Middle Holocene Siberian genomes reveal highly connected gene pools throughout North Asia

[asan-kaygy]

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0960982222018929

[asan-kaygy]

https://forum.molgen.org/index.php/topic,14630.0.html

[asan-kaygy]

Цитата

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982222018929

Middle Holocene Siberian genomes reveal highly connected gene pools throughout North Asia

https://doi.org/10.1016/j.cub.2022.11.062

Highlights

•    A distinctive Middle Holocene Siberian ancestry is found in Altai hunter-gatherers
•    It results from a mixture of paleo-Siberian and ancient North Eurasian ancestries
•    A contemporaneous Altai individual carries ancient Northeast Asian ancestry
•    Northeastern Siberians experienced a prolonged Native American-related geneflow

Summary

The peopling history of North Asia remains largely unexplored due to the limited number of ancient genomes analyzed from this region. Here, we report genome-wide data of ten individuals dated to as early as 7,500 years before present from three regions in North Asia, namely Altai-Sayan, Russian Far East, and the Kamchatka Peninsula. Our analysis reveals a previously undescribed Middle Holocene Siberian gene pool in Neolithic Altai-Sayan hunter-gatherers as a genetic mixture between paleo-Siberian and ancient North Eurasian (ANE) ancestries. This distinctive gene pool represents an optimal source for the inferred ANE-related population that contributed to Bronze Age groups from North and Inner Asia, such as Lake Baikal hunter-gatherers, Okunevo-associated pastoralists, and possibly Tarim Basin populations. We find the presence of ancient Northeast Asian (ANA) ancestry—initially described in Neolithic groups from the Russian Far East—in another Neolithic Altai-Sayan individual associated with different cultural features, revealing the spread of ANA ancestry ∼1,500 km further to the west than previously observed. In the Russian Far East, we identify 7,000-year-old individuals that carry Jomon-associated ancestry indicating genetic links with hunter-gatherers in the Japanese archipelago. We also report multiple phases of Native American-related gene flow into northeastern Asia over the past 5,000 years, reaching the Kamchatka Peninsula and central Siberia. Our findings highlight largely interconnected population dynamics throughout North Asia from the Early Holocene onward.

Основные моменты

-    У алтайских охотников-собирателей обнаружено характерное среднеголоценовое сибирское происхождение
-    Она является результатом смешения палеосибирских и древних североевразийских предков.
-    Современный алтайский индивид имеет древних северо-восточных азиатских предков
-    Северо-восточные сибиряки пережили длительный приток генов, связанных с коренными американцами

Резюме

История заселения Северной Азии остается практически неизученной из-за ограниченного числа проанализированных древних геномов из этого региона. Здесь мы приводим геномные данные десяти индивидуумов, датированные 7 500 лет до настоящего времени, из трех регионов Северной Азии, а именно Алтае-Саян, Дальнего Востока России и полуострова Камчатка. Наш анализ выявил ранее не описанный сибирский генофонд среднего голоцена у неолитических алтае-саянских охотников-собирателей, представляющий собой генетическую смесь палеосибирских и древних североевразийских (ANE) предков. Этот отличительный генофонд представляет собой оптимальный источник для предполагаемого населения, связанного с ANE, которое внесло свой вклад в группы бронзового века из Северной и Внутренней Азии, такие как охотники-собиратели озера Байкал, скотоводы, связанные с Окунево, и, возможно, население Таримского бассейна. Мы обнаружили присутствие древних предков из Северо-Восточной Азии (АНА), первоначально описанных в неолитических группах с Дальнего Востока России, у другого неолитического алтае-саянского индивида, связанного с различными культурными особенностями, что свидетельствует о распространении предков АНА на 1500 км дальше на запад, чем наблюдалось ранее. На Дальнем Востоке России мы выявили 7000-летних индивидов, которые несут предков, связанных с Джомоном, что указывает на генетические связи с охотниками-собирателями на Японском архипелаге. Мы также сообщаем о нескольких фазах потока генов, связанных с коренными американцами, в северо-восточную Азию за последние 5 000 лет, достигших полуострова Камчатка и центральной Сибири. Наши результаты свидетельствуют о значительной взаимосвязи динамики численности населения Северной Азии, начиная с раннего голоцена и далее.

