для оценки уровня разнообразия и взаимосвязей с другими евразийскими популяциями. Частота восточноазиатских и европейских специфических гаплогрупп мтДНК составила 72,9% и 25,0% у кыргызов Таласа (низинные кыргызы) и 59,6% и 31,9% у кыргызов Сары-Таша (горные кыргызы) соответственно. Среди них восточноазиатская гаплогруппа D и европейская гаплогруппа HV имеют наибольшую частоту (25,5%). Таким образом, кыргызы представляют собой смешанную популяцию между Востоком и Западом. Различия были отмечены и в патрилинейном генетическом пуле кыргызов. Чрезвычайно низкое разнообразие Y-хромосомы и высокая частота (68,9%) гаплогруппы R1a1-M17 (диагностический индо-иранский маркер) являются яркими характеристиками кыргызских популяций Центральной Азии. Вероятно, в кыргызских популяциях имели место серии эффектов основателя или сильные узкие места. Более того, недавнее исследование SNP-генома кыргызов Центральной Азии, проведенное Петром Тришкой и его коллегами, показало, что высокий уровень общих IBD-блоков у кыргызов Центральной Азии и других алтайскоязычных популяций Южной Сибири (Тува, Бурятия) и Северной Азии (Якутия) подтверждает их недавно сформировавшийся общий генетический фундамент в Южной Сибири. Однако большинство предыдущих генетических исследований по данной теме сосредотачивались главным образом на сибирских и центральноазиатских популяциях кыргызов, оставляя наше понимание генетического разнообразия кыргызов в Китае неполным. В этом исследовании было собрано и протестировано 298 образцов ДНК мужчин-кыргызов из Синьцзян-Уйгурского автономного района на северо-западе Китая. Цель этой работы — исследовать вариации Y-хромосомы у кыргызов северо-западного Китая, их генетические связи с другими популяциями кыргызов и понять историю населения северо-западного Китая, включая их генетический контекст в пределах Евразийских степей. Для анализа использовались 108 бинарных маркеров, что позволило определить Y-гаплогруппы в соответствии с номенклатурой Консорциума Y-хромосомы (YCC) и деревом гаплогрупп Y-ДНК ISOGG 2018 года, а также 17 или 24 микросателлита для определения более детальных гаплотипов. Гаплотипическое разнообразие кыргызов северо-западного Китая составило 0,96 при использовании 17 микросателлитов, при этом у кыргызов Урумчи и Кызылсу это значение составило 0,98 и 0,96 соответственно. Более высокое гаплотипическое разнообразие (0,98) наблюдалось у кыргызов Кызылсу при тестировании 24 микросателлитов. У кыргызов северо-западного Китая кыргызы Урумчи продемонстрировали умеренное гаплогрупповое разнообразие (0,67), тогда как кыргызы Кызылсу показали чрезвычайно низкое значение (0,33), которое лишь немного превышало значение у Ширинских хакасов (0,23 — название, данное кыргызам русскими этнологами). Эти данные были получены в сравнении с другими кыргызскими популяциями, включая популяции юго-западного, центрального, северо-западного и восточного Кыргызстана, а также хакасские популяции из Аскизского, Таштыпского и Ширинского районов Республики Хакасия. Гаплогруппы R1a1a-M17+, M198+, M458− и C2-M217+, M48− составили в совокупности 72% исследованных Y-хромосом. Как и в других кыргызских популяциях, наибольшие частоты гаплогруппы R1a1a-M17+, M198+, M458− были обнаружены у кыргызов северо-западного Китая (кыргызы Урумчи — 56%, кыргызы Кызылсу — 46%). Эта гаплогруппа распространена на обширной территории, охватывающей Южную Азию, Центральную и Восточную Европу, а также Южную Сибирь. Зержал и его коллеги предположили, что эта гаплогруппа может быть наиболее ярким генетическим наследием мужского населения, связанного с экспансией культуры Кургана. В рамках исследования были также протестированы диагностические маркеры R1a1a1b1a-Z282 и R1a1a1b2-Z93. Среди 143 образцов кыргызов с гаплогруппой R1a1a-M17+, M198+, M458− более 90% были отнесены к центральноазиатской линии R1a1a1b2-Z93, а оставшиеся принадлежали к европейской линии R1a1a1b1a-Z282. Гаплогруппа C2-M217+, M48− была обнаружена с относительно высокой частотой (кыргызы Урумчи — 16%, кыргызы Кызылсу — 26%). Эта гаплогруппа часто встречается у кыргызских популяций Кыргызстана (6–25%), но крайне редко у хакасов. Четыре отцовские линии гаплогруппы C2-M217 распространены среди алтайскоязычных народов, особенно монголоязычных: C2b1a3a1-F3796, C2a1a1b-M48, C2b1a1a1a-M407 и C2a1a1a2a-F1756. У кыргызов северо-западного Китая гаплогруппа C2b1a3a1-F3796 составляет около 23% от исследованных Y-хромосом, тогда как C2a1a1b-M48 и C2a1a1a2a-F1756 встречаются лишь спорадически (около 2% и 1% соответственно), а C2b1a1a1a-M407 отсутствует. Западноевразийские линии, такие как гаплогруппы J-M304 и R1b1a1a-M73, имеют низкую или умеренную частоту у кыргызов Урумчи (2% и 8%) и кыргызов Кызылсу (6% и 4%). Североазиатская линия N1a2b-P43 наблюдается у кыргызов Урумчи (6%) и кыргызов Кызылсу (2%), тогда как у хакасов, особенно Ширинских хакасов, её частота достигает 88%. Остальные обнаруженные гаплогруппы у кыргызов северо-западного Китая встречаются с очень низкой частотой (<5%) и могут быть классифицированы как восточноевразийские линии (C-M130, C2b-F1067, D1a1-M15, D1a2a-P47, N1a1a-M178, N1b-F2930, O1a1-P203, O1b2-M176, O2a1b-002611, O2a2b1a1-M117, O2a2b1a2-F444) и западноевразийские линии (E-M96, G-M201, H-M69, I-M170, L-M20, R1b1a1b-M269 и R2a-M124) в зависимости от их предполагаемого происхождения. Примечательно, что гаплогруппа Q-M242 имеет центральноазиатское и южносибирское происхождение и достигает высокой частоты у североазиатских популяций, таких как Таштыпские хакасы (14%), но она не была обнаружена в нашем наборе данных о кыргызах северо-западного Китая. На основе Y-SNP был построен график анализа главных компонентов (PCA) на уровне популяций, который сравнивает данные о кыргызах с 116 евразийскими популяциями, охватывающими Центральную Азию, Восточную Азию, Сибирь и Западную Азию. Этот график хорошо структурирован и, вероятно, отражает исторический и географический контекст изучаемых популяционных групп. На графике три отдельные группы расходятся в трех направлениях от центра. Западноазиатские и центральноазиатские популяции (за исключением хакасов) группируются в нижнем левом углу, восточноазиатские популяции плотно расположены в нижнем правом углу, а хакасы демонстрируют близость к сибирским популяциям в верхней части графика. Кыргызы северо-западного Китая оказались близки к другим кыргызским популяциям и расположены в группе Западной и Центральной Азии, что подчеркивает их сходство с географически соседними популяциями. Для детального изучения индивидуальных связей между кыргызами северо-западного Китая и другими евразийскими популяциями мы дополнительно проанализировали две доминирующие линии, R1a1a1b2-Z93 и