Samtat Опубликовано 26 апреля Опубликовано 26 апреля АНАЛИЗ ДРЕВНЕЙ ДНК СРЕДНЕВЕКОВОГО НАСЕЛЕНИЯ ВЕРХОВИЙ БОЛЬШОГО ЗЕЛЕНЧУКА (ПО МАТЕРИАЛАМ МОГИЛЬНИКА АРХЫЗ II) Джаубермезов Мурат Алиевич, к.б.н., с.н.с. кафедры генетики и фундаментальной медицины, Башкирский государственный университет, Уфа; Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение ФГБНУ Уфимского федерального исследовательского центра РАН, Уфа; Габидуллина Лилия Рафисовна, аспирант кафедры генетики и фундаментальной медицины, Башкирский государственный университет, Уфа; Кушнеревич Алёна Ивановна, к.б.н,, н.с. археогеномики Института геномики, Тартусский университет, Тарту, Эстония; Екомасова Наталья Вадимовна, к.б.н., доц. кафедры генетики и фундаментальной медицины, Башкирский государственный университет, Уфа; Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение ФГБНУ Уфимского федерального исследовательского центра РАН, Уфа Чагаров Онгар Салихович, м.н.с. Лаборатория контекстуальной антропологии Институт археологии РАН, Москва; Айбазов Ахмат Юсуфович, зав. Археологическим музеем, Карачаево-Черкесский государственный университет имени У.Д. Алиева, Карачаевск; Хуснутдинова Эльза Камилевна, д.б.н., проф., зав. кафедрой генетики и фундаментальной медицины, Башкирский государственный университет, Уфа; Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение ФГБНУ Уфимского федерального исследовательского центра РАН, Уфа; Тамбетс Кристина 3., проф., археогеномики Института геномики Тартуского университета, Тарту, Эстония Архыз II – христианский могильник XIII-XIV вв., расположен на западной окраине одноименного поселка. Отсутствие в могилах предметов бытового и культового назначения, осложнило определение археологическими методами хронологических рамок, в течение которых функционировал могильник. Однако радиоуглеродное датирование определило возраст останков как XIII-XIV вв. В данной работе проанализированы древние ДНК 10 человек из могильника Архыз II. Полевые археологические работы были проведены в 2019 году сотрудниками ИА РАН совместно с археологическим музеем КЧГУ. ДНК была извлечена из палеоантропологических материалов (зубы) 10 человек с последующим проведением полногеномного секвенирования с низкой глубиной охвата. Покрытие геномов составило 0,0034-0,146X (медианное покрытие 0,047X и содержание эндогенной ДНК 17,62%). По результатам генетического определения пола было выявлено 5 мужских и 5 женских индивидов. Разнообразие гаплогрупп Y-хромосомы представлено линиями гаплогрупп R1a, R1b и G, что свидетельствует о схожем паттерне распределения с современными популяциями Центрального и Западного Кавказа. Разнообразие гаплогрупп митохондриальной ДНК в изученных образцах показывает их гетерогенность и характеризуется наличием таких гаплогрупп как: D4, T2, U3, U4, U5, H, HV. Предварительный анализ позволяет сделать предположение о формиования населения аланской эпохи, при значительном участии автохтонных популяций Северного Кавказа, а также о схожем паттерне генетических маркеров средневекового и современного населения региона. Работа поддержана Министерством науки и высшего образования Российской Федерации (№ 075-03-2021-193/5), Российским фондом фундаментальных исследований (№ 19-04-01195) и Европейским Союзом через Европейский фонд регионального развития (№ 2014-2020.4.01.16-0125) https://elibrary.ru/download/elibrary_49872996_16172616.pdf