Переведено с помощью www.DeepL.com/Translator (бесплатная версия)

Genetic label   Individual   Date (95% CI) direct date   Sex   1240k SNPs   Y chr haplogroup   mtDNA haplogroup   mtDNA contam. (%)   X chr contam. (%)
Altai_7500BP   FRS001   5,478–5,390 cal BCE   M   73,258   CT   U2e1b   1 ± 1   2.8 ± 6.1
FRS002   5,479–5,390 cal BCE   M   653,871   Q1a1   C   2 ± 1   1.1 ± 0.3
Altai_6500BP   NVR001   4,325–4,180 cal BCE   M   428,365   Q1a1   D4j   2 ± 1   2.8 ± 0.8
Altai_5500BP   TZB001   3,487–3,359 cal BCE   M   659,140   C2b1   C4+152   2 ± 1   1.9 ± 0.4
TZB002   3,973–3,818 cal BCE   M   281,236   C2b   R1b   3 ± 1   5.8 ± 1.5
Nizhnetytkesken_6500BP   NIZ001   4,445–4,337 cal BCE   M   732,200   C2b1a1   A   1 ± 1   0.4 ± 0.1
LetuchayaMysh_7000BP   Letuchaya Mysh.pmd   4,935–4,729 cal BCE   M   242,242   C2b   D4b1a2a   –   4.7 ± 1.8
Kamchatka_
500uncalBP   KMT001   1,646 ± 68 14C years   F   258,456   –   G1b   1 ± 1   –
KMT002   1,578 ± 52 14C years   M   372,840   Q1a1   G1b   1 ± 1   1.1 ± 0.4
KMT003   1,118 ± 31 14C years   M   320,342   Q1a1   G1b   1 ± 1   1.1 ± 0.7

 

[asan-kaygy]

Цитата

Генетическая история Северной Азии, новые данные от Алтая до Приморья и Камчатки. (Текст читает А. Личман)
Ссылка: https://www.youtube.com/watch?v=NEkpu2UxLtg

Сибирь занимает значительную часть Евразии, от Урала до Тихого океана. А самая восточная часть региона, благодаря Берингии, связывала Евразию с Северной Америкой. Начиная с верхнего палеолита, на этой обширной территории жили и смешивались люди с различным генетическим происхождением. На сегодняшний день Саяно-Алтай представлен геномами людей со стоянок Афонтова гора верхнего палеолита, у современного Красноярска, возрастом около 17 тыс. лет. С предковой компонентой типичной для древних северных евразийцев (ANE) по аутосомному геному, которая в прошлом была широко распространена в тундростепи. Но после периода жизни представителей Афонтовой горы, не было информации о генетическом профиле людей, проживавших в пределах Алтайско-Саянской горной страны на протяжении почти 120 веков. Хотя в это время группы охотников-собирателей соседних регионов продемонстрировали различный предковый состав, что вызывает вопросы относительно их перемещений и связей. В частности, популяции Западной Сибири демонстрируют значительную долю аутосомной компоненты древних северных евразийцев (ANE), тогда как их современники из Восточной Сибири несли значительную долю компоненты древних северо-восточных азиатов (ANA), как у представителей неолита из пещеры Чёртовы Ворота в Приморье, возрастом около 6700 лет. Ранее, самое западное присутствие этой предковой компоненты было зарегистрировано в районе озера Байкал 7500 лет назад и в Центральной Монголии 5600 лет назад. И третья, палеосибирская аутосомная предковая компонента, была определена у древнего жителя Усть-Кяхты (UKY) Забайкалья, возрастом около 14 тыс. лет и у обитателя Дуванного Яра в низовьях реки Колыма (Kolyma_M), возрастом 9800 лет. Эта компонента связывает древних жителей Сибири с коренными американцами. Однако подробности того, как между собой взаимодействовали люди с этими отличающимися предковыми линиями и как они связаны с последующими популяциями Северной Азии до конца не ясны, поэтому любые новый данные вызывают большой интерес. В данной работе авторы получили полногеномные данные шести охотников-собирателей из четырех археологических памятников Саяно-Алтая, охватывающих период от 7,5 до 5,5 тыс. лет назад, а также охотника-собирателя из пещеры Летучая Мышь на Дальнем Востоке России, к северо-западу от Находки, возрастом 7 тыс. лет и трех менее древних обитателей Камчатки с некалиброванными датами, которые помещают их в интервал между XII и XVII веками нашей эры, точнее определить не позволяет эффект морского резервуара.

Источник: Ke Wang et al. Middle Holocene Siberian genomes reveal highly connected gene pools throughout North Asia // Current Biology. 2023. 33, 1–11.
DOI: https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0960982222018929