C2b1a3a1-F3796, с использованием анализа сети сниженных медиан. В сети R1a1a1b2-Z93 большинство образцов кыргызов северо-западного Китая (обозначенные красным цветом) группируются с образцами гаплогруппы R1a1a1b2a2a-Z2125 (пурпурный цвет), что позволяет отнести их к одной линии. Среди азиатских линий R1a1a1b2-Z93 гаплогруппа R1a1a1b2a2-Z2125 широко распространена в Кыргызстане и у пуштунов Афганистана (40%), а также встречается реже у других афганских этнических групп, популяций Кавказа и Ирана (10%). Базальная линия R1a1a1b2-Z93* чаще всего обнаруживается в Южной Сибири, особенно в Алтае. В правом верхнем углу графика можно выделить кластер недавнего происхождения, включающий гаплотипы, которые отделены от модального гаплотипа менее чем на пять мутационных шагов. За исключением двух образцов R1a1a1b2-Z93* (один из хакасов и один из алтайцев, отмеченные темно-синим цветом), кыргызские образцы из северо-западного Китая формируют общий кластер с кыргызами из Центральной Азии. На основании профилей Y-STR время до последнего общего предка (TMRCA) для всех образцов гаплогруппы R1a1a1b2a2a-Z2125 оценивается в 2585–3107 лет назад, а для кыргызского кластера — в 628–721 год назад. Гаплогруппа C2b1a3a1-F3796 (датируемая 1296–1624 лет назад) демонстрирует классический звездообразный паттерн с центральным гаплотипом основателя и несколькими субоснователями. В центре сети центральный гаплотип представлен в основном казахами из Центральной и Северной Азии (60%), а также некоторыми монголоязычными популяциями (30%), такими как буряты, дауры, калмыки, халха, ойраты и другие монголы. В сети четко видны ранее описанные кластеры, такие как кластер керей, кластер жалайыров, кластер хазарейцев и кластер не-жалайырских уйсунов. Три гипотезы происхождения кыргызов: 1.Происхождение с верхнего течения реки Енисей (Минусинская котловина), предложенное российским академиком Г. Ф. Миллером (1705–1783) в его книге «История Сибири». 2.Происхождение из гор Тянь-Шаня, предполагающее, что кыргызы были коренным народом Центральной Азии. 3.Гипотеза множественного независимого происхождения, согласно которой кыргызы состояли как минимум из двух этнических групп Центральной Азии. В данном исследовании использовался набор из 108 SNP маркеров Y-хромосомы и 17 или 24 микросателлитов Y-хромосомы для изучения генетического состава отцовского генофонда кыргызов северо-западного Китая. Мы обнаружили, что кыргызы северо-западного Китая характеризуются двумя основными гаплогруппами Y-хромосомы: R1a1a1b2a2a-Z2125 и C2b1a3a1-F3796. Гаплогруппа R1a1a1b2a2a-Z2125 является самой распространенной линией (39%) у кыргызов северо-западного Китая. Она часто встречается у многих популяций Центральной Азии. Самый древний образец этой линии (SVP27, Утевка VI, курган 7, могила 1 [2200–1900 гг. до н. э.]) был обнаружен на месте раннебронзовой культуры Потаповка (тесно связанной с культурой Синташта) к югу от реки Сок в Самарской области, Россия. Согласно опубликованным данным древней ДНК, в среднем бронзовом веке гаплогруппа R1a1a1b2a2a-Z2125 была обнаружена у популяции культуры Синташта на кладбище Каменный Амбар 5 (Западная Сибирь), у представителей фёдоровского типа андроновской культуры и карасукской культуры из Минусинской котловины (Южная Сибирь), а также у популяций андроновской культуры из Майтан, Ак-Мустафа, Ак-Тогай, Казахмыс, Сатан, Ой-Джайлау III, Карагаш 2, Дали и Зевакенского каменного забора в Казахстане. Позже, с позднего бронзового века до Средневековья, эта линия была обнаружена в Монголии, Кыргызстане, Узбекистане, Таджикистане, Венгрии и Молдове, но не в России и Казахстане. Примечательно, что в районе Тянь-Шаня (Кыргызстан) эта линия была идентифицирована у представителей скифо-сакской и гуннской популяций в периоды 259–93 гг. до н. э. и 286–406 гг. н. э. соответственно. Таким образом, на основе пространственного и временного распределения гаплогруппы R1a1a1b2a2a-Z2125 можно предположить, что часть кыргызов имеет сибирское происхождение. Второй основной гаплогруппой, обнаруженной у кыргызов северо-западного Китая, является C2b1a3a1-F3796. Эта линия характеризуется наибольшим генетическим разнообразием у монголов и самой высокой частотой у казахов. Предыдущие исследования связывают происхождение этой линии со средневековыми монголами Ниру’ун. На данный момент найдено только два древних образца, которые однозначно относятся к гаплогруппе C2b1a3a1-F3796. Эти образцы (MRI001 и SHG003) происходят из позднесредневековых монгольских захоронений (около 1200–1400 гг. н. э.) в Морь-Баридаг (Хувсгул) и Шарга-Уул (Сухэ-Батор), Монголия. Примечательно, что за исключением образца I1193 (Приморский край, Бойсман-2 [4989–4794 гг. до н. э.]), большинство древних образцов (SHA001, TSA003 и DAS001) принадлежат к восходящему SNP этой линии — гаплогруппе C2b1a3a-F1918, которая также произошла из средневековой Монголии. Таким образом, в отличие от гаплогруппы R1a1a1b2a2a-Z2125, линия C2b1a3a1-F3796, вероятно, была интегрирована в генофонд кыргызов позднее, через монголов Ниру’ун. Двоякое происхождение кыргызов северо-западного Китая (смешение компонентов бронзового века Сибири и средневековой Монголии) также наблюдалось у центральноазиатских кыргызов при использовании анализа IBD (общих блоков гомологичных последовательностей). Примечательно, что внутри гаплогруппы C2b1a3a1-F3796 кыргызы северо-западного Китая и представители не-жалайырского клана уйсун имеют близкие генетические связи по отцовской линии, формируя кластер происхождения, датируемый 696–736 годами назад. Для гаплогруппы R1a1a1b2a2a-Z2125 время до последнего общего предка (TMRCA) для «кыргызского» кластера оценивается в 628–721 год назад. Близкое совпадение возраста этих двух кластеров указывает на быстрое увеличение численности кыргызов северо-западного Китая в XIII–XIV веках, что совпадает с периодом расширения Монгольской империи. На основе вышеупомянутой модели двойного происхождения становится понятным, почему кыргызский язык изменился с северной ветви на западную ветвь тюркской группы. Подобно современным хакасскому и шорскому языкам, древнекыргызский язык, вероятно, принадлежал к северной ветви тюркской группы. Однако в позднесредневековый период замена древнекыргызского языка могла быть обусловлена влиянием или миграцией популяций, говорящих на языках западной ветви тюркской группы, таких как племя уйсунов среди казахов.» – Шао-цин Вэнь, Университет Фудань Источник: «Двойное происхождение кыргызов северо-западного Китая: смешение Y-хромосом бронзового века Сибири и средневековых монголов Ниру’ун», Journal of Human Genetics Авторы: Шао-цин Вэнь, Пан-синь Ду, Чанг Сунь, Вэй Цуй, И-жан Сюй, Хай-лян Мен, Мэй-сен Ши, Бо-фэн Чжу и Хуэй Ли.