Samtat Опубликовано 26 апреля Опубликовано 26 апреля ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ОСТАНКОВ АЛАНСКОГО ПЕРИОДА С ТЕРРИТОРИИ СЕВЕРНОГО КАВКАЗА Джаубермезов М.А.1,2, Габидуллина Л.Р.1 , Екомасова Н.В. 1,2 , Чагаров О.С.3 , Атабиев Б.Х.4 , Хуснутдинова Э.К. 1,2 1Башкирский государственный университет, г. Уфа, Россия 2Институт биохимии и генетики УФИЦ РАН, г. Уфа, Россия 3Лаборатория контекстуальной антропологи ИА РАН, г. Москва, Россия 4Институт археологии Кавказа, г. Нальчик, Россия Раннее средневековье на территории Северного Предкавказья характеризуется появлением и активным участием в политической истории региона племени аланов. Генетическое родство аланов раннего Средневековья с последующими культурами, и в том числе с современным населением Европы и Кавказа еще досконально не изучено, полные геномные данные существуют только для 6 индивидов [1]. В данном исследовании мы проанализировали древнюю ДНК 19 человек из 3 разных археологических памятников, относящихся к аланской культуре III-X веков н.э., с территории Северного Кавказа (Российская Федерация). ДНК была извлечена из археологического материала (зубов и височных костей) 19 индивидов. Мы подготовили данные секвенирования полного генома Illumina с низким охватом для 19 человек и проанализировали их в контексте древней и современной генетической изменчивости региона. Охват геномов составил 0,0025-0,3000X (медиана покрытия 0,1041X, содержание эндогенной ДНК 36,66%). Радиоуглеродный анализ был проведен на 6 из 19 изученных образцов. Радиоуглеродное датирование практически соответствовало археологическому датированию. Разнообразие мтДНК аланов из изученных захоронений состояло из 7 различных гаплогрупп (K, T, U, H, X, HV, C), что напоминает палитру гаплогрупп у современных автохтонных народов Северного Кавказа. Гаплогруппы Y-хромосомы представлены различными линиями гаплогрупп E, G, J, Q и R, которые также характерны современному населению Северного Кавказа. Работа выполнена при финансовой поддержке гранта РНФ №22-24-00681 «Генетическая структура народов Северного Кавказа с III века и до наших дней», Государственного задания Министерства науки и высшего образования Российской Федерации № 075-03-2021-193/5, а также гранта Министерства науки и высшего образования № 075-15-2021-595. Литература 1. Damgaard et al. 2018, Nature https://doi.org/10.1038/s41586-018-0094-2. © Джаубермезов М.А., Габидуллина Л.Р., Екомасова Н.В., Чагаров О.С., Атабиев Б.Х., Хуснутдинова Э.К., 2022 г. https://confbsu.bashedu.ru/media/konference-117-publicaciya-pdf-be0987f2-9448-4b94-90c0-c7a49c5d762d-1-sbornik-tezisov-fmpe-2022-s-doi-257-324-10-68-13.pdf 1
Samtat Опубликовано 26 апреля Опубликовано 26 апреля АНАЛИЗ ДРЕВНЕЙ ДНК АЛАНСКОГО ПЕРИОДА С ТЕРРИТОРИИ СЕВЕРНОГО КАВКАЗА Джаубермезов М.А.1,2, Габидуллина Л.Р.1 , Екомасова Н.В.1,2 , Атабиев Б.Х.3 , Хуснутдинова Э.К.1,2 1Уфимский университет науки и технологий, г. Уфа, Россия 2Институт биохимии и генетики УФИЦ РАН, г. Уфа, Россия 3Институт археологии Кавказа, г. Нальчик, Россия Процесс формирования современной генетической картины Кавказа остается не до конца изученным, в особенности в период Средневековья. Генетическое родство аланов раннего Средневековья с современным населением Кавказа изучено только для 6 образцов аланской культуры, что не позволяет определить всю генетическую картину данного населения [1]. Материалом для исследования послужил палеоматериал в виде зубов 10 индивидуумов из могильников Кудахурт и Зарагиж (КабардиноБалкарская республика), принадлежащих аланскому периоду III-VII веков н.э. Для подтверждения датировки образцов был проведен радиоуглеродный для 4 из 10 изученных образцов. В исследовании было проведено полногеномное секвенирование с низкой глубиной охвата, покрытие составило 0,005-0,178X, и содержание эндогенной ДНК 10,9-71,6%. По результатам генетического определения пола было выявлено 1 женский и 9 мужских индивидов. Разнообразие гаплогрупп Y-хромосомы представлено в основном линиями гаплогрупп R1a, R1b и J1, что свидетельствует о схожем паттерне распределения с современными популяциями Северного Кавказа. Разнообразие гаплогрупп митохондриальной ДНК в изученных образцах показывает их гетерогенность и характеризуется наличием таких гаплогрупп как: C4, K1, T2, U1, U7, H, HV, X2. Предварительный анализ позволяет сделать предположение о формировании населения аланского периода, при значительном участии автохтонных популяций Северного Кавказа. Работа выполнена при финансовой поддержке гранта РНФ №22-24- 00681 «Генетическая структура народов Северного Кавказа с III века и до наших дней». Литература 1. Damgaard, P.d.B., Marchi, N., Rasmussen, S. et al. // Nature, 2018, v 557, pp. 369–374. стр.192 https://matem.anrb.ru/bsuconf/2023/tezisu.pdf 1