Среди современных тюркских народов генетически ближе всего к монголам, скорее всего, находятся тувинцы. Я встречал опубликованное исследование, в котором это показывалось по аутосомным ДНК-данным, но точный источник уже не помню. Возможно у Юнусбаева и соавторов. Не всегда, но очень часто география хорошо коррелирует с генетической близостью популяций.

Авторы не утверждают, что гаплогруппа C2b1a3a1-F3796 является монгольской. Изучая гаплотипы, авторы пишут о наиболее недавнем общем предке, датируемом 13-14 веками. Сама же ветвь C2b1a3a1-F3796 имеет приблизительный возраст около 3000 лет и не является ни кыргызской, ни казахской, ни монгольской, ни кыпчакской в современном понимании этих терминов. Также авторы отмечают влияние миграций народов, на которые повлияла экспансия Монгольской империи того периода. Если вы хотите узнать, к каким народам генетически близки современные кыргызы, то, согласно имеющимся аутосомным ДНК данным кыргызов из СУАР (г. Куча, 525 человек), это казахи и уйгуры приграничных районов СУАР (недалеко от Иссый-Кульского Караколя). Уйгуры из города Куча (у границы с Кыргызстаном) оказались генетически близки к кыргызам из СУАР. Другие данные аутосомного ДНК из других исследований также указывают генетическую схожесть современных кыргызов и казахов. Если сравнительных анализ делать по всему геному, точнее аутосмному ДНК . Процитирую самого себя (2024г) https://eurasica.ru/forums/topic/2661-киргизы-и-киргизский-днк-проект/?do=findComment&comment=471443

В этногенезе и этнической истории кыргызов большое место занимает могольский компонент. Его не стоит путать с монгольским компонентом, который также присутствует у кыргызов вследствие контактов с монгольскими народами - ойратами, собств. монголами и т.д. Согласно Юдину моголы говорили на языке кыпчакского типа. Это были уже смесь из тюркизированных монголов и тюркских племен. Само формирование кыргызов было связано с историей Моголистана.

По мнению лингвиста Р. Конурбаевой, которая исследовала связи кыргызского языка со словарем "Кодекс Куманикус", близость этих двух языков составляет более 90% - из личной беседы. У нее есть монография: Коңурбаева Роза. “Codex Cumanicus” (ХІІІ-ХІV к.) жазма эстелигинин кыргыз тилине катышы. Бишкек. 2011.

Для некоторых юзеров повтор информации о месте кыргызского языка в классификациях от лингвистов: От "специалистов" ждем информации о том, что современный кыргызский язык это "енисейско-кыргызский язык", который очень близок енисейским эпитафиям.

Там же: "... мы обнаружили, что северо-западные китайские киргизы демонстрируют высокую долю Y-линии R1a1a1b2a2a-Z2125, связанной с сибирскими бронзовыми веками, а затем следует Y-линия C2b1a3a1-F3796, связанная со средневековыми монголами Ниру'ун". Эти статьи я не читал, но предполагал что, кыргызская C2 должна быть монгольская. Потому что нынешних кыргызов монгольские этнические компоненты много, нежели кыпчакская. Все "кимако-кипчакская" этнические компоненты кыргызов кроме "кыргыз-кыпчаков" предположения, не имеются доказательства.