Samtat Опубликовано 28 апреля Опубликовано 28 апреля ....в ходе раскопок Среднего Зеленчукского храма X в. Комплексный анализ археологических и палеоантропологических данных позволил реконструировать некоторые обстоятельства жизни погребенного человека. Им оказался мужчина 25-29 лет. Травмы и морфологические особенности позволяют охарактеризовать его как профессионального воина. Этот человек много времени проводил в седле и участвовал в боевых столкновениях, одно из которых стало причиной его гибели. Результаты исследования палео-ДНК показали, что в геноме погребенного была обнаружена терминальная гаплогруппа G2a1a1a1a (Z6635). Выявленная митохондриальная гаплогруппа - H14b. На привилегированное социальное положение, которого достиг мужчина, говорит сам факт его погребения во внутреннем пространстве одного из главных столичных храмов Алании, где совершались захоронения членов семей высшей аланской знати, а также характер его травм и выявленные патологии, которые указывают на то, что у этого человека был доступ к довольно качественной медицинской помощи, позволившей ему сохранить дееспособность и высокую физическую активность. С большой долей вероятности можно полагать, что время его жизни относится ко второй половине X в. Археологический контекст свидетельствует о том, что на первоначальное решение о погребении воина в интерьере храма повлияли именно причины и обстоятельства его смерти, нежели принадлежность к правящему роду. https://www.elibrary.ru/item.asp?id=75256111 1
Samtat Опубликовано 28 апреля Опубликовано 28 апреля G2a1a1a1a (Z6635)https://www.yfull.com/tree/G-Z6692/ большая ветвь, география в основном Кавказ. Больше всего из современных представлены образцы карачаев Из палеообразцов ещё есть из Кабардино-Балкарии и Грузии,
Samtat Опубликовано 2 часа назад Опубликовано 2 часа назад Изучение древней ДНК населения Северного Кавказа в 4000 до н.э. – 1800 н.э. Джаубермезов М.1, 2*, Габидуллина Л.1, Екомасова Н.1, 2, Чагаров О.3, Атабиев Б.4, Коробов Д.5, Науменко В.6, Крутоголовенко К.7, Кадиева А.8, Прокофьев Р.9, Вольная Г.10, Кушнеревич А.11, Тамбетс К.11, Виллемс Р.11, Хуснутдинова Э.1, 2 1 Уфимский университет науки и технологий, Уфа, Россия 2 Институт биохимии и генетики УФИЦ РАН, Уфа, Россия 3 НИИ и Музей антропологии МГУ, Москва, Россия 4 Институт археологии Кавказа, Нальчик, Россия 5 Институт археологии РАН, Москва, Россия 6 Крымский федеральный университет им. В.И. Вернадского, Симферополь, Россия 7 Всероссийское общество охраны памятников истории и культуры, Краснодар, Россия 8 Государственный исторический музей, Москва, Россия 9 ООО «Ростовская археологическая экспедиция», Ростов-на-Дону, Россия 10 Институт истории и археологии, Владикавказ, Россия 11 Институт геномики Тартуского университета, Тарту, Эстония * murat-kbr@mail.ru Мотивация и цель: Кавказ – преимущественно горный регион на границе Восточной Европы и Ближнего Востока. Растянувшись на более чем 1000 км между Черным и Каспийским морями, он тем не менее всегда оставался полупроницаемым для движущихся потоков древних культур [1, 2]. Располагаясь на стыке Европы и Азии, территория Кавказа на протяжении тысячелетий была связующим звеном между культурами Месопотамии, Ирана, Малой Азии, Средиземноморья и Восточной Европы [3], что приводило к взаимному влиянию как на культурный облик, так и на генофонд населения [4]. Учитывая особую ценность изучения археогеномики древнего населения данного региона, следует отметить, что до сих пор не освещены длительные исторические периоды истории Кавказа. В особенности это касается эпохи позднего бронзового века (конец II –начало I тыс. до н.э.) и отрезка от раннего Средневековья до периода Нового времени (V в. н.э. – начало XX в. н.э.).Методы и алгоритмы: ДНК была извлечена из археологических материалов(зубы, височная кость, слуховые косточки) 100 человек с последующим проведением полногеномного секвенирования с низкой глубиной охвата и анализом их в контексте древних и современных генетических вариаций как изучаемого, так и близлежащих регионов. Покрытие геномов составило 0.0001–0.300X (медианное покрытие 0.0911X, содержание эндогенной ДНК 30.16 %). Результаты: Радиоуглеродный анализ проведен для 31 из 100 исследованных образцов. За исключением единичных образцов, радиоуглеродное датирование практически соответствовало археологическому. Палитра гаплогрупп мтДНК как населения поздней бронзы, так и Средневековья, состоящая из 15 различных гаплогрупп (A, C, D, F, H, HV, I, J, K, M, N, T, U, W, X), схожа с разнообразием гаплогрупп мтДНК современных автохтонных популяций Кавказа. Разнообразие гаплогрупп Y-хромосомы алан, состоящих из 6 различных гаплогрупп (E, G, I, J,Q и R), схоже с палитрой современных автохтонных популяций Северного Кавказа только на поздней стадии развития аланской культуры. Вызывает интерес,что гаплогруппы Y-хромосомы средневековых балкарцев (у 10 из 11 индивидов определены линии гаплогруппы R) разительным образом отличаются от разнообразия гаплогрупп, выявленных у средневековых осетин (гаплогруппа G определена у 6 из 8 образцов), однако близки с таковым у степных культур, что может указывать на различные процессы этногенеза для соседних популяций. PCA-анализ указывает на существенную генетическую однородность всего разнообразия представленных в работе культур, а также на их сходство с современными популяциями Кавказа. Лишь единичные индивиды выбиваются из «кавказского» кластера, демонстрируя примесь центральноазиатского, восточно-азиатского или европейского компонентов. Выводы: Полученные результаты подтверждают теорию кавказского происхождения кобанской культуры поздней бронзы. Предварительный анализ позволяет предположить существование тесных контактов сарматов и алан с населением Северного Кавказа. Финансирование: Исследование выполнено в рамках государственного задания Министерства науки и высшего образования РФ (№ 075-03-2024-123/1). стр.742 https://bgrssb.icgbio.ru/2024/wp-content/uploads/sites/4/2024/09/BGRSSB_2024_Abstracts.pd
Samtat Опубликовано 2 часа назад Опубликовано 2 часа назад Изучение древней ДНК населения Северного Кавказа бронзового и железного веков Габидуллина Л.1*, Джаубермезов М.1, 2, Екомасова Н.1, 2, Чагаров О.3, 4, Атабиев Б.5, Кадиева А.6, Кушнеревич А.7, Тамбетс К.7, Виллемс Р.7, Хуснутдинова Э.1, 2 1 Уфимский университет науки и технологий, Уфа, Россия 2 Институт биохимии и генетики УФИЦ РАН, Уфа, Россия 3 НИИ и Музей антропологии МГУ, Москва, Россия 4 Институт археологии РАН, Москва, Россия 5 Институт археологии Кавказа, Нальчик, Россия 6 Государственный исторический музей, Москва, Россия 7 Институт геномики Тартуского университета, Тарту, Эстония * liliya.gab@gmail.com Мотивация и цель: Географической особенностью Северного Кавказа является его расположение на границе Европы и Передней Азии, что вместе с соседством с Причерноморьем и Поволжьем послужило формированию миграционных и торговых путей, связавших Ближний Восток и Европу в различные исторические периоды, что в свою очередь отразилось на этногенезе народов региона. Формирование генетической структуры народов Северного Кавказа в большей степени протекало до начала выделения этнических групп в период бронзового и железного веков. В бронзовом веке на территории Кавказа развивались несколько археологических культур: майкопская, кура-аракская, северокавказская и завершающая период кобанская, во времена которой население уже было знакомо с железом, что говорит о начале перехода от бронзового к железному веку [1, 2]. В период железного века происходили повсеместные миграции на территории степной и горно-долинной Евразии, что отразилось на генофондах популяций [3]. В связи со сложными процессами этногенеза популяций на территории Северного Кавказа имеется вопрос о предковых компонентах в их генофондах –преемственности от древних археологических культур региона. Для решения данной задачи проводится исследование древней ДНК культур бронзового и железного века с территории Северного Кавказа. Методы и алгоритмы: Для исследования был отобран палеоматериал в виде зубов 28 представителей майкопской, кобанской, сарматской и гуннской археологических культур. Информация о принадлежности образцов к определенной культуре и о возрасте исследуемых образцов первоначально была предоставлена археологами. Для подтверждения принадлежности исследуемых образцов к изучаемому временному периоду было проведено датирование методом радиоуглеродного анализа, всего таким образом было исследовано 10 образцов. Древняя ДНК выделялась из зубов, с дальнейшим созданием ДНК библиотек для NGS секвенирования на платформе Illumina HiSeq. В результате биоинформатического анализа данных NGS секвенирования были вычислены BGRS/SB-показатели содержания эндогенной ДНК (среднее 32.15 %), уровни контаминации(<3 % 23 образца, 4–17 % 5 образцов) и степени повреждений древней ДНК поC>T заменам (8–27 %). Определен генетический пол исследуемых образцов –11 женщин и 17 мужчин, а также по результатам метода READ исключены родственники из дальнейшего анализа (1 образец). Были определены гаплогруппы митохондриальной ДНК и Y-хромосомы. Для анализа полногеномных данных проводились PCA и ADMIXTURE с использованием набора данных “1240K+HO” лаборатории Dr David Reich, при этом 5 образцов из исследуемой выборки были исключены из анализа из-за низкого количества определенных SNP(<10 000 SNP) [4]. Результаты: Гаплогруппы митохондриальной ДНК образцов исследуемых археологических культур бронзового и железного веков представлены в основном западноевразийскими линиями гаплогрупп H, I, J, T, U, X (82.1 %). Восточно-евразийские линии представлены ветвями гаплогрупп A, C, M (17.9 %). Среди гаплогрупп Y-хромосомы образцов бронзового и железного века преобладают переднеазиатские линии гаплогрупп G2 и J Y-хромосомы, встречаются также единичные носители гаплогруппы R1b, ранее выявленной у представителей степных культур. Образцы всех исследуемых археологических культурбронзового и железного веков по данным PCA анализа кластеризуются в основном с современными популяциями Кавказа и Ближнего Востока. По результатам ADMIXTURE анализа кавказский компонент является основным у большинства исследуемых образцов. Данные, полученные методами PCA и ADMIXTURE, соответствуют определенным нами гаплогруппам однородительских маркеров. Выводы: Полученные результаты демонстрируют высокие показатели ряда предковых компонентов в генофондах археологических культур Северного Кавказа, что отражает сложные пути этногенеза в регионе в период бронзового и железного веков. Финансирование: Исследование выполнено в рамках государственного задания Министерства науки и высшего образования РФ (№ 075-03-2024-123/1). стр.738 https://bgrssb.icgbio.ru/2024/wp-content/uploads/sites/4/2024/09/BGRSSB_2024_Abstracts.pd
Samtat Опубликовано 2 часа назад Опубликовано 2 часа назад Две публикации с конференции 2024 года одной работы, одного гранта . Авторы те же, только поменяли местами. Интересно, была уже официальная научная статья?