Из последних публикаций от исследователей из Китая по кыргызам СУАР. Резкое увелчение частоты R1a-Z2125 и C2b-F3796 (основные мужские линии) произошло в 13-14 вв. In these two dominant lineages, two unique recent descent clusters have been detected via NETWORK analysis, respectively, but they have nearly the same TMRCA ages (about 13th–14th centuries) : https://www.nature.com/articles/s10038-021-00979-x Анализ по аутосомному ДНК кыргыз из СУАР Исследование 70 юго-кыргызских геномов (Halili et al., 2023) вычислило пик LD-декорреляции: ALDER = 35 ± 5 поколений → ~950–1050 лет назад (при одном поколении 29 лет). GLOBETROTTER дал сходный диапазон. The estimated east–west admixture time of SXJK ranged from 600 to 900 years ago using different pairwise source proxies in ALDER (Table S3). … Similarly, GLOBETROTTER showed the east–west admixture event of SXJK could be traced back to 500–1000 years ago (Table S4), overlapped with the estimated admixture time from ALDER. Источник (2023) https://www.researchgate.net/publication/371077149_Inferring_the_population_history_of_Kyrgyz_in_Xinjiang_northwest_China_from_genome-wide_array_genotyping Немного научной терминологии TMRCA (Time to the Most Recent Common Ancestor)— время до наиболее недавнего общего предка исследуемых генетических линий. LD-декорреляции - две генетические метки (мутации) встречаются у людей вместе чаще, чем положено по чистой случайности. То есть между ними есть дисбаланс сцепления (LD) — их аллели «ходят парой». ALDER и GLOBETROTTER — это два широко-используемых программных инструмента для датировки и описания событий смешения. GОLBETROTTER улавливает сшешение, предоставляет состав источников и выводит дату смешивания. ---- Мне известны некоторые генетические работы по этносам Центральной Азии и Восточной Европы. Согласно их данным, ключевые события этногенеза этих народов приходятся на 13-14 вв. У меня есть предположение, что период 7-15 вв. может оказаться ключевым для формирования многих современных народов Евразии.

Ув. Эсен, посмотрите мои сообщения. Основной этн. компонент - ен. кыргызский, второй по значимости после него кимако-кыпчакский, который дал язык. Ядро - ен. кыргызы, которые смешались с кимако-кыпчаками и изменили свой язык. Возьмите к примеру эпическое наследие кыргызов, не учитывая сам эпос "Манас" (см."Маджму ат-таварих"), в состав так называемых малых эпосов входят относящиеся к кыргыз-кыпчакам: "Эр Тощтук", «Жоодарбешим», "Курманбек", "Сейитбек", "Шырдакбек", "Олжобай менен Кишижан", «Жаныш, Байыш». Я к тому, что убирать этот компонент с фразой "не хочу быть потомком кыштымов" это неправильно. Современные кыргызы это не ен. кыргызы, а смесь этнических компонентов. Некоторые это не понимают, с большой помпой с подачи одного из политологов начинают возводить себя чуть ли не к шумерам. тут на форуме публиковалась приблизительная генетическая дата формирования совр. кыргызов, если не ошибаюсь там 14 век. По поводу ухода алтайских кыргызов обратно на Енисей. Диссертация Т.О. Бейшеналиева, С.15:

Оймаут?

Спасибо, исправил.

отец туркмен

Вот,что пишет Кормушин в своей книге"Древние тюркские языки" : "Письменные памятники из указанных регионов в большей или меньшей степени имеют отношение к истории таких современных тюрко- язычных народов, как турки (тюрки), уйгуры, тувинцы, хакасы, алтайцы, якуты, кыргызы, казахи, узбеки и неко- торые др. Буквенный алфавит, применявшийся на таком огромном географическом и историко-политическом про- странстве далеко не всегда одинаков: между региональ- ными алфавитами есть различия на уровне вариантов знаков, но есть сильно различающиеся варианты знаков, как существуют и просто разные знаки, не сводимые к общему прототипу

Насчёт новоуйгурского,уйгурский считается одним из архаичных тюркских,лексически и грамматически хорошо сохранился и не уступит той же северо-восточной группе ,а может где то даст фору. Но он изначально восточно-тюркский язык попавший в окружении западно-тюркских,и потому занявший промежуточное положение. Дыбо высказывает мнение о его сибирском (древнекыргызском )происхождение,но он потомок карлуко-уйгурской группы

Что хотели вы сказать своим длинным скопированным постом я так и не понял. Я этих классификаций и мнений могу кучу накидать